連接酶
外观
連接酶(ligase)又稱連結酶、接合酶、結合酶,是催化两个不同分子或同一分子的两个末端连接的酶。常见者为催化兩種大型分子以一種新的化學鍵結合在一起,且一般會涉及水解其中一個分子的官能團。在生物化学中,尤指催化相邻核苷酸的游离5'-磷酸基团和3'-羟基形成磷酸二酯键的酶。
一般連結酶催化以下的反應:
或有時是:
其中小階的字母代表小團。
命名
[编辑]连接酶的命名并不统一,因此这些酶通常有好几个不同的名称。一般来说,连接酶的通用名称中包含“ligase”这个词,如:DNA连接酶(DNA ligase),此为一种分子生物学实验室中常用的将DNA片段连接在一起的酶。然而,许多通用名称使用“合成酶”(synthetase)或“合酶”(synthase),因为它们用于合成新的分子[1]。还有一些连接酶使用“羧化酶”(carboxylase)命名,以表明该酶专门催化羧化反应。
需要注意的是:在生物化学命名法中,有时会将合成酶与合酶区分开来,有时又将这两个词视为同义词。通常,这两个术语可以互换使用,都用于描述连接酶[2]。当合成酶與合酶定义不同时,合成酶是指會使用三磷酸腺苷(ATP)的酶,而合酶不會使用ATP且屬於裂合酶。
分類
[编辑]連接酶在EC編號中分類為EC6,並再細分為6個子類:
- EC6.1包括形成C-O鍵的連接酶
- EC6.2包括形成C-S鍵的連接酶
- EC6.3包括形成C-N鍵的連接酶
- EC6.4包括形成C-C鍵的連接酶
- EC6.5包括形成磷酯鍵的連接酶
- EC6.6包括形成N-金屬鍵的連接酶
参见
[编辑]內部連結
[编辑]外部連結
[编辑]- ^ IntEnz - EC 6. www.ebi.ac.uk. [2023-05-02].
- ^ Synthetases - Ligases - Enzymes - Products. www.axonmedchem.com. [2023-05-02].