愛達荷州共有44個縣。愛達荷州面積最大的是21,980平方公里的愛達荷縣,最小的是1050平方公里的佩埃特縣。愛達荷領地於1863年3月從達科他領地、內布拉斯加領地及華盛頓領地中分拆。領地於1864年劃分為州內最早成立的六個縣,直至1868年才正式奠定如今的州界。在愛達荷州於1890年7月3日加入聯邦時,愛達荷州共有10個縣,於年底時州內便已拆分成18個縣。此後20年間州內只增加了五個縣,但愛達荷州的縣份數量於1911年至1919年間迅速增長,共新增了21個縣。隨着克拉克縣、卡里布縣和傑羅姆縣三個縣的建立後,州內的縣數量便維持在44個。