单倍群

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分子进化英语molecular evolution的研究中,单倍群(Haplogroup)是一组类似的单倍型英语Haplotype(Haplotype),它们有一个共同的单核苷酸多态性祖先。因为单倍群由相似的单倍型组成,所以可以从单倍型来预测单倍群。单核苷酸多态性试验被用来确认单倍型。单倍群以字母来标记,并且以数字和一些字母来做补充,例如O3e1. Y染色体和线粒体单倍群有不同的单倍群标记方法。单倍群可用来标记数千年前的祖先来源。[1]

人类遗传学英语human genetics中,最常被拿來研究的单倍群是Y染色体(Y-DNA)单倍群线粒体DNA(mtDNA)单倍群,这两个都可以被用来定义遗传群体。Y染色体脱氧核糖核酸单倍群仅能以父系遗传,同时mtDNA仅能以母系遗传[註 1]

基于遗传标记的人类单倍型分类,特别是借助唯一事件多樣性英语Unique event polymorphism(UEPs),在过去几年中快速发展着。

单倍群群体遗传学[编辑]

一般被认为对于某个存活到现在的特定单倍型突变自然选择并不存在偏好与否,所以除去突变率(其会根据不同的标记而变化)群体遗传学中主要影响单倍群比例的原因是遗传漂变

人類Y染色體DNA單倍型類群[编辑]

人類Y染色體DNA(Y-DNA)單倍型類群被命名為A到T,其中部分被更進一步以數字及小寫拉丁字母細分。主Y染色體單倍型類群編號的設計係由Y染色體協會建立。[2]

人类Y染色体DNA单倍型类群进化树

Y染色体最近共同祖先
A
A1b A1a-T
A1a A2-T
A2 A3 BT
B CT
DE CF
D E C F
G H IJK
IJ K
I J LT K(xLT)
L T M NO P S
O N Q R

各族群Y染色体单倍型类群 · 著名的Y染色體單倍型類群人

Y染色體亞當是由研究人員命名,用來指稱人類父系的最近共同祖先。主要的Y染色體單倍群及其在前歐洲殖民地發生狀況的地理分佈如下:

全球前殖民地各族群主要的Y染色體單倍群及其依據海岸遷移模型的可能遷移路線

無M168突變族群[编辑]

有M168突變族群[编辑]

M168突變發生於約公元前5萬年。

  • 單倍群C(M130):大洋洲、北/中/東亞、北美洲,僅略微存在於南美洲、南亞、西亞及歐洲
  • 單倍群F(M89):大洋洲、歐洲、亞洲、美洲
  • YAP+單倍群

有M89突變族群[编辑]

M89突變發生於約公元前4萬5千年。

  • 單倍群F(P14, M213):南印度、斯里蘭卡、中國、韓國
  • 單倍群G(M201):出現在歐亞大陸的許多族群,但比率不高;最常見於高加索、伊朗高原及安那托利亞;在歐洲主要分佈於希臘、義大利、伊比利、提洛、波希米亞;在北歐則極為罕見
  • 單倍群H(M69):南印度、斯里蘭卡、尼泊爾、巴基斯坦、伊朗、中亞及阿拉伯

有L15及L16突變族群[编辑]

有M9突變族群[编辑]

M9突變發生於約公元前4萬年。

  • 單倍群K
    • 單倍群LT(L298/P326)
      • 單倍群L(M11, M20, M22, M61, M185, M295):南亞、中亞、西南亞、地中海地區
      • 單倍群T(M70, M184/USP9Y+3178, M193, M272):北非、非洲之角、西南亞、地中海地區、南亞,以往稱為單倍群K2
    • 單倍群K(xLT)(rs2033003/M526)
有M526突變族群[编辑]

人類粒線體DNA單倍體群[编辑]

人類粒線體DNA單倍體群被標為不同字母: A, B, C, CZ, D, E, F, G, H, pre-HV, HV, I, J, pre-JT, JT, K, L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, L7, M, N, O, P, Q, R, S, T, U, UK, V, W, X, Y, and Z.

人類粒線體DNA單倍體群

  最近的共同粒線體祖先    
L0   L1  
L2 L3   L4 L5 L6 L7
  M N  
CZ D E G Q   A I O   R   S W X Y
C Z B F pre-HV   pre-JT P  UK
HV JT U K
H V J T

定義群體[编辑]

人類單倍型遷移地圖

單倍群可以用來定義遺傳學群體和地理分佈。例如,以下是mtDNA單倍群一般性區域分佈:

  • 非洲人:L0、L1、L2、L3、L4、L5、L6
  • 西部歐亞人:H、T、U、V、X、K、I、J、W
  • 東部歐亞人:A、B、C、D、E、F、G、Y、Z
  • 美洲原住民:A、B、C、D、X
  • 澳洲-美拉尼西亞人:P、Q、S

線粒體單倍群分為3群,以3個連續的字母L、M、N表示。人類第一次在群內分離成L0和L1-6。L1-6隨後引伸出其他群,其中的L3分離成M和N群。M群組成包括人類第一波由離開非洲,順著南部沿海地區向東的大遷移​​路線。

Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群的相同之處[编辑]

以下是Y染色體DNA單倍型類群和粒線體DNA單倍體群大約的相同之處:

Y-DNA單倍群 mtDNA單倍 地理分佈/族群
A L0 東非及南非
B L1、L4 東非及中非
E L2、L3 非洲
D、O、N、C3 CZ/C/Z, D, G (M型); A, N9/Y (N型); B, F (R型) 東亞、西伯利亞
K、M (M9-正、M45-負) B、P (R型); N; Q (M型) 以及大洋洲的特定M分支 大洋洲
R、I、T、J、E (V13, M81, 及M123型) R0, HV/H/V, JT/J/T, U/K (R types) 南亞、歐洲、西亞、北非、非洲之角
Q、C3 A、X (N型); C、D (M型) 西伯利亞極東端、美洲

參看[编辑]

註釋[编辑]

  1. ^ 所謂父系或母系遺傳是指說其後代能夠接受誰的基因。如果是父系遺傳,則他們的子代只會接受父親的基因,反之亦然。

參考文獻[编辑]

  1. ^ The International Society of Genetic Genealogy see Haplogroup definition in DNA-NEWBIE GLOSSARY [1]
  2. ^ Y Chromosome Consortium
  3. ^ http://www.familytreedna.com/pdf/DNA.RootsiHaplogroupISpread.pdf

外部連結[编辑]

一般資料[编辑]

新聞[编辑]

所有單倍體群[编辑]

Y染色體DNA單倍型類群[编辑]

粒線體DNA單倍體群[编辑]