水源保護（Source Water Protection），是指對水源的保護（包括湖泊、河流和地下水），以避免過度使用和污染。
通常採取多級屏障方法（英語：multi-barrier approach）以保護水源，加拿大法官丹尼斯·歐康納（英語：Dennis O'Connor (judge)）曾在報告中推薦此法，並作為對沃克頓慘劇（英語：Walkerton Tragedy）的回應。當時安大略省的沃克頓水質遭到大腸桿菌污染。
