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Foldit

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Foldit
開發者华盛顿大学
计算机科学和工程学系和生物化学学系
初始版本2008年5月8日,​13年前​(2008-05-08
操作系统跨平台: Windows, macOS, Linux
文件大小≈391.9 MB
语言英语等9种语言
类型电子游戏
许可协议私有软件
网站http://fold.it/

Foldit是一个实验性的蛋白质折叠电子游戏,結合了眾包分布式計算的思想。由华盛顿大学计算机科学和工程学系和生物化学学系(同一批人中,很多人也參與创建Rosetta@home)聯合共同開發。

Foldit提供一系列教程,讓用户試著操縱简单的類蛋白质構造,並定期更新以真實蛋白質結構為基礎的謎題。該程序讓用户在工具辅助解謎,就能够得出實際的蛋白质模型。每當結構被变动,一个“分数”会根据折叠的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组,分享各自的方案。也有小组高分榜。

生物製造主要蛋白質結構的方式(蛋白質生物合成)在原理上已經為人類所理解,此即蛋白質DNA測序的方法。而解明肽链是如何折叠成三维的蛋白质结构更為困難;雖然大致的程序已經為人所知,但蛋白质结构预测還是需要大量的運算。

Foldit嘗試利用人腦天生的三維图形匹配能力。目前該程式出的謎題都是基於已被人們清楚瞭解的蛋白質;透過分析人類在解這些謎題時的直覺思考途徑,研究者希望能改進現有蛋白質摺疊軟體所用的算法

2010年科學雜誌《自然》雜誌上的一篇論文稱,Foldit的57,000名參與者提供了有用的結果,這些結果與算法計算的解決方案相匹配或表現優異[1][2]

成就[编辑]

  • 2010年科學期刊《自然》雜誌上的一篇論文為Foldit的57,000名參與者提供了有用的結果,這些結果與算法計算的解決方案相匹配或表現優異[1]
  • 2011年,Foldit玩家幫助解讀了Mason-Pfizer猴病毒(M-PMV)逆轉錄病毒蛋白酶的晶體結構。科學家們一直研究愛滋病的逆转录酶的晶體結構,這是一個已有十五年之久未解決的科學問題,這種蛋白質酶是愛滋病毒在活體細胞中複製和繁殖自己的重要關鍵,但在游戏中逆转录酶的結構在十天内被玩家們破解[3][4]

参阅[编辑]

参考[编辑]

  1. ^ 1.0 1.1 John Markoff. In a Video Game, Tackling the Complexities of Protein Folding. The New York Times. 10 August 2010 [12 February 2013]. (原始内容存档于2018-08-13). 
  2. ^ 存档副本. [2018-08-13]. (原始内容存档于2018-10-27). 
  3. ^ Khatib, F.; Dimaio, F.; Cooper, S.; Kazmierczyk, M.; Gilski, M.; Krzywda, S.; Zabranska, H.; Pichova, I.; Thompson, J. Crystal structure of a monomeric retroviral protease solved by protein folding game players. Nature Structural & Molecular Biology. 2011, 18 (10): 1175. doi:10.1038/nsmb.2119. 
  4. ^ Praetorius, Dean. Gamers Decode AIDS Protein That Stumped Researchers For 15 Years In Just 3 Weeks. The Huffington Post. 2011-09-19 [17 November 2016]. (原始内容存档于2017-06-21). 

外部链接[编辑]