CODEX
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CODEX, CO-Detection by indEXing（暂译：索引协同检测染色法），是一种由Akoya Biosciences公司所开发的高维度多工免疫组织化学染色法[1]。
CODEX利用不同的抗体与DNA条形码结合而成的复合体作为染色标记物[2][3]，其DNA条形码作为索引标签，是由特殊的双股寡核苷酸序列所组成，并以迭代的方式依次在不同标签接上萤光基团，达到与目标细胞高度专一性结合，有较好的多工组织染色成像能力（实际上仍受限于仪器的速度与解析能力，目前约可产生40~50种不同抗体的组织染色影像）。[来源请求]
背景
[编辑]现已知肿瘤的生成、活动与其存在的肿瘤微环境密切相关，因此掌握分子细胞层级的作用机制以及患部细胞在空间上的关联性可能有助于癌症的治疗，例如：建构并了解肿瘤浸润性淋巴细胞与细胞外基质在空间上的互动关系对于肿瘤异质性的诊断至关重要。[来源请求]
一般用以观察、研究细胞之间的表现形态之方法为免疫组织化学染色法，但传统的免疫萤光染色因为自体荧光或非特异性染色等问题，难以使用超过4~5种萤光基团。CODEX能够更精确地侦测目标细胞，以多工的方式取得多组高品质染色影像[4]。
方法
[编辑]CODEX利用DNA结构利于分子标记的特性，将抗体与DNA条形码复合而设计出不同的染色标记物[2][3]，其DNA条形码作为索引标签，是由特殊的双股寡核苷酸序列所组成，并以迭代的方式依序在索引标签接上萤光基团予以染色成像。[来源请求]
步骤
[编辑]- 细胞表面抗原(分化簇)与混合著多种抗体的染色标记物起专一性免疫反应而接合。
- 在每个索引阶段，分别添加相对应的核甘酸与萤光基团，负责索引的核甘酸会与双股寡核苷酸序列上的索引位点接合，并让萤光基团亦接上。
- 利用标准的荧光显微镜成像，并将萤光基团洗掉，准备下一回合的索引。
2~3步骤如此往复，直到完成所有索引，便可得出多维染色影像(每一维都是一种染色的型态)。[来源请求]
另见
[编辑]- CODEX multiplexed tissue imaging
- CODEX multiplexed tissue imaging with DNA-conjugated antibodies
- Deep Profiling of Mouse Splenic Architecture with CODEX Multiplexed Imaging
参考文献
[编辑]- ^ CODEX® Technology | Multiplex Tissue Imaging | Akoya Biosciences. Akoya. [2019-06-15]. （原始内容存档于2019-09-24） （英语）.
- ^ 2.0 2.1 Yury Goltsev; Nikolay Samusik; Julia Kennedy-Darling; Salil Bhate; Matthew Hale; Gustavo Vazquez; Sarah Black; Garry P. Nolan. Deep Profiling of Mouse Splenic Architecture with CODEX Multiplexed Imaging. Cell. 2018-08-09, 174 (4): 968–981.e15 [2019-06-15]. ISSN 0092-8674. doi:10.1016/j.cell.2018.07.010. （原始内容存档于2019-09-24）.
- ^ 3.0 3.1 Edwin Parra. Novel Platforms of Multiplexed Immunofluorescence for Study of Paraffin Tumor Tissues. Journal of Cancer Treatment and Diagnosis. 2017-12-01, 2 (1): 43–53 [2019-06-17]. doi:10.29245/2578-2967/2018/1.1122. （原始内容存档于2019-06-17）.
- ^ Single Cell Accelerator projects in the technology innovation lab. www.vib.be. [2019-06-17]. （原始内容存档于2019-06-17）.