已测序真核生物基因组列表

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酿酒酵母是确定其完整基因组序列的第一个真核生物。

已测序真核生物基因组列表包括所有已知的,可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列真核生物;基因组草图不包括在内,只有细胞器序列的物种也不包括。

1977年,第一次出现DNA测序。1995年,细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年,酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年,发布了第一个多细胞真核生物基因组序列,秀丽隐杆线虫

原生生物[编辑]

以下是最早的5個完成基因組測序的原生生物。更完整的列表,請參閱已測序原生生物基因組列表英语List of sequenced protist genomes

植物[编辑]

以下是最早的5个完成基因组测序的植物,更完整的列表,请参阅已测序植物基因组列表

物种学名 类型 关联 基因组大小 预测的基因数 机构 完成年份
Arabidopsis thaliana
生态型:哥伦比亚
拟南芥 模式植物 119 Mb 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) Arabidopsis Genome Initiative[3] 2000[1]
Cyanidioschyzon merolae
Strain:10D
红藻 单细胞真核生物 16.5 Mb 5,331[4] University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University 2004[4]
Oryza sativassp
ssp indica
大米 Crop and model organism 420 Mb 32-50,000[5] Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 2002[5]
Ostreococcus tauri 绿藻 单细胞真核生物,基因组较小 12.6 Mb 7,969 (UniProt) Laboratoire Arago 2006[6]
Populus trichocarpa Balsam poplar or Black Cottonwood 固碳模式植物,商业木材and comparison to A. thaliana 550 Mb 45,555[7] The International Poplar Genome Consortium 2006[7]

真菌[编辑]

以下是最早的5个完成基因组测序的真菌,更完整的列表,请参阅已测序真菌基因组列表英语List of sequenced fungi genomes

物种 意义 基因组大小 预测基因数目 完成机构 完成年份
釀酒酵母
Saccharomyces cerevisiae
品系:S288C
酵母菌綱 用于酿造啤酒的酵母;常用的模式生物 12.1 Mb 6,294[8] 大规模国际合作项目[9] 1996[8]
家兔脑胞内原虫
Encephalitozoon cuniculi
微孢子蟲纲 人类病原体 2.9 Mb 1,997[10] GenoscopeUniversité Blaise Pascal 2001[10]
粟酒裂殖酵母
Schizosaccharomyces pombe
品系:972h-
裂殖酵母纲 模式生物 14 Mb 4,824[11] 桑格研究所冷泉港實驗室 2002[11]
粉色麵包黴菌
Neurospora crassa
糞殼菌綱 模式生物 40 Mb 10,082[12] Broad Institute俄勒岡健康與科學大學肯塔基大学堪萨斯大学 2003[12]
黄孢原毛平革菌
Phanerochaete chrysosporium
品系:RP78
傘菌綱 木材腐朽真菌;常用于真菌修復 30Mb 11,777[13] Joint Genome Institute 2004[13]

动物[编辑]

以下是最早的5个完成基因组测序的动物,更完整的列表,请参阅已测序动物基因组列表英语List of sequenced animal genomes

参见[编辑]

参考资料[编辑]

  1. ^ 1.0 1.1 The Arabidopsis Genome Initiative,. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692. 
  2. ^ Ensembl entry
  3. ^ Arabidopsis Genome Initiative 互联网档案馆存檔,存档日期2006-02-07.
  4. ^ 4.0 4.1 Matsuzaki M; Misumi O; Shin-I T; 等. Genome sequence of the ultrasmall unicellular red alga Cyanidioschyzon merolae 10D. Nature. April 2004, 428 (6983): 653–7. Bibcode:2004Natur.428..653M. PMID 15071595. doi:10.1038/nature02398.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  5. ^ 5.0 5.1 Goff SA; Ricke D; Lan TH; 等. A draft sequence of the rice genome (Oryza sativa L. ssp. japonica). Science. April 2002, 296 (5565): 92–100. Bibcode:2002Sci...296...92G. PMID 11935018. doi:10.1126/science.1068275.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  6. ^ Derelle E; Ferraz C; Rombauts S; 等. Genome analysis of the smallest free-living eukaryote Ostreococcus tauri unveils many unique features. PNAS. August 2006, 103 (31): 11647–52. Bibcode:2006PNAS..10311647D. PMC 1544224. PMID 16868079. doi:10.1073/pnas.0604795103.  已忽略未知参数|author-separator= (帮助)
  7. ^ 7.0 7.1 Tuskan GA, Difazio S, Jansson S; 等. The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray). Science. September 2006, 313 (5793): 1596–604. Bibcode:2006Sci...313.1596T. PMID 16973872. doi:10.1126/science.1128691. 
  8. ^ 8.0 8.1 Goffeau A, Barrell BG, Bussey H, 等. Life with 6000 genes. Science. October 1996, 274 (5287): 546, 563–7. Bibcode:1996Sci...274..546G. PMID 8849441. doi:10.1126/science.274.5287.546. 
  9. ^ International Collaboration for the Yeast Genome Sequencing 互联网档案馆存檔,存档日期2007-09-27.
  10. ^ 10.0 10.1 Katinka MD, Duprat S, Cornillot E, 等. Genome sequence and gene compaction of the eukaryote parasite Encephalitozoon cuniculi. Nature. November 2001, 414 (6862): 450–3. PMID 11719806. doi:10.1038/35106579. 
  11. ^ 11.0 11.1 Wood V, Gwilliam R, Rajandream MA, 等. The genome sequence of Schizosaccharomyces pombe. Nature. February 2002, 415 (6874): 871–80. PMID 11859360. doi:10.1038/nature724. 
  12. ^ 12.0 12.1 Galagan JE, Calvo SE, Borkovich KA, 等. The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa. Nature. April 2003, 422 (6934): 859–68. Bibcode:2003Natur.422..859G. PMID 12712197. doi:10.1038/nature01554. 
  13. ^ 13.0 13.1 Martinez, Diego; Larrondo, Luis F; Putnam, Nik; Gelpke, Maarten D Sollewijn; Huang, Katherine; Chapman, Jarrod; Helfenbein, Kevin G; Ramaiya, Preethi; 等. Genome sequence of the lignocellulose degrading fungus Phanerochaete chrysosporium strain RP78. Nature Biotechnology. 2004, 22 (6): 695–700. PMID 15122302. doi:10.1038/nbt967. 

外部链接[编辑]