開放閱讀框架
维基百科,自由的百科全书
開放閱讀框架(英語:Open reading frame;縮寫:ORF;其他譯名:開放閱讀框、開放讀架等)是生物個體的基因組中,可能是蛋白質編碼序列的部分。基因中的ORF包含並位於開始編碼與終止編碼之間。由於一段DNA或RNA序列有多種不同讀取方式,因此可能同時存在許多不同的開放閱讀框架。有一些電腦程式可分析出最可能是蛋白質編碼的序列。
[编辑] 例子
一段5'-UCUAAAGGUCCA-3'序列。此序列共有3種讀取法:
- UCU AAA GGU CCA
- CUA AAG GUC
- UAA AGG UCA
由於UAA為終止編碼,因此第三種讀取法不具編譯出蛋白質的潛力,故只有前兩者為開放閱讀框架。
[编辑] 參見
[编辑] 外部連結
- Translation and Open Reading Frames - A Site explaining Open Reading Frames
- NCBI ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences.
- ORF finder - A web based interactive tool for predicting and analysing ORFs from nucleotide sequences - hosted at bioinformatics.org
- Sequerome - A Sequence profiling tool that links each BLAST record to the NCBI ORF enabling complete ORF analysis of a BLAST report

