全閩大學堂是於光緒二十八年（1902年）在福建省成立的第一所官立新型學校。該學堂的成立是晚清政府「廢科舉、改書院、辦學堂，推行新學」以圖挽救危機的舉措之一。
光緒二十八年壬寅三月辛酉（1902年4月9日），光緒皇帝諭旨批准設立福建省第一所官立新型學校「全閩大學堂」，堂政直屬總督府管轄。1902年3月24日舉行開學典禮，5月8日正式上課。
1904年1月學部頒發《學務綱要》規定：「泛稱大學堂需三科，全國符合條件的僅有京師大學堂、北洋大學堂和山西大學堂，其他各省大學堂均改設高等學堂，高等學堂作為大學預備科」。全閩大學堂遂改名「福建高等學堂」。從而結束了「大學堂」歷史。
