SWI/SNF
| SWIB | |||||||||
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 拟南芥假定蛋白AT5G14170的SWIB/MDM2结构域的解析结构 | |||||||||
| 鑑定 | |||||||||
| 標誌 | SWIB | ||||||||
| Pfam | PF02201（旧版） | ||||||||
| InterPro | IPR003121 | ||||||||
| SMART | SWIB | ||||||||
| SCOP | 1ycr / SUPFAM | ||||||||
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在分子生物学领域，SWI/SNF（英語：SWItch/Sucrose NonFermentable）[1][2]是同时存在于真核生物及原核生物中的一种核小体重塑复合物。简而言之，它们是一群与重塑DNA包装方式有关的蛋白质。SWI/SNF由多种蛋白构成，这些蛋白往往是SWI及SNF基因（SWI1、SWI2/SNF2、SWI3、SWI5、SWI6）的产物以及一些其它多肽[3]。SWI/SNF受DNA刺激后表现出ATP酶活性，利用ATP破坏并重塑核小体的组蛋白和DNA之间相互作用的稳定性，不过这种结构改变的精确性质仍未明确。
人体中与SWI/SNF相似的蛋白是BAF（与SWI/SNF-A相似）和PBAF（与SWI/SNF-B相似）。BAF表示“BRG1或HRBM相关因子”，PBAF则表示“聚溴相关的BAF”[4]。
作用机理[编辑]
人们发现酵母中的SWI/SNF复合物能使DNA在不同的位置与组蛋白结合成核小体[5]。目前已提出两种SWI/SNF重塑核小体的机制[6]。一种机制叫做“扭转扩散”，认为核小体DNA中的扭转缺陷发生单向扩散，使DNA从进入核小体的地方开始贴着组蛋白八聚体的表面螺旋状地传播。另一种机制叫做“突起”或“环再捕获”，意即DNA在核小体边缘与之分离，形成一环状突起。环状突起在组蛋白八聚体表面像波浪般传播，最后在核小体内部重新与之结合。这样DNA就在和组蛋白接触点数量不变的情况下完成位移[7]。最新研究提出了与“扭转扩散”机制相抵触的有力证据，使“环再捕获”模型更有说服力[8]。
肿瘤抑制作用[编辑]
人类的SWI/SNF复合物（mSWI/SNF）对很多人类恶性肿瘤有抑制作用。1998年首先发现它能抑制横纹肌样瘤（一种罕见的儿童恶性肿瘤）[9]。随着DNA测序成本逐渐降低，2010年左右许多肿瘤首次得到测序。其中数项研究表明SWI/SNF对多种恶性肿瘤有抑制作用[10][11][12][13]。对多个测序研究结果的荟萃分析表明，大约20%的人类恶性肿瘤中SWI/SNF存在变异[14]。
SWIB/MDM2蛋白结构域[编辑]
SWIB/MDM2蛋白结构域，全称是SWI/SNF复合物B/MDM2蛋白结构域是相当重要的蛋白结构域。这个蛋白结构域在SWI/SNF复合物B和p53肿瘤抑制蛋白的负向调节蛋白MDM2中均存在。已证明MDM2与SWIB复合物同源[15]。
功能[编辑]
SWIB/MDM2蛋白结构域的主要功能是协助基因表达。在酵母中，它表达BADH2、GAL1、GAL4和SUC2等数个基因。该蛋白结构域作用是促进基因转录。它有ATP酶的活性，能分解细胞基本能量“货币”单位ATP，放出能量以破坏DNA和组蛋白结合的稳定性，从而干扰染色质，并开放可供转录因子结合的位点，这就促进了基因的转录[16]。
系列成员[编辑]
以下列出酵母SWI/SNF系列基因成员以及人类相应的直系同源基因[17]：
| 酵母 | 人类 | 功能 |
|---|---|---|
| SWI1 | ARID1A、ARID1B | 含有LXXLL核受体结合基序 |
| SWI2/SNF2 | SMARCA4 | ATP依赖的染色质重塑 |
| SWI3 | SMARCC1、SMARCC2 | 功能未知的相似序列 |
| SWP73 | SMARCD1、SMARCD2、SMARCD3 | 功能未知的相似序列 |
| SWP61 | ACTL6A、ACTL6B | 肌动蛋白样蛋白 |
历史[编辑]
SWI/SNF首先发现于釀酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）中，以交替（switching，缩写SWI）型和不发酵蔗糖型（sucrose nonfermenting，缩写SNF）型交配后所得的酵母命名[16]。
另见[编辑]
参考文献 s[编辑]
- ^ Neigeborn L, Carlson M. Genes Affecting the Regulation of SUC2 Gene Expression by Glucose Repression in SACCHAROMYCES CEREVISIAE. Genetics. 1984, 108 (4): 845–58 [2014-01-06]. PMC 1224269
. PMID 6392017. （原始内容存档于2008-08-21）.
- ^ Stern M, Jensen R, Herskowitz I. Five SWI genes are required for expression of the HO gene in yeast. J. Mol. Biol. 1984, 178 (4): 853–68. PMID 6436497. doi:10.1016/0022-2836(84)90315-2.
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外部链接[编辑]
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