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Plazi

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Plazi是一家以支持和促进数字生物分类学文献的长期、公开访问为目的的国际非营利性组织,总部位于瑞士。Plazi是生物多样性文献库(Biodiversity Literature Repository)的共同创立者。该组织使用TreatmentBank服务,将分类学出版物的数据转化为XML格式的FAIR数据,并在Zenodo上建立并维护可供公开访问的生物多样性文献库(Biodiversity Literature Repository)。[1][2]Plazi致力于宣传科学讨论和科学数据的开放获取的重要意义,它是生物多样性信息学领域中快速发展的在线分类学的贡献者。[3]

该方式最初由美国国家科学基金会德国科学基金会美國自然史博物館卡尔斯鲁厄理工学院的共同合作开发的。该方式试图创建使用XML格式对生物系统文献的内容进行建模分类。旧的学术出版物则使用GoldenGATE的半自动编辑器创建的TaxonX格式。[4]

当下,Plazi依然在使用GoldenGATE作为一个复杂的标记工具,从而允许学术界参与并提高文档质量。[5][6]

Plazi开发了多种方法,可通过全球生物多样性信息设施(GBIF)收集的TAPIR服务访问当前已发布的分类学文献中的数据记录。[7]同时可通过物种页面模型(SPM)传输模式,从而获取第三方机构,如生命百科全书(EOL)的分类数据(物种和更高分类群的科学描述)。目前,达尔文核心档案(DwC-A)传输到全球生物多样性信息设施(GBIF)的数据为33,623个数量集,占GBIF中所有数据集的比重超过50%。[8]并且在可行的前提下,Plazi通过与外部数据库(如GenBank膜翅目名称服务器ZooBank(动物学名称注册处))的网络链接来提高文档质量。

Plazi声称其支持版权法规,辩解称生物学分类并不属于文学或艺术作品的范围。因此Plazi认为这部分作品属于公共领域,在科学实践需要的前提下可以自由使用和传播。[9][10]

參見

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參考資料

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  1. ^ TreatmentBank. plazi.org. [2020-02-09]. (原始内容存档于2021-05-29). 
  2. ^ Catapano, Terry. Taxpub. Plazi. [2009-10-27]. (原始内容存档于2022-05-06). 
  3. ^ Zauner, H. Evolving e-taxonomy. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 141. PMC 2714837可免费查阅. PMID 19555493. doi:10.1186/1471-2148-9-141. 
  4. ^ Sautter, Guido. GoldenGATE Editor. Plazi, Technische Hochschule Karlsruhe. [2009-10-27]. (原始内容存档于2022-01-19). 
  5. ^ Agosti, Donat; Guidoti, Marcus; Sautter, Guido. Liberating the Richness of Facts implicit in taxonomic Publication: ThePlaziWorkflow. Biodiversity Information Science and Standards. 2020, 4 (e59179). doi:10.3897/biss.4.59179 (英语). 
  6. ^ Agosti, Donat; Egloff, Willi. Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2008, 2 (53). doi:10.1186/1756-0500-2-53 (英语). 
  7. ^ Plazidata in GBIF. Plazi. [2009-10-27]. (原始内容存档于2016-03-03). 
  8. ^ Plazi.org taxonomic treatments database. gbif.org. [2021-04-25]. (原始内容存档于2022-03-12). 
  9. ^ Taxonomic information exchange and copyright: thePlaziapproach. BMC Research Notes. 2009, 2: 53. PMC 2673227可免费查阅. PMID 19331688. doi:10.1186/1756-0500-2-53. 
  10. ^ Costello M J. Motivating Online Publication of Data. BioScience. 2009, 59:5 (5): 418 [2009-10-27]. doi:10.1525/bio.2009.59.5.9. (原始内容存档于2011-08-07). 

外部链接

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