ENCODE

维基百科,自由的百科全书
跳转至: 导航搜索
ENCODE
File:ENCODE logo.png
内容
相關信息
研究中心 聖塔克魯茲加利福尼亞大學
实验室 分子生物科學及工程中心
創始人 Brian J Raney[1]
发布日期 2010年
访问入口
网站 encodeproject.org
工具
其他

DNA元件百科全书英语Encyclopedia of DNA Elements,简称为ENCODE计划)是一个由美国国家人类基因组研究所在2003年9月发起的一项公共联合研究项目[2],旨在找出人类基因组中所有功能组件[1][3][4][5]。这是既完成人类基因组计划后国家人类基因组研究所开始的最重要的项目之一。所有在该项目中产生的数据都会被迅速的在公共数据库中公开。

2012年9月5日,该项目的初步结果被整理为30篇论文并发表于《自然》、《基因组生物学》及《基因组研究》中[6][7]。这些发表的论文显示人类基因组内的非编码DNA至少80%是有生物活性的,而非像之前认为的仅仅是“垃圾”。这个结果非常重要,因为人类基因组中98%的DNA是非编码的,意味着它们并不直接编码任何蛋白质序列。

参考文献[编辑]

  1. ^ 1.0 1.1 Raney BJ, Cline MS, Rosenbloom KR, Dreszer TR, Learned K, Barber GP, Meyer LR, Sloan CA, Malladi VS, Roskin KM, Suh BB, Hinrichs AS, Clawson H, Zweig AS, Kirkup V, Fujita PA, Rhead B, Smith KE, Pohl A, Kuhn RM, Karolchik D, Haussler D, Kent, WJ. ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update). Nucleic Acids Res. 2011-01, 39 (Database issue): D871–5. doi:10.1093/nar/gkq1017. PMC 3013645. PMID 21037257. 
  2. ^ Maher B. ENCODE: The human encyclopaedia. Nature. 2012, 489 (7414): 46–48. doi:10.1038/489046a. 
  3. ^ ENCODE Project Consortium. A User's Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE). (编) Becker PB. PLoS Biology. 2011, 9 (4): e1001046. doi:10.1371/journal.pbio.1001046. PMC 3079585. PMID 21526222.  编辑
  4. ^ ENCODE Project Consortium, Birney E, Stamatoyannopoulos JA, Dutta A, Guigó R, Gingeras TR, Margulies EH, Weng Z, Snyder M, Dermitzakis ET, et al.. Identification and analysis of functional elements in 1% of the human genome by the ENCODE pilot project. Nature. 2007, 447 (7146): 799–816. Bibcode:2007Natur.447..799B. doi:10.1038/nature05874. PMC 2212820. PMID 17571346.  编辑
  5. ^ Guigó R, Flicek P, Abril JF, Reymond A, Lagarde J, Denoeud F, Antonarakis S, Ashburner M, Bajic VB, Birney E, Castelo R, Eyras E, Ucla C, Gingeras TR, Harrow J, Hubbard T, Lewis SE, Reese MG. EGASP: The human ENCODE Genome Annotation Assessment Project. Genome Biology. 2006, 7: S2. doi:10.1186/gb-2006-7-s1-s2. PMC 1810551. PMID 16925836.  编辑
  6. ^ ENCODE project at UCSC. ENCODE Consortium. [2012-09-05]. 
  7. ^ Walsh, Fergus. Detailed map of genome function. BBC News. 2012-09-05 [2012-09-06]. (原始内容存档于2012-09-06). 

外部链接[编辑]