蛋白質資料庫

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蛋白質資料庫
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蛋白質資料庫Protein Data Bank,简称PDB)是一個專門收錄蛋白質核酸三維結構資料的数据庫。這些資料和數據一般是世界各地的结构生物学家經由X射線晶體學NMR光譜學實驗所得,並釋放到公有領域供公众免費使用。

以下内容来自对英文wiki中PDB总论和历史部分的人工翻译:

蛋白质数据库Protein Data Bank(PDB)是一个蛋白质、核酸等生物大分子的结构数据的数据库,由Worldwide Protein Data Bank监管。PDB可以经由网络免费访问,是结构生物学研究中的重要资源。为了确保PDB资料的完备与权威,各个主要的科学杂志、基金组织会要求科学家将自己的研究成果提交给PDB。在PDB的基础上,还发展出来若干依据不同原则对PDB结构数据进行分类的数据库,例如GO将PDB中的数据按基因进行了分类。

Protein Data Bank(PDB)的历史可以追溯到1971年,当时Brookhaven国家实验室的Walter Hamilton决定在Brookhaven建立这个数据库。1973年Hamilton去世后,Tom Koeztle接管了PDB。1994年1月,Joel Sussman被任命为PDB负责人。在1998年10月,PDB被移交给了Research Collaboratory for Structural Bioinfor-matics(RCSB),并与1999年6月移交完毕,新的负责人是Rutgers大学(RCSB成员)的Helen M. Berman。2003年,PDB作为wwPDB的核心,成为了一个国际性组织。同时,wwPDB的其他成员,包括PDBe、PDBj、BMRB,也为PDB提供了数据积累、处理和发布的中心。值得一提的是,虽然PDB的数据是由世界各地的科学家提交的,但每条提交的数据都会经过wwPDB工作人员的审核与注解,并检验数据是否合理。PDB及其提供的软件现在对公众免费开放。

以下为PDB成员网站[编辑]

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