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低分子量RNA型

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低分子量RNA型(low molecular weight RNA pattern, LMW-RNA pattern),又稱低分子量RNA指紋(LMW-RNA fingerprinting)是一種電泳技術,用來分離小分子量的RNA,如5S rRNA(107~131nt)、第二族tRNA(82~96nt)、第一族tRNA(72~79nt)等。

對於純菌株,tRNA和5S rRNA的指紋圖譜可用於鑒別基因型和分類(5S rRNA用於不同,tRNA用於不同)。

分子生態學中,低分子量RNA型的5S rRNA帶可以給出群落多樣性的概貌。

實驗步驟爲:

  1. 提取總RNA
  2. 放射性同位素標記rRNA
  3. 高解像度的變性聚丙烯酰胺凝膠電泳
  4. 放射自顯影