Template:转录因子与细胞内受体

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转录因子与细胞内受体

（1）基本区域

（1.1）基本亮氨酸拉链（bZIP）	转录激活因子（AATF、1、2、3、4、5、6、7） · AP-1（c-Fos、FOSB、FOSL1、FOSL2、c-Jun、JUNB、JUND） · BACH（1、2） · BATF · BLZF1 · C/EBP（α、β、γ、δ、ε、ζ） · CREB（1、3、L1） · CREM · DBP · DDIT3 · GABPA · HLF · MAF（B、F、G、K） · NFE（2、L1、L2、L3） · NFIL3 · NRL · NRF（1、2、3） · XBP1

（1.2） Basic helix-loop-helix（bHLH）	ATOH1 · AhR · AHRR · ARNT · ASCL1 · BHLHB2 · BMAL（ARNTL、ARNTL2） · CLOCK · EPAS1 · HAND（1、2） · HES（5、6） · HEY（1、2、L） · HES1 · HIF（1A、3A） · ID（1、2、3、4） · LYL1 · MXD4 · MYCL1 · MYCN · Myogenic regulatory factors（MyoD、Myogenin、MYF5、MYF6） · Neurogenins（1、2、3） · NeuroD（1、2） · NPAS（1、2、3） · OLIG（1、2） · Pho4 · Scleraxis · TAL（1、2） · Twist · USF1

（1.3） bHLH-ZIP	AP-4 · MAX · MITF · MNT · MLX · MXI1 · Myc · SREBP（1、2）

（1.4） NF-1	NFI（A、B、C、X） · SMAD（R-SMAD（1、2、3、5、9） - I-SMAD（6、7） - 4）

（1.5） RF-X	RFX（1、2、3、4、5、ANK）

（1.6） Basic helix-span-helix（bHSH）	AP-2（α、β、γ、δ、ε）

（2）锌指结构DNA作用区域

（2.1）核受体（Cys₄）	第一亚族：甲状腺激素受体（α、β）、CAR、FXR、LXR（α、β）、PPAR（α、β/δ、γ）、PXR、RAR（α、β、γ）、ROR（α、β、γ）、Rev-ErbA（α、β）、VDR 第二亚族（COUP-TF（I、II）、Ear-2、HNF4（α、γ）、PNR、RXR（α、β、γ）、Testicular receptor（2、4）、TLX）第三亚族（Steroid hormone（Androgen、Estrogen（α、β）、Glucocorticoid、Mineralocorticoid、Progesterone）、Estrogen related（α、β、γ））第四亚族NUR（NGFIB、NOR1、NURR1） · 第五亚族LRH-1、SF1 · 第六亚族GCNF · 第零亚族DAX1、SHP

（2.2）其他的Cys₄结构	GATA（1、2、3、4、5、6） · MTA（1、2、3） · TRPS1

（2.3） Cys₂His₂	通用转录因子s（TFIIA、TFIIB、TFIID、TFIIE、TFIIF（1、2）、TFIIH（1、2、4、2I、3A、3C1、3C2）） ATBF1 · BCL（6、11A、11B） · CTCF · E4F1 · EGR（2、3） · ERV3 · GFI1 · GLI-Krüppel family（1、2、3、REST、S2、YY1） · HIC（1、2） · HIVEP（1、2、3） · IKZF（1、2、3） · ILF（2、3） · KLF（2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、17） · MTF1 · MYT1 · OSR1 · SP（1、2、4、7） · WT1 · Zbtb7（7A、7B） · ZBTB（16、17、20、32、33、40） · zinc finger（3、7、9、10、19、22、24、33B、34、35、41、43、44、51、74、143、146、148、165、202、217、219、238、239、259、267、268、281、295、318、330、346、350、365、366、384、423、451、452、471、593、638、649、655）

（2.4） Cys₆	HIVEP1

（2.5） Alternating composition	AIRE · DIDO1 · GRLF1 · ING（1、2、4） · JARID（1A、1B、1C、1D、2） · JMJD1B

（3）螺旋-转角-螺旋作用域

（3.1）同源异型域	ARX · CDX（1、2） · CRX · CUTL1 · DBX（1、2） · DLX（3、4、5） · EMX2 · EN（1、2） · FHL（1、2、3） · HESX1 · HHEX · HLX · 同源框（A1、A2、A3、A4、A5、A7、A9、A10、A11、A13、B1、B2、B3、B4、B5、B6、B7、B8、B9、B13、C4、C5、C6、C8、C9、C10、C11、C13、D1、D3、D4、D8、D9、D10、D11、D12、D13） · HOPX · IRX（1、2、3、4、5、6、MKX） · LMX（1A、1B） · MEIS（1、2） · MEOX2 · MNX1 · MSX（1、2） · NANOG · NKX（2-1、2-2、2-3、2-5、3-1、3-2、6-1、6-2） · PBX（1、2、3） · PHF（1、3、6、8、10、16、17、20、21A） · PITX（1、2、3） · POU domain（PIT-1、BRN-3: A、B、C、Octamer transcription factor: 1、2、3/4、6、7、11） · OTX（1、2） · PDX1 · ZEB（1、2）

（3.2） Paired box	PAX（1、2、3、4、5、6、7、8、9）

（3.3） Fork head / winged helix	E2F（1、2、3、4、5） · FOX proteins（C1、C2、D3、E1、G1、H1、K2、L2、M1、N3、O1、O3、O4、P1、P2、P3）

（3.4） Heat Shock Factors	HSF（1、2、4）

（3.5） Tryptophan clusters	ELF（2、4、5） · EGF · ELK（1、3、4） · ERF · ERG · ETS（1、2、SPIB） · ETV（1、4、5、6） · FLI1 · Interferon regulatory factors（1、2、3、4、5、6、7、8） · MYB · MYBL2

（3.6） TEA domain	transcriptional enhancer factor（1、2、3、4）

（4） β-Scaffold factors with minor groove contacts

（4.1） Rel homology region	NF-κB（NFKB1、NFKB2、REL、RELA、RELB） · NFAT（C1、C2、C3、C4、5）

（4.2） STAT	STAT（1、2、3、4、5、6）

（4.3） p53	p53 · TBX（1、2、3、5、19、21、22、Brachyury、TBR1）

（4.4） MADS box	Mef2（A、B、C、D） · SRF

（4.6） TATA结合蛋白	TATA结合蛋白 · TBPL1

（4.7）高迁移率组	HMGB（1、2、3） · HNF（1A、1B） · LEF1 · SOX（1、2、3、4、5、6、8、9、10、11、12、13、14、15、18、21） · SRY · SSRP1 · TCF（3、4） · TOX（1、2、3、4）

（4.10） Cold-shock domain	CSDA、YBX1

（4.11） Runt	CBF（CBFA2T2、CBFA2T3、RUNX1、RUNX2、RUNX3、RUNX1T1）

（0）其他转录因子

（0.2） HMGI（Y）	HMGA（1、2） · HBP1

（0.3） Pocket domain	Rb · RBL1 · RBL2

（0.5） AP-2/EREBP-related factors	Apetala 2 · EREBP · B3

（0.6） Miscellaneous	ARID（1A、1B、2、3A、3B、4A） · CAP · IFI（16、35） · MLL（2、3、T1） · MNDA · NFY（A、B、C） · Rho/Sigma

see also transcription factor/coregulator deficiencies

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