长链非编码RNA数据库

维基百科,自由的百科全书
跳转至: 导航搜索

长链非编码RNA数据库,又称长链间隔区非编码RNA數據庫lncRNA數據庫,是收集了非编码RNA及其相关表达模式的数据库。长链非编码RNA是当前生物学和医学研究的前沿领域和热点[1][2]

例子[编辑]

数据库名 描述 类型 网站链接 参考文献
ChIPBase 对长链非编码RNA的表达图谱和转录调控提供全面的注释和鉴定 数据库 [1] [3]
LNCipedia 用于注释人类的长链非编码RNA的序列和结构 数据库 [2] [4]
lncRNAdb 对功能的长链非编码RNA提供全面的注释 数据库 [3] [5]
NONCODE 对长链非编码RNA提供综合的注释 数据库 [4] [6]
NRED 对长链非编码RNA的表达注释 数据库 [5] [7]

参考资料[编辑]

  1. ^ Rinn, J. L.; Chang, H. Y. Genome Regulation by Long Noncoding RNAs. Annual Review of Biochemistry. 2012, 81: 145–166. doi:10.1146/annurev-biochem-051410-092902. PMID 22663078.  编辑
  2. ^ Martin, L.; Chang, H. Y. Uncovering the role of genomic "dark matter" in human disease. Journal of Clinical Investigation. 2012, 122 (5): 1589–1595. doi:10.1172/JCI60020. PMC 3336981. PMID 22546862.  编辑
  3. ^ Yang, J. -H.; Li, J. -H.; Jiang, S.; Zhou, H.; Qu, L. -H. ChIPBase: A database for decoding the transcriptional regulation of long non-coding RNA and microRNA genes from ChIP-Seq data. Nucleic Acids Research. 2012. doi:10.1093/nar/gks1060. PMID 23161675.  编辑
  4. ^ Volders, P. -J.; Helsens, K.; Wang, X.; Menten, B.; Martens, L.; Gevaert, K.; Vandesompele, J.; Mestdagh, P. LNCipedia: A database for annotated human lncRNA transcript sequences and structures. Nucleic Acids Research. 2012. doi:10.1093/nar/gks915. PMID 23042674.  编辑
  5. ^ Amaral, P. P.; Clark, M. B.; Gascoigne, D. K.; Dinger, M. E.; Mattick, J. S. LncRNAdb: A reference database for long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research. 2010, 39 (Database issue): D146–D151. doi:10.1093/nar/gkq1138. PMC 3013714. PMID 21112873.  编辑
  6. ^ Bu, D.; Yu, K.; Sun, S.; Xie, C.; Skogerbo, G.; Miao, R.; Xiao, H.; Liao, Q.; Luo, H. NONCODE v3.0: Integrative annotation of long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research. 2011, 40 (Database issue): D210–D215. doi:10.1093/nar/gkr1175. PMC 3245065. PMID 22135294.  编辑
  7. ^ Dinger, M. E.; Pang, K. C.; Mercer, T. R.; Crowe, M. L.; Grimmond, S. M.; Mattick, J. S. NRED: A database of long noncoding RNA expression. Nucleic Acids Research. 2009, 37 (Database issue): D122–D126. doi:10.1093/nar/gkn617. PMC 2686506. PMID 18829717.  编辑