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16BO133病毒

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16BO133病毒Infobox info icon.svg
病毒分類 e
–未分级– 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 網巢病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种: SARSr-CoV
病毒株 16BO133病毒 16BO133

16BO133病毒嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,在韓國馬鐵菊頭蝠中發現,於2019年發表,其基因組被完整定序,是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株,在SARSr-CoV中屬於SARS-CoV相關病毒,與其基因組序列相似度為82.8%。

發現[编辑]

16BO133病毒於2016年在韓國馬鐵菊頭蝠的口腔樣本中被發現,此病毒株的基因組長29075nt。在SARSr-CoV中,16BO133和2016年發表、自中國吉林馬鐵菊頭蝠中發現的JTMC15病毒最為接近,基因組核酸序列相似度為98.3%,與其他SARSr-CoV相較之下,這兩個病毒株因爲ORF7b末端的框移突變而喪失了ORF8[1][2]。16BO133病毒和SARS-CoV的基因組核酸序列相似度則為82.8%[3]

過去雖有其他SARSr-CoV病毒株在韓國被發現(B15-21病毒等),但皆無完整序列定序[4],16BO133病毒是首個被完整定序的韓國SARSr-CoV病毒株[1]

演化樹[编辑]

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 (2016年採集、2019年發表)[1]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 (2004年採集、2005年發表)[5]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 (2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株)[6]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 (2011年採集、2014年發表)[7]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 (2004年採集、2005年發表)[5]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[8]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[8]

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2011年採集、2013年發表)[9]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2012年採集、2013年發表)[9]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2013年採集、2016年發表)[10]

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[6]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒


參考文獻[编辑]

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea.. Virus Genes. 2019, 55 (4): 545–549. PMC 7089380可免费查阅. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w. 
  2. ^ Xu L, Zhang F, Yang W, Jiang T, Lu G, He B; 等. Detection and characterization of diverse alpha- and betacoronaviruses from bats in China.. Virol Sin. 2016, 31 (1): 69–77. PMC 7090707可免费查阅. PMID 26847648. doi:10.1007/s12250-016-3727-3. 
  3. ^ Na EJ, Lee SY, Kim HJ, Oem JK. Comparative genetic analyses of Korean bat coronaviruses with SARS-CoV and the newly emerged SARS-CoV-2.. J Vet Sci. 2021, 22 (1): e12. PMC 7850784可免费查阅. PMID 33522164. doi:10.4142/jvs.2021.22.e12. 
  4. ^ Kim HK, Yoon SW, Kim DJ, Koo BS, Noh JY, Kim JH; 等. Detection of Severe Acute Respiratory Syndrome-Like, Middle East Respiratory Syndrome-Like Bat Coronaviruses and Group H Rotavirus in Faeces of Korean Bats.. Transbound Emerg Dis. 2016, 63 (4): 365–72. PMC 7169817可免费查阅. PMID 27213718. doi:10.1111/tbed.12515. 
  5. ^ 5.0 5.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  6. ^ 6.0 6.1 Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi. BAT CORONAVIRUSES. Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (编). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition.. John Wiley & Sons. 2015. 
  7. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y; 等. Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China.. J Virol. 2014, 88 (12): 7070–82. PMC 4054348可免费查阅. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14. 
  8. ^ 8.0 8.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; 等. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15. 
  9. ^ 9.0 9.1 Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; 等. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864可免费查阅. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
  10. ^ Yang XL, Hu B, Wang B, Wang MN, Zhang Q, Zhang W; 等. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus.. J Virol. 2016, 90 (6): 3253–6. PMC 4810638可免费查阅. PMID 26719272. doi:10.1128/JVI.02582-15.