布雷-柯蒂斯相异度

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布雷-柯蒂斯相异度(英语:Bray–Curtis dissimilarity)是一个生态学生物学术语,由J. Roger Bray和John T. Curtis[1]提出,基于物种多度对不同样地物种组成差异进行衡量的测度。其计算公式是:

其中,分别是两个调查样地的编号,是两个样地共有物种的多度较小值之和,分别是两个样地的物种多度之和。关于计算的拓展阅读请参见Legendre & Legendre[2]

布雷-柯蒂斯相异度介于0和1之间,0意味着两个调查样地的物种组成完全相同,而1则表示两个调查样地的物种组成完全不同。

布雷-柯蒂斯相异度经常被误认为是一种距离测度("距离的定义应当基于三角不等式,但是很多差异性的度量并不具有该属性,为了区别这些差异性度量和距离度量,我们称它们为‘相异度’”[3]))。由于它不满足三角不等式,我们应当称之为“相异度”而非“距离”,以避免混淆。一些软件如mothur软件包提供了计算大量调查样地之间相异度的方法[4]

布雷-柯蒂斯相异度和雅卡尔指数(英语:Jaccard index)相似,但是由于布雷-柯蒂斯相异度是半度量的,所以雅卡尔指数可能会是更好的选择[5]

参考文献[编辑]

  1. ^ Bray, J. R. and J. T. Curtis. 1957. An ordination of upland forest communities of southern Wisconsin. Ecological Monographs 27:325-349.
  2. ^ Pierre Legendre & Louis Legendre. 1998. Numerical ecology. 2nd English edition. Elsevier Science BV, Amsterdam.
  3. ^ Chapter 5 Measures of distance between samples: non-Euclidean (PDF). 
  4. ^ Braycurtis - mothur. www.mothur.org. 
  5. ^ R: Dissimilarity Indices for Community Ecologists. cc.oulu.fi. 

延伸阅读[编辑]

  • Czekanowski J (1909) Zur Differentialdiagnose der Neandertalgruppe. Korrespbl dt Ges Anthrop 40: 44–47.
  • Somerfield, PJ (2008) Identification of Bray-Curtis similarity index: comment on Yoshioka (2008). Mar Ecol Prog Ser 372: 303–306.
  • Yoshioka PM (2008) Misidentification of the Bray-Curtis similarity index. Mar Ecol Prog Ser 368: 309–310. http://doi.org/10.3354/meps07728