Arlequin
外觀
Arlequin是一種自由的種群遺傳學綜合數據分析軟體[1],提供GUI介面,以讓一般用戶也可以作生物群體間的多種測試及計算,例如:遺傳分化係數(Fixation index,亦作F-statistics[2],Fst)、遺傳距離、哈代-溫伯格平衡、連鎖不平衡和成對差測試等[3]。
Arlequin由日內瓦大學遺傳學與生物統計學實驗室開發[4]。現時本軟體的最新版本為3.5.2.2,於2015年8月22日以zip壓縮及安裝檔的形式發放[5],只有Windows版本。Mac OS X及Linux只提供命令式(3.5.2),而且只限於64-bit環境,分為「arlecore」[6]、「arlsumstat」[7]及說明文件三部份。
外部連結
[編輯]- ^ Tiago Antao. Bioinformatics with Python Cookbook. Packt Publishing. 25 June 2015: 152 [2019-01-10]. ISBN 978-1-78355-865-0. (原始內容存檔於2019-02-15).
- ^ 劉春芳; 李翠; 張振; 王海艷. 中国沿海不同地区泥蚶(Tegillarca granosa)的遗传多样性分析. 海洋與湖沼. 2015-03, 第46卷 (第2期) [2017-01-17]. doi:10.11693/hyhz20140400105. (原始內容存檔於2020-10-26) (中文(簡體)).
- ^ Dilip K Arora; Randy Berka; Gautam B. Singh. Bioinformatics. Elsevier. 15 August 2006: 86 [2019-01-10]. ISBN 978-0-08-046370-4. (原始內容存檔於2019-02-15).
- ^ Michael R. Barnes. Bioinformatics for Geneticists: A Bioinformatics Primer for the Analysis of Genetic Data. John Wiley & Sons. 16 April 2007: 172 [2019-01-10]. ISBN 978-0-470-02619-9. (原始內容存檔於2019-02-15).
- ^ Arlequin ver 3.5.2.2 (released on 02.08.2015). 2015-08-02 [2017-01-17]. (原始內容存檔於2020-12-29).
- ^ ARLECORE (v 3.5.2) README.txt. 2015-04 [2017-01-17]. (原始內容存檔於2020-07-25).
- ^ ARLSUMSTAT (v 3.5.2) README.txt. 2009-12 [2017-01-17]. (原始內容存檔於2020-06-13).