臺北基督學院前身基督書院於1959年由美國宣教士賈嘉美博士(Dr. James R. Graham Ⅲ)所創立。賈博士的雙親(Jimmy and Sophie Graham) 於1889年至1940年期間在中國宣教,因此賈博士從小在中國長大,並於美國漢普敦.斯德尼(Hampden-Sydney)學院畢業後,即受感召回到中國宣教。中國抗日戰爭與國共內戰後,賈博士在葛理翰牧師(Rev. Billy Graham)的鼓勵下,於1950年來臺灣展開宣教事工,並於1957年向英商怡和公司購得淡水校地,座落於關渡山丘上,俯瞰著淡水河畔及觀音山,命名為「基督書院(Christ's College)」為一所四年制的博雅大學。於1959年9月以「Free China Christian College Association」在美國加州登記立案,並於同年秋季招生授課,成為全國首創之全體學生住校之基督教博雅教育學院。於1999年年加入『美國基督教大學院校聯會 Council for Christian Colleges and Universities(CCCU),於2006年4月4日獲得美國「國際基督教大學院校認証協會」(Transnational Association of Christian Colleges and Schools, TRACS)認證,並被美國聯邦教育部承認;2012年獲中華民國教育部按《宗教研修學院設立辦法》立案為「臺北基督學院Christ’s College Taipei」,成為台灣第一所立案的基督教博雅教育學院;2016年11月通過「國際基督教大學院校協會(TRACS)」審查委員會複審,獲得第二類機構、第二次複審認證資格,此一資格有效期限為十年(2016~2026)。