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游离DNA:修订间差异

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'''游离DNA''',有时称为'''游离核酸,'''可以指:胎儿游离DNA、游离肿瘤DNA、无细胞循环线粒体DNA等。游离核酸存在于细胞外,具有胞间通讯及免疫调节功能,贯穿机体生老病死各个过程,可依来源分为两种,外源游离核酸主要来自宿主体内感染或寄生,内源游离核酸主要来自细胞凋亡(apoptosis)等机体自身过程。
'''游离DNA''',有时称为'''游离核酸'''可以指:


=== 来源 ===
* 胎儿游离DNA
一般,细胞凋亡受机体严格调控,膜破裂前得到及时清除,完成良性反应过程;而凋亡过多或清除受阻下,细胞膜破裂时会释放游离核酸,激活机体先天免疫系统而诱发炎症反应。细胞坏死(necrosis)肇始于创伤及败血症等,该过程中细胞肿胀并迅速破裂,释放大量游离核酸等胞内成分;程序性坏死(pyroptosis)时,炎性细胞为应对病原体感染而释放游离核酸也都会激活炎症反应,参与炎症过程<ref>{{Cite journal |last=Duvvuri |first=Bhargavi |last2=Lood |first2=Christian |date=2019-03-19 |title=Cell-Free DNA as a Biomarker in Autoimmune Rheumatic Diseases |url=http://dx.doi.org/10.3389/fimmu.2019.00502 |journal=Frontiers in Immunology |volume=10 |doi=10.3389/fimmu.2019.00502 |issn=1664-3224}}</ref>。
* 游离肿瘤DNA

* 无细胞循环线粒体 DNA
生物体遭受感染或损伤时,中性粒细胞趋移至该部位,释放中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs),其纤维网络中富含DNA和抗菌蛋白,可捕捉并消灭病原体。NETs释放过程类似程序性死亡(programmed cell death),又不同于一般细胞凋亡或者坏死,遂取医学术语中代表细胞死亡的词尾“-osis”,以及“NET”为此过程命名为“释网凋亡(NETosis)”。NETosis除中性粒细胞外,也发生于肥大细胞、嗜碱性粒细胞、巨噬细胞等细胞。NETosis过程中,NETs释放通常持续数小时,并最终导致中性粒细胞溶解,形成数天之后即受脱氧核糖核酸酶I(DNase I)或巨噬细胞清除,过程中所释放游离核酸、蛋白等易引起自身免疫反应甚至疾病。另外,游离核酸通常包裹于细胞外囊泡(extracellular vesicle)中,以逃避酶降解,延长炎症持续时间,而自身免疫疾病患者DNase I活性一般较低,本身核酸降解能力缓慢,更是雪上加霜<ref>{{Cite journal |last=Kubiritova |first=Zuzana |last2=Radvanszky |first2=Jan |last3=Gardlik |first3=Roman |date=2019-07-26 |title=Cell-Free Nucleic Acids and their Emerging Role in the Pathogenesis and Clinical Management of Inflammatory Bowel Disease |url=http://dx.doi.org/10.3390/ijms20153662 |journal=International Journal of Molecular Sciences |volume=20 |issue=15 |doi=10.3390/ijms20153662 |issn=1422-0067}}</ref><ref>{{Cite journal |last=Lo |first=Y. M. Dennis |last2=Han |first2=Diana S. C. |last3=Jiang |first3=Peiyong |last4=Chiu |first4=Rossa W. K. |date=2021-04-09 |title=Epigenetics, fragmentomics, and topology of cell-free DNA in liquid biopsies |url=http://dx.doi.org/10.1126/science.aaw3616 |journal=Science |volume=372 |issue=6538 |doi=10.1126/science.aaw3616 |issn=0036-8075}}</ref>。

=== 作用 ===
游离核酸主要包含双链核DNA、线粒体DNA等,产生于各种疾病过程,与疾病进程关联密切,有望作为临床生物标志物以诊断细胞凋亡、组织损伤及炎症过程。在炎症、损伤及癌症组织临床样本中,疾病个体游离核酸浓度与健康个体差异显著,除了浓度,核酸片段所携带起源细胞特征,亦可用于临床诊断。母体血浆中游离胎儿核酸含有胎儿特异性甲基化水平,可作非侵入性产前诊断工具;肿瘤来源核酸具有肿瘤组织特异性甲基化状态,可用于癌症筛查及定位;器官移植后游离核酸可反映供体情况。血浆游离核酸与其来源组织亚细胞器结构、染色质结构、基因表达及核酸酶含量密切相关,分析核酸片段长度、序列及拓扑结构等可为炎症、疾病提供更多诊疗信息<ref>{{Cite journal |last=Nagy |first=Balint |date=2019-11-12 |title=Cell-Free Nucleic Acids |url=http://dx.doi.org/10.3390/ijms20225645 |journal=International Journal of Molecular Sciences |volume=20 |issue=22 |doi=10.3390/ijms20225645 |issn=1422-0067}}</ref>。

=== 促炎机理 ===
炎症过程源于先天免疫系统检测到相关分子模式,进而激活蛋白相互作用、基因表达调控以及细胞内外信号通路,其中以游离核酸为代表的内源性DAMP,可被模式识别受体(pattern recognition receptors,PRR)识别,激活免疫反应。游离核酸于细胞内主要经三种通路起作用:(1)TLR9通路:低甲基化游离核酸刺激TLR9,激活MyD88,释放核因子活化B细胞κ轻链增强子(Nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells,NF-κB)等活化核转录因子至细胞核,经干扰素调节因子(interferon regulatory factors,IRF)传导促进促炎细胞因子表达;(2)STING通路:环磷酸鸟苷-磷酸腺苷合酶(cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate synthase,cGAS)与核酸双链结合于细胞质,二聚后催化三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)及三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)两者合成第二信使——环磷酸鸟苷-磷酸腺苷(cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate,cGAMP),活化干扰素基因刺激基因(stimulator of interferon genes, STING)以激活自身免疫;(3)AIM2通路:黑色素瘤缺乏因子2(absent in melanoma 2,AIM2)识别游离核酸 后与含有胱天蛋白酶募集域的凋亡相关微粒蛋白(apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain,ASC)相互作用,募集胱天蛋白 酶原-1(pro-caspase-1),激活胱天蛋白酶-1(caspases-1)以诱导细胞焦亡<ref>{{Cite journal |last=Zinkova |first=Alzbeta |last2=Brynychova |first2=Iva |last3=Svacina |first3=Alexander |last4=Jirkovska |first4=Marie |last5=Korabecna |first5=Marie |date=2017-06-01 |title=Cell-free DNA from human plasma and serum differs in content of telomeric sequences and its ability to promote immune response |url=http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-02905-8 |journal=Scientific Reports |volume=7 |issue=1 |doi=10.1038/s41598-017-02905-8 |issn=2045-2322}}</ref>。

2023年7月3日 (一) 05:18的版本

游离DNA,有时称为游离核酸,可以指:胎儿游离DNA、游离肿瘤DNA、无细胞循环线粒体DNA等。游离核酸存在于细胞外,具有胞间通讯及免疫调节功能,贯穿机体生老病死各个过程,可依来源分为两种,外源游离核酸主要来自宿主体内感染或寄生,内源游离核酸主要来自细胞凋亡(apoptosis)等机体自身过程。

来源

一般,细胞凋亡受机体严格调控,膜破裂前得到及时清除,完成良性反应过程;而凋亡过多或清除受阻下,细胞膜破裂时会释放游离核酸,激活机体先天免疫系统而诱发炎症反应。细胞坏死(necrosis)肇始于创伤及败血症等,该过程中细胞肿胀并迅速破裂,释放大量游离核酸等胞内成分;程序性坏死(pyroptosis)时,炎性细胞为应对病原体感染而释放游离核酸也都会激活炎症反应,参与炎症过程[1]

生物体遭受感染或损伤时,中性粒细胞趋移至该部位,释放中性粒细胞胞外诱捕网(neutrophil extracellular traps,NETs),其纤维网络中富含DNA和抗菌蛋白,可捕捉并消灭病原体。NETs释放过程类似程序性死亡(programmed cell death),又不同于一般细胞凋亡或者坏死,遂取医学术语中代表细胞死亡的词尾“-osis”,以及“NET”为此过程命名为“释网凋亡(NETosis)”。NETosis除中性粒细胞外,也发生于肥大细胞、嗜碱性粒细胞、巨噬细胞等细胞。NETosis过程中,NETs释放通常持续数小时,并最终导致中性粒细胞溶解,形成数天之后即受脱氧核糖核酸酶I(DNase I)或巨噬细胞清除,过程中所释放游离核酸、蛋白等易引起自身免疫反应甚至疾病。另外,游离核酸通常包裹于细胞外囊泡(extracellular vesicle)中,以逃避酶降解,延长炎症持续时间,而自身免疫疾病患者DNase I活性一般较低,本身核酸降解能力缓慢,更是雪上加霜[2][3]

作用

游离核酸主要包含双链核DNA、线粒体DNA等,产生于各种疾病过程,与疾病进程关联密切,有望作为临床生物标志物以诊断细胞凋亡、组织损伤及炎症过程。在炎症、损伤及癌症组织临床样本中,疾病个体游离核酸浓度与健康个体差异显著,除了浓度,核酸片段所携带起源细胞特征,亦可用于临床诊断。母体血浆中游离胎儿核酸含有胎儿特异性甲基化水平,可作非侵入性产前诊断工具;肿瘤来源核酸具有肿瘤组织特异性甲基化状态,可用于癌症筛查及定位;器官移植后游离核酸可反映供体情况。血浆游离核酸与其来源组织亚细胞器结构、染色质结构、基因表达及核酸酶含量密切相关,分析核酸片段长度、序列及拓扑结构等可为炎症、疾病提供更多诊疗信息[4]

促炎机理

炎症过程源于先天免疫系统检测到相关分子模式,进而激活蛋白相互作用、基因表达调控以及细胞内外信号通路,其中以游离核酸为代表的内源性DAMP,可被模式识别受体(pattern recognition receptors,PRR)识别,激活免疫反应。游离核酸于细胞内主要经三种通路起作用:(1)TLR9通路:低甲基化游离核酸刺激TLR9,激活MyD88,释放核因子活化B细胞κ轻链增强子(Nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells,NF-κB)等活化核转录因子至细胞核,经干扰素调节因子(interferon regulatory factors,IRF)传导促进促炎细胞因子表达;(2)STING通路:环磷酸鸟苷-磷酸腺苷合酶(cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate synthase,cGAS)与核酸双链结合于细胞质,二聚后催化三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)及三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)两者合成第二信使——环磷酸鸟苷-磷酸腺苷(cyclic guanosine monophosphate-adenosine monophosphate,cGAMP),活化干扰素基因刺激基因(stimulator of interferon genes, STING)以激活自身免疫;(3)AIM2通路:黑色素瘤缺乏因子2(absent in melanoma 2,AIM2)识别游离核酸 后与含有胱天蛋白酶募集域的凋亡相关微粒蛋白(apoptosis-associated speck-like protein containing a caspase recruitment domain,ASC)相互作用,募集胱天蛋白 酶原-1(pro-caspase-1),激活胱天蛋白酶-1(caspases-1)以诱导细胞焦亡[5]

  1. ^ Duvvuri, Bhargavi; Lood, Christian. Cell-Free DNA as a Biomarker in Autoimmune Rheumatic Diseases. Frontiers in Immunology. 2019-03-19, 10. ISSN 1664-3224. doi:10.3389/fimmu.2019.00502. 
  2. ^ Kubiritova, Zuzana; Radvanszky, Jan; Gardlik, Roman. Cell-Free Nucleic Acids and their Emerging Role in the Pathogenesis and Clinical Management of Inflammatory Bowel Disease. International Journal of Molecular Sciences. 2019-07-26, 20 (15). ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms20153662. 
  3. ^ Lo, Y. M. Dennis; Han, Diana S. C.; Jiang, Peiyong; Chiu, Rossa W. K. Epigenetics, fragmentomics, and topology of cell-free DNA in liquid biopsies. Science. 2021-04-09, 372 (6538). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.aaw3616. 
  4. ^ Nagy, Balint. Cell-Free Nucleic Acids. International Journal of Molecular Sciences. 2019-11-12, 20 (22). ISSN 1422-0067. doi:10.3390/ijms20225645. 
  5. ^ Zinkova, Alzbeta; Brynychova, Iva; Svacina, Alexander; Jirkovska, Marie; Korabecna, Marie. Cell-free DNA from human plasma and serum differs in content of telomeric sequences and its ability to promote immune response. Scientific Reports. 2017-06-01, 7 (1). ISSN 2045-2322. doi:10.1038/s41598-017-02905-8.