初古菌門(学名:Korarchaeota),名称来自希腊语中的名词“koros”或“kore”,意思是“年轻男子”或“年轻女子”,以及“古老的”“archaios”,中文译为“初古菌”。初古菌門是通過16S rRNA序列區分開的一類古菌,來源於美國黃石公園超熱環境中的樣品。通過熒光原位雜交能夠確認它們的存在。但目前還沒有能夠成功培養的樣品,與其他生物的關係也尚未確定。它們有可能並不是一個獨立的類群,而是16S rRNA發生了某些快速或特殊突變的種類。