吳國麟(?—?)為清朝武官官員,本籍福建。行伍出身的吳國麟於1799年(嘉慶4年)奉旨接替李共,於台灣地區擔任台灣水師協副將。而隸屬台灣鎮之下的此官職是台灣清治時期的這階段,全台灣的海防軍事層級最高武將,其統帥三標水營,數千名水師兵勇。