硒化合物是含有硒元素的化合物，在这些化合物中，硒有着多种氧化态，最常见的是−2、+4和+6。硒化合物在自然界中以各种矿物的形式存在，也可以和黄铁矿、黄铜矿等硫化物矿物共生。对很多哺乳动物来说，硒化合物是必不可少的，如硒甲硫氨酸和硒半胱氨酸是人体内存在的含硒氨基酸，硒甲硫氨酸参与硒蛋白的合成，而硒半胱氨酸的还原电位和pKa比半胱氨酸要低，使一些蛋白具有抗氧化活性。硒化合物在半导体材料、玻璃及陶瓷工业、医药、冶金等领域有着重要应用。
