结构基因组学

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蛋白质资料库中一个蛋白质结构的例子。

結構基因組學是一門用结构生物学方法研究整个生物体、整个细胞或整个基因组中所有的蛋白質和相关蛋白質复合物的三维結構的学科。主要利用實驗方式(X射線晶體学核磁共振譜学电子显微学)来测定蛋白质结构,同时结合同源建模(homology modelling)这一計算方式来推测蛋白质结构。和傳統結構生物學不同的是,利用結構基因組學所測定的蛋白質結構通常是功能未知的蛋白質。這令科學家創立了結構生物信息學,利用三維結構信息來预测蛋白質功能。結構基因組學重視快速、高通量(high throughput)的蛋白質結構測定,而同步辐射装置是实现这一目标的重要实验装置之一。

重大计划[编辑]

  • 蛋白质结构启动计划(Protein Structure Initiative, PSI):1999年由美国国家卫生研究院发起,在美国设立了九个结构基因组研究中心,目标是十年(2001年-2010年)解析10000个蛋白质的三维结构,目前第一期计划已结束,并于2006年开始第二期(PSI-2)。
  • 欧洲结构蛋白质组计划(Structural Proteomics in Europe, SPINE):2002年启动,第一轮计划(2002年-2006年)由欧盟第五框架计划资助,共完成了308个新的蛋白质结构的测定;第二轮计划(SPINE2-Complexes)由第六框架计划资助,致力于解析蛋白质复合物的三维结构。
  • 蛋白质3000计划:2002年由日本文部科学省启动,目标是了解3000个与新药开发相关蛋白质的结构和功能。
  • 中国结构基因组计划:2002年由中科院启动,第一轮为“造血干细胞及血液系统疾病相关蛋白质的结构基因组学研究”,由中国科学技术大学牵头,中科院生物物理研究所、上海生命科学研究院参加;作为“人类肝脏蛋白质组计划”的重要组成部分,第二轮计划于2005年开始,在中科院生物物理研究所、中科院上海生命科学院、中国科学技术大学、清华大学北京大学开展研究。

国际会议[编辑]

结构基因组学国际会议(International Conference on Structural Genomics),自2000年起,每两年一届。各届的时间和举办地点如下:

第一届,2000年, 日本横滨

第二届,2002年, 德國柏林

第三届,2004年, 美國华盛顿特区

第四届,2006年, 中国北京

参考资料[编辑]

  1. Service, R. Structural Genomics, Round 2, Science, 307:1554 - 1558, 2005
  2. 《2007科学发展报告》,中国科学院编,科学出版社出版,2007年3月
  3. 中国科学院知识创新工程试点工作简报,中国科学院办公厅,第188期,2004年10月8日

外部链接[编辑]