普通細菌孔道蛋白家族

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革蘭氏陰性菌孔道蛋白
1pho opm.png
鉴定
标志 Porin_1
Pfam(蛋白家族查询站) PF00267
Pfam宗系 CL0193
InterPro(蛋白数据整合站) IPR001702
PROSITE(蛋白数据站) PDOC00498
SCOP(蛋白结构分类数据站) 1mpf
TCDB(膜转运蛋白数据站) 1.B.1
OPM家族(膜蛋白方向) 31
OPM蛋白(膜蛋白方向) 1pho
CDD(保守域数据站) cd01345

普通細菌孔道蛋白一類英语Protein family存在於革蘭氏陰性菌外膜上的蛋白質。這類蛋白充當了對親水性物質的分子過濾器[1],在外膜上起着「分子篩」的作用。這些蛋白生成的裝滿水的通道可讓親水性物質進入週質空間中。部分孔道蛋白生成的擴散通路可允許大小小於排阻極限的溶質通過,而另一些則在孔道內有特異性的結合位點,只能允許一種溶質通過。孔道蛋白是細菌外膜上的一種主要蛋白質,噬菌體細菌素英语Bacteriocin常常會通過它們與細菌結合。

細菌孔道蛋白常常會結合成三聚體英语Protein trimer。而它們的β鏈則是這些蛋白質的跨膜核心[2]。有證據表明[3]一些孔道蛋白與淨化有關。這些蛋白質有:

亞家族[编辑]

參考[编辑]

  1. ^ Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x. 
  2. ^ Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X. 
  3. ^ Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.