计算生物学

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计算生物学Computational Biology)是生物学的一个分支。根据美国国家卫生研究所(NIH)的定义,它是指开发和应用数据分析及理论的方法、数学建模和计算机仿真技术,用于生物学、行为学和社会群体系统的研究的一门学科。

学科历史[编辑]

主要研究内容[编辑]

生物序列的片断拼接[编辑]

序列比对[编辑]

序列比对所研究的基本问题是两个或多个序列间的相似性。序列比对是计算生物学的基本问题之一。对序列的两两比对,已经有了基于动态规划的较成熟的算法以及建立在此基础上的软件包BLASTFASTA。对于两个序列的局部比对问题,可以用Smith-Waterman算法来解决。多重序列的比对目前还缺乏快速并且十分有效的算法。

基因识别[编辑]

进化树的构造[编辑]

蛋白质结构预测[编辑]

应用[编辑]

生物信息学的区别与聯繫[编辑]

某些人将计算生物学作为生物信息学的同义词处理;但是另外一些人认为计算生物学和生物信息学应当被作为不同的条目处理,因为生物信息学主要侧重于对生物学中所得信息的采集、存贮、分析处理与可视化方面,而计算生物学主要侧重于使用计算技术对生物学问题进行研究方面。

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