UniProt

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UniProt
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内容
有機體 所有
相關信息
研究中心 英国EMBL-EBI、瑞士SIB英语Swiss Institute of Bioinformatics、美国PIR
访问入口
数据格式 Custom flat file, FASTA, GFF, RDF, XML.
网站 www.uniprot.org
下載地址 www.uniprot.org/downloads & for downloading complete data sets ftp.uniprot.org
網絡服務地址 Yes – JAVA API see info here & REST see info here
工具
Web Advanced search, BLAST, ClustalO, bulk retrieval/download, ID mapping
其他
许可 Creative Commons Attribution-NoDerivs
版本 Yes
數據發佈頻率 4周一次
管理政策 Yes – manual and automatic. Rules for automatic annotation generated by database curators and computational algorithms.
可否列為書籤 Yes – both individual protein entries and searches

UniProt是一个全面的,高质量的,免费使用的蛋白质序列英语Peptide sequence与功能信息数据库,许多内容来自基因组计划,它还包含了大量来自研究文献的关于蛋白的生物学功能信息。

UniProt共同体[编辑]

UniProt共同体由欧洲生物信息研究所(EBI), 瑞士生物信息研究所英语Swiss Institute of Bioinformatics(SIB),以及美国Protein Information Resource英语Protein Information Resource(PIR)组成。EBI坐落于英国茵格斯顿英语HinxtonWellcome Trust Genome Campus英语Wellcome Trust Genome Campus,拥有大量的生物信息学数据库及服务资源。SIB,位于瑞士的日内瓦,维持ExPASy(Expert Protein Analysis System,一个蛋白质组学工具和数据库资源中心)服务器的运作。

参考文献[编辑]

外部链接[编辑]