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嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Omicron變異株

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嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Omicron變異株Infobox info icon.svg
Spike omicron mutations side.png Spike omicron mutations top.png
以上两图为Omicron變異株刺突蛋白的突變的位置的俯视图(上)及侧视图(下),展示氨基酸的變化(黃色)、缺失(紅色)和插入(綠色)。在该两图里,两个单体(灰色与浅蓝色)的受体结合结构域为“上”构象,另一个单体(深蓝色)的受体结合结构域则为“下”构象。资料来源于世界卫生组织[1]。图片源于PDB 6VYB[2]
病毒分類 e
–未分级– 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 網巢病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
种: Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2
病毒株 嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型Omicron變異株 Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 Omicron variant
Location Botswana AU Africa.svg
2021年11月9日, 博茨瓦纳最初發現该变异株。
異名
  • 严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2变异株B.1.1.529谱系

嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型-Omicron變異株[3][4](英語:SARS-CoV-2 Omicron variant),別名B.1.1.529譜系(英語:Lineage B.1.1.529),是嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型(SARS-CoV-2)的一種變異株,它於2021年11月9日首次在波札那被發現[5]。2021年11月24日南非正式向世界衛生組織報告[1]。世界衛生組織將本變異株列為「高關注變異株」(VOC)。

症状[编辑]

此變異株和其他嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒2型變異株一样(如:AlphaDelta),没有任何发病症状的变化,部分感染者不会产生任何症状[6]

南非医学协会主席安吉丽克·库切表示,她发现该变异株的患者感到疲劳和疼痛,却没有咳嗽或味觉及嗅觉失灵[7]。世卫组织流行病学家阿卜迪·马哈穆德(Abdi Mahamud)表示表示,越来越多的研究似乎表明,奥密克戎变异株似乎主要影响上呼吸道,引起较轻的症状。而其他变异株会影响肺部,并可能导致严重的肺炎[8]

诊断[编辑]

目前的聚合酶链式反应检测可以检测出Omicron变异株。部分研究表示聚合酶链式反应检测不出S基因标靶(S gene target failure)[1]快速抗原检测英语Rapid antigen test很有可能不受其影响[6]

预防感染[编辑]

和其他變異株相同,世界卫生组织建议室内场所保持通风,避免人群聚集、近距离接触,洗手、佩戴口罩、接种疫苗。[1][9][10]

2021年11月26日,BioNTech表示他們需要两周来重新评估疫苗的有效性,若必要可在100日內對疫苗更換毒株並向全世界發貨,阿斯利康莫德納嬌生都有类似的声明與措施[11]科兴控股亦表示已开始通过全球合作伙伴网络积极收集并获取新变异株相关信息及样本,从而了解Omicron株对现有嚴重急性呼吸道症候群2型病毒灭活疫苗的影响,康希诺艾博生物等企业也已开始针对新變異株的疫苗研发[12]

2021年12月1日,中国疾病预防控制中心声明指現有的中國国产疫苗依然能有效應對Omicron集群[13]。同年12月8日,中国疾病预防控制中心称,目前判斷新冠疫苗仍有用,但其效力在衰減[14]。中疾控主任高福接受中國新聞周刊專訪時稱,這次的Omicron,正好像是免疫逃逸能力強的Beta加上傳染力強的Delta[15]

2021年12月10日,辉瑞公司和BioNTech表示在实验室检测中,作为强化接种的第三针新冠疫苗针对奥密克戎变异株产生的抗体是两剂疫苗的25倍,这将足够中和Omicron变异株。但是这一结果目前尚未经过同行评审。[16]

2021年12月11日,時代雜誌报道指,据南非的一项未经同行评审的实验室研究的预印本数据显示,接种两剂辉瑞-BioNTech 2019冠状病毒病疫苗对预防严重急性呼吸综合征冠状病毒2奥密克戎毒株有症状感染的有效性只有22.5%,惟仍可防止重症[17][18]辉瑞公司BioNTech公司表示,在实验室检测中,这两家公司的第三针新冠疫苗可有效中和奥密克戎毒株,惟两针方案阻断该毒株的效果明显较差[19]

2021年12月12日,多个香港媒体报道称,根據香港大學李嘉誠醫學院與香港中文大學醫學院最近的一項聯合研究,在實驗室研究中,严重急性呼吸综合征冠状病毒2Omicron集群可大幅減低輝瑞復必泰疫苗的中和抗體97%[20][21]。報道同時指出,港大及中大醫學院的將於下星期測試已接種加強劑疫苗人士的血液,並期望加強劑可提升疫苗的保護力;對於科興疫苗的同類研究也將在下星期完成[21]

2021年12月14日,路透社等多个媒体报道指,根据南非最大的私营机构Discovery Health进行的分析,在預防感染严重急性呼吸综合征冠状病毒2Omicron变异株方面,兩劑辉瑞-BioNTech 2019冠状病毒病疫苗僅能提供33%的保護力;但在避免住院上,其保護力可達70%[22][23][24]路透社的新闻稿称,辉瑞BioNTech上周表示,他们的疫苗注射两针仍可预防严重疾病,因为其突变不太可能逃避T细胞的反应[22]

治疗[编辑]

世界卫生组织表示,皮质类固醇白细胞介素-6受体拮抗剂英语IL6 receptor blockers仍能有效地处理2019冠状病毒病重症患者。对于Omicron变异株的众多突变,其他治疗方式将被评估,以确定其对Omicron变异株的有效性。[25]

命名[编辑]

2021年11月26日,世界衛生組織把B.1.1.529譜系定性為「高關注變異株」,並將其命名為「Omicron變異株」[1][26][27]。在世界卫生组织尚未正式命名前,一些媒体曾将其称为「Nu」變異株,然而此次命名跳過了希臘字母「Nu」和「Xi」這兩個字母。

爭議[编辑]

據俄羅斯官方電視台RT報導,有不具名的WHO官員透露:“跳過‘Nu’是為避免與英語發音相同的‘New’混淆,至於跳過‘Xi’則是為了避免對區域的汙名化,因为這個字母对应的姓氏很‘普遍’”[28]

美國議員湯姆·柯頓[29]以及RFI[30]纽约时报[31]日刊體育[32]等猜測跳过「Xi」的理由是「Xi」与中共中央总书记习近平的「习姓」之漢語拼音相同。

歷史[编辑]

2021年11月9日,波札那採集到了已知最初的Omicron變異株樣本。南非也發現了此變異株[33],其中一宗病例前往了香港[34]以色列也發現了一宗確診病例,該病例是從馬拉維返程的旅客[35]比利時的一宗確診病例是在11月11日前在埃及被感染的[36]

4个来自博茨瓦纳的病例均接受过完整的疫苗接种。[37]以色列与德国的确诊、疑似病例都是如此[35][38]

11月27日,英国出现了两例确诊病例,另有两例出现在德国慕尼黑,意大利米兰也有此变异株的确诊者。[39]荷兰卫生部预计,在600位由南非乘机抵达史基浦机场的旅客中,有61人感染了此变异病毒。旅客入境荷兰需要核酸检测阴性报告、完成疫苗接种或者康复。其中一个航班是从豪登省约翰内斯堡出发,而该變異株已经成为豪登省境内主要传播的病毒株,改机上的所有乘客都在新的旅行限制要求下进行了核酸检测并接受隔离[40]

11月28日,悉尼出现了两个确诊病例,两位确诊者均完成了两针疫苗接种,且都从南非经多哈并于确诊前一日抵达悉尼。12位来自南非的同行者以及其他260位搭乘同一飞机的乘客、机组(多哈-悉尼)均被要求进行14天隔离[41]

為了應對Omicron變異株的傳播,日本加拿大歐盟以色列英國美國马来西亚新加坡澳洲印尼摩洛哥新西兰已宣佈對南非等國實施旅行禁令[42][43][44][45]

11月30日,因担忧奥密克戎变异株扩散,日本暂停新的外国人入境申請[46]

12月8日, 澳洲昆士蘭省宣布發現全球第一個Omicron變種病毒的亞種毒株。[47]

12月11日,台灣宣布首例境外Omicron移入個案,為一名30多歲女子,12月8日從史瓦帝尼入境。

12月13日,英國出現首例感染Omicron變種病毒後死亡病例,同時也是全球首例公開確認的Omicron死亡病例[48]

2022年1月16日, 泰國出現首宗Omicron死亡個案 患者是一名86歲女子,患有阿爾茨海默病。[49]

對經濟的影響[编辑]

2021年11月26日,由於投資者擔憂Omicron變異株對經濟可能造成的負面影響,全球金融市場出現下跌,包括了道瓊斯工業平均指數在2021年的最嚴重跌幅[50]布蘭特原油西得克萨斯中间基原油價格分別下跌10%和11.7%。

變異[编辑]

Omicron變異株突變數量眾多[51],其中刺突蛋白英语Coronavirus spike protein的突變就達32種,它们是感染产生的抗体和许多广泛接种的疫苗的主要抗原靶点,许多这些突变在其他病株中没有观察到[52][53]

Omicron变异株的特点是与原始病毒相比有30个氨基酸变化、3个小缺失和1个小插入刺突蛋白(A67V、Δ69-70、T95I、G142D、Δ143-145、Δ211、L212I、ins214EPE、G339D、 S371L,S373P,S375F,K417N,N440K,G446S,S477N,T478K,E484A,Q493K,G496S,Q498R,N501Y,Y505H,T547K,D614G,H655Y,N679K,P681H,N764K,D796Y,N856K,Q954H,N969K,L981F)。这些变化中,有 15 个位于受体结合域(残基 319-541)。该变体还在其他基因组区域(NSP3 – K38R、V1069I、Δ1265、L1266I、A1892T;NSP4 – T492I;NSP5 – P132H;NSP6 – Δ105-107、A189V – NSP12V;NSP14L; ;E – T9I;M – D3G、Q19E、A63T;N – P13L、Δ31-33、R203K、G204R)发生了突变[54]。 泰國藥物科學廳主任蘇帕吉(Supakit Sirilak)表示,雖然疫苗對Omicron保護力較低,但仍可預防重症,民眾還是要儘速施打。其引述香港大學研究,表示Omicron傳播速度比Delta快70倍,但對肺部損害較小;英國數據也顯示,家庭間Omicron的傳播率也比Delta要高。

個案統計[编辑]

出現Omicron變異株確診病例的國家和地區
  超過100,000 确诊感染
  10,000–99,999 确诊感染
  1,000–9,999 确诊感染
  100–999 确诊感染
  10–99 确诊感染
  1–9 确诊感染
  0 确诊感染

截至2022年1月7日止,Omicron已成為繼Delta之後的新主流病毒。目前病已擴散至各大洲(南極洲尚無Omicron病例)。世界衛生組織(WHO)表示Omicron病例已經擴散至世界各地,儘管沒有檢測也不代表沒有病例。

各地確診個案( 已停止更新,全球每日新增病例中九成為Omicron)
国家 / 地區 确诊 死亡
 英国 2,045,548 75
 丹麥[註 1] 156,998 18
 美國 16,777,641 1
 德國 51,472 15
 波多黎各 70,098 -
 加拿大 202,167 -
 挪威 108,665 0
 斯威士兰 19,384 70
 奥地利 56,008 -
 法國 2,377,456 -
 澳大利亚 501,078 >1
 爱沙尼亚 14,565 -
 以色列 121,122 >1
 印度 608,877 >1
 新加坡 3,057 0
 泰國 40,086 >1
 南非 [註 2] 198,756 >1
 斯洛維尼亞 10,998 -
 韩国 1,318 2
 日本 10,087 2
 西班牙 109,876 -
 瑞士 50,876 -
 比利時 36,777 -
 约旦 832 0
 瑞典 127,665 -
 義大利 80,9764 0
 布隆迪 5,485 0
 智利 80,865 -
 拉脫維亞 9,798 -
 荷蘭 109,567 -
 阿根廷 388,753 0
 黎巴嫩 433 0
 愛爾蘭 499,990 -
 博茨瓦纳 5,870 -
 墨西哥 80,987 -
 巴基斯坦 9,754 0
 巴西 99,855 -
 秘魯 30,976 -
 葡萄牙 124,434 -
 匈牙利 11,345 -
 印尼 254 0
 土耳其 98,776 0
 卢森堡 8,664 0
 香港 556 0
 百慕大 212 0
 冰島 18,566 0
 尚比亞 1,688 0
 伊朗 467 0
 佛得角 175 0
 芬兰 110,767 0
 巴勒斯坦 126 0
 马来西亚 122 0
 直布罗陀 122 0
 立陶宛 8,887 0
 新西蘭 116 0
 俄羅斯 788 0
 古巴 689 0
 羅馬尼亞 5,555 0
 臺灣 89 0
 波蘭 88 0
 柬埔寨 85 0
 奈及利亞 83 0
 捷克 71 0
 加纳 66 0
 烏克蘭 21,456 0
 哥伦比亚 89,556 0
 賽普勒斯 160,566 0
 哥斯达黎加 9,578 0
 格鲁吉亚 608 0
 巴拿马 699 0
 辛巴威 15,560 0
 法属圭亚那 789 0
 斯里蘭卡 48 0
 乌拉圭 10,567 0
 开曼群岛 44 0
 南蘇丹 41 0
 冈比亚 40 0
 肯尼亚 2,577 0
 马拉维 7,780 0
 馬爾他 4,578 0
 希臘 230,577 -
 厄瓜多尔 5,557 0
 摩洛哥 28 1
 塞内加尔 26 0
 乌干达 25 0
 越南 24 0
 法罗群岛 24 0
 模里西斯 21 0
 刚果共和国 9,877 0
 留尼旺 22,689 0
 斯洛伐克 18 0
 纳米比亚 8,098 0
 莫桑比克 3,779 0
 安哥拉 787 0
 阿尔及利亚 16 0
 千里達及托巴哥 15 0
 中国大陆 15 0
 毛里塔尼亚 14 0
 菲律賓 54,567 0
 哈萨克斯坦 890 0
 几内亚 14 0
 列支敦斯登 790 0
 科威特 1,789 0
 蒙特內哥羅 4,568 0
 保加利亚 3,907 0
 格瑞那達 11 0
 馬爾地夫 10 0
 孟加拉国 10 0
 波黑 1,677 0
 突尼西亞 19 0
 文莱 9 0
 科索沃 568 0
 阿曼 9 0
 克罗地亚 10,000 0
 委內瑞拉 7 0
 法屬玻里尼西亞 6 0
 卢旺达 4,433 0
 刚果民主共和国 12,455 0
 多哥 89 0
 伊拉克 5 0
 白俄羅斯 1,333 0
 緬甸 4 0
 卡塔尔 897 0
 巴拉圭 1,336 0
 埃及 3 0
 尼泊爾 3 0
 科特迪瓦 2 0
 塞舌尔 2 0
 所罗门群岛 2 0
 圣基茨和尼维斯 2 0
 布吉納法索 3,457 37
 斐济 1,589 0
 利比亞 2 0
 加彭 1 0
 荷屬聖馬丁 1 0
 瓜德罗普 1 0
 坦桑尼亚 1 0
 圣文森特和格林纳丁斯 1 0
 巴巴多斯 1 0
 库拉索 1 0
 多米尼加 11,113 0
 阿联酋 4,599 0
 阿尔巴尼亚 5,789 0
 阿鲁巴 890 0
 巴林 5,602 0
 牙买加 675 0
 北馬其頓 8,125 0
 塞爾維亞 30,456 0
 沙烏地阿拉伯 3,456 0
 塞拉利昂 60 0
 乌兹别克斯坦 1 0
 摩尔多瓦 55 0
 賴索托 8 0
 澳門 2 0
 开曼群岛 1 0
 东帝汶 1 0
 玻利维亚 69,567 -
 安地卡及巴布達 96 0
 尼加拉瓜 77 0
 圭亚那 1,124 0
 吉布提 946 0
 伯利兹 1,234 0
 马提尼克 1 0
 蒙古 19 0
 苏里南 1 0
 格陵兰 40 0
 尼日尔 7 0
 马里 2,345 9
 危地马拉 9 0
 洪都拉斯 15 0
 海地 1 0
 老挝 1 0
全球(共个162国家或地区出現確診病例) 总计: 524,646 死亡: 186


各國Omicron占比(估計)
国家 / 地區 占比率%
 博茨瓦纳 98
 英国 98
 南非 98
 愛爾蘭 92
 冰島 90
 俄羅斯 80
 丹麥 78
 丹麥 76
 葡萄牙 75
 澳大利亚 73
 比利時 71
 印度 80
 義大利 60
 美國 95
 瑞士 58
 荷蘭 51
 瑞典 68
 挪威 59
 西班牙 80
 新加坡 70
 哥伦比亚 25
 刚果民主共和国 29
 日本 75
 多哥 25
 法國 60
 巴西 30
 阿根廷 9
 斯洛維尼亞 40
 奈及利亞 80
 厄瓜多尔 4
 土耳其 10
 香港 80


美國各地確診個案
州 / 屬地 确诊病例
 加利福尼亚州 10,121
 纽约州 4,854
 得克萨斯州 2,801
 科罗拉多州 2,289
 马萨诸塞州 2,194
 佛罗里达州 1,112
 佐治亚州 1,075
 华盛顿州 1,042
 俄亥俄州 917
 威斯康星州 840
 伊利诺伊州 787
 马里兰州 785
 犹他州 734
 康涅狄格州 545
 新泽西州 545
 亚利桑那州 519
 路易斯安那州 503
 華盛頓哥倫比亞特區 354
 北卡罗来纳州 320
 宾夕法尼亚州 266
 印第安纳州 255
 密西根州 227
 爱达荷州 201
 田纳西州 201
 明尼苏达州 198
 内华达州 173
 波多黎各 156
 北达科他州 155
 弗吉尼亚州 143
 夏威夷州 125
 俄勒冈州 118
 肯塔基州 113
 西弗吉尼亚州 90
 密西西比州 85
 佛蒙特州 84
 南卡罗来纳州 72
 罗得岛州 69
 蒙大拿州 68
 堪萨斯州 63
 艾奥瓦州 55
 亚拉巴马州 52
 密苏里州 39
 怀俄明州 35
 内布拉斯加州 29
 新罕布什尔州 21
 新墨西哥州 20
 缅因州 19
 阿肯色州 15
 奧克拉荷馬州 8
 特拉华州 8
 南达科他州 7
 阿拉斯加州 6
美國 总计: 35,513

備註[编辑]

  1. ^ 該報告不再每天發布。從12月27日起,該報告將在周一、週三和周五發布。
  2. ^ 南非不再公布檢測報告。

參見[编辑]

參考文獻[编辑]

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外部連結[编辑]