葉綠素在經過加酸或加熱或脫鎂作用後會變成脫鎂葉綠素(英语:Pheophytin,大陆也成为褐藻素)顏色也會改變。在水污染的地方,會造成浮游植物細胞破碎死亡時,其原本所含的葉綠素也跟著被破壞,而轉變成脫鎂葉綠素。因此脫鎂葉綠素的含量比例可以作為水質的指標之一。