YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒：修订间差异
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YNLF_31C病毒與YNLF_34C病毒皆是在一次[[雲南]]蝙蝠冠狀病毒普查的研究中被發現，研究人員在雲南多處採集多種蝙蝠樣本，發現多種SARS相關病毒的序列，其中兩件來自[[楚雄彝族自治州]][[祿豐縣]]的[[馬鐵菊頭蝠]]樣本中的病毒[[RNA複製酶|複製酶]]保守區序列和[[SARS-CoV]]完全吻合，即YNLF_31C與YNLF_34C。研究人員進一步將這兩個病毒株的完整基因組定序，其基因組皆長29723[[核鹼基|nt]]，彼此序列幾乎相同（相似度99.9%），於2015年發表<ref name="LauFeng2015"/>。 |
YNLF_31C病毒與YNLF_34C病毒皆是在一次[[雲南]]蝙蝠冠狀病毒普查的研究中被發現，研究人員在雲南多處採集多種蝙蝠樣本，發現多種SARS相關病毒的序列，其中兩件來自[[楚雄彝族自治州]][[祿豐縣]]的[[馬鐵菊頭蝠]]樣本中的病毒[[RNA複製酶|複製酶]]保守區序列和[[SARS-CoV]]完全吻合，即YNLF_31C與YNLF_34C。研究人員進一步將這兩個病毒株的完整基因組定序，其基因組皆長29723[[核鹼基|nt]]，彼此序列幾乎相同（相似度99.9%），於2015年發表<ref name="LauFeng2015"/>。 |
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[[SARS-CoV]]刺突蛋白中與宿主受體[[血管紧张素转化酶2|ACE2]]結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）中有5個關鍵胺基酸為辨識物種所需，YNLF_31C與YNLF_34C僅有其中1個與SARS-CoV相同，另外其RBD與[[HKU3病毒|HKU3]]、[[Rf1病毒|Rf1]]、[[Rp3病毒|Rp3]]與[[Rm1病毒|Rm1]]一樣有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失（但不見於[[WIV1病毒]]與[[SHC014病毒]]）。YNLF_31C與YNLF_34C全[[基因組]]序列與SARS-CoV的相似度約為93%，略低於WIV1與SHC014和SARS-CoV的相似度（95%），但其[[SARS病毒的ORF8|ORF8]]與SARS-CoV的相似度較高，[[核酸]]與[[胺基酸]]序列相似度皆約為82%，相較之下WIV1與SHC014的ORF8與SARS-CoV的胺基酸序列相似度僅有約33%，顯示SARS-CoV可能是[[馬鐵菊頭蝠]]的SARSr-CoV（YNLF_31C、YNLF_34C病毒或相關病毒）與[[中華菊頭蝠]]的SARSr-CoV（WIV、SHC014或相關病毒）間發生重組產生 |
[[SARS-CoV]]刺突蛋白中與宿主受體[[血管紧张素转化酶2|ACE2]]結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）中有5個關鍵胺基酸為辨識物種所需，YNLF_31C與YNLF_34C僅有其中1個與SARS-CoV相同，另外其RBD與[[HKU3病毒|HKU3]]、[[Rf1病毒|Rf1]]、[[Rp3病毒|Rp3]]與[[Rm1病毒|Rm1]]一樣有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失（但不見於[[WIV1病毒]]與[[SHC014病毒]]）。YNLF_31C與YNLF_34C全[[基因組]]序列與SARS-CoV的相似度約為93%，略低於WIV1與SHC014和SARS-CoV的相似度（95%），但其[[SARS病毒的ORF8|ORF8]]與SARS-CoV的相似度較高，[[核酸]]與[[胺基酸]]序列相似度皆約為82%，相較之下WIV1與SHC014的ORF8與SARS-CoV的胺基酸序列相似度僅有約33%，加上此前有在[[湖北]][[馬鐵菊頭蝠]]中發現的另一SARS相關病毒株[[Rf1病毒|Rf1]]的ORF8與SARS-CoV相似度也較高（80.4%）<ref name="HuGe2015"/>，顯示SARS-CoV可能是[[馬鐵菊頭蝠]]的SARSr-CoV（YNLF_31C、YNLF_34C病毒或相關病毒）與[[中華菊頭蝠]]的SARSr-CoV（WIV、SHC014或相關病毒）間發生重組產生<ref name="LauFeng2015"/><ref name="HuGe2015">{{cite journal|last1=Hu|first1=Ben|last2=Ge|first2=Xingyi|last3=Wang|first3=Lin-Fa|last4=Shi|first4=Zhengli|title=Bat origin of human coronaviruses|journal=Virology Journal|volume=12|issue=1|year=2015|issn=1743-422X|doi=10.1186/s12985-015-0422-1}}</ref>{{Notetag|name=new|1=2015年發表的另一項研究顯示有兩種[[中華菊頭蝠]]SARSr-CoV病毒株的ORF8和SARS-CoV的相似度更高，基因組相似度達近99%，僅有若干個[[點突變]]<ref name="WuYang2016">{{cite journal|last1=Wu|first1=Zhiqiang|last2=Yang|first2=Li|last3=Ren|first3=Xianwen|last4=Zhang|first4=Junpeng|last5=Yang|first5=Fan|last6=Zhang|first6=Shuyi|last7=Jin|first7=Qi|title=ORF8-Related Genetic Evidence for Chinese Horseshoe Bats as the Source of Human Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus|journal=Journal of Infectious Diseases|volume=213|issue=4|year=2016|pages=579–583|issn=0022-1899|doi=10.1093/infdis/jiv476}}</ref>。}}。 |
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2021年1月24日 (日) 10:13的版本
YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒
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病毒分類 
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| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 冠状病毒科 Coronaviridae |
| 属： | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
| 亚属： | SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus |
| 种： | |
| 毒株： | YNLF 31C病毒與YNLF 34C病毒 YNLF_31C；YNLF_34C
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YNLF_31C病毒與YNLF_34C病毒皆為嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的病毒株，在中國雲南的馬鐵菊頭蝠樣本中發現，於2015年發表。這兩個病毒株的基因組序列與造成SARS事件的SARS-CoV相似度皆為93%，但其中ORF8（編碼對SARS-CoV跨物種傳播相當重要的輔助蛋白）與其相似度特別高[1]，核酸與胺基酸序列相似度皆約為82%[2][註 1]。
發現與研究
YNLF_31C病毒與YNLF_34C病毒皆是在一次雲南蝙蝠冠狀病毒普查的研究中被發現，研究人員在雲南多處採集多種蝙蝠樣本，發現多種SARS相關病毒的序列，其中兩件來自楚雄彝族自治州祿豐縣的馬鐵菊頭蝠樣本中的病毒複製酶保守區序列和SARS-CoV完全吻合，即YNLF_31C與YNLF_34C。研究人員進一步將這兩個病毒株的完整基因組定序，其基因組皆長29723nt，彼此序列幾乎相同（相似度99.9%），於2015年發表[1]。
SARS-CoV刺突蛋白中與宿主受體ACE2結合的受體結合結構域（receptor binding domain, RBD）中有5個關鍵胺基酸為辨識物種所需，YNLF_31C與YNLF_34C僅有其中1個與SARS-CoV相同，另外其RBD與HKU3、Rf1、Rp3與Rm1一樣有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失（但不見於WIV1病毒與SHC014病毒）。YNLF_31C與YNLF_34C全基因組序列與SARS-CoV的相似度約為93%，略低於WIV1與SHC014和SARS-CoV的相似度（95%），但其ORF8與SARS-CoV的相似度較高，核酸與胺基酸序列相似度皆約為82%，相較之下WIV1與SHC014的ORF8與SARS-CoV的胺基酸序列相似度僅有約33%，加上此前有在湖北馬鐵菊頭蝠中發現的另一SARS相關病毒株Rf1的ORF8與SARS-CoV相似度也較高（80.4%）[3]，顯示SARS-CoV可能是馬鐵菊頭蝠的SARSr-CoV（YNLF_31C、YNLF_34C病毒或相關病毒）與中華菊頭蝠的SARSr-CoV（WIV、SHC014或相關病毒）間發生重組產生[1][3][註 1]。
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參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; et al. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15.
- ^ Yang, Xing-Lou; Hu, Ben; Wang, Bo; Wang, Mei-Niang; Zhang, Qian; Zhang, Wei; Wu, Li-Jun; Ge, Xing-Yi; Zhang, Yun-Zhi; Daszak, Peter; Wang, Lin-Fa; Shi, Zheng-Li; Perlman, S. Isolation and Characterization of a Novel Bat Coronavirus Closely Related to the Direct Progenitor of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Virology. 2016, 90 (6): 3253–3256. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02582-15.
- ^ 3.0 3.1 Hu, Ben; Ge, Xingyi; Wang, Lin-Fa; Shi, Zhengli. Bat origin of human coronaviruses. Virology Journal. 2015, 12 (1). ISSN 1743-422X. doi:10.1186/s12985-015-0422-1.
- ^ Wu, Zhiqiang; Yang, Li; Ren, Xianwen; Zhang, Junpeng; Yang, Fan; Zhang, Shuyi; Jin, Qi. ORF8-Related Genetic Evidence for Chinese Horseshoe Bats as the Source of Human Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus. Journal of Infectious Diseases. 2016, 213 (4): 579–583. ISSN 0022-1899. doi:10.1093/infdis/jiv476.
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