SHC014病毒:修订间差异

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==發現==
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==重組病毒爭議==
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==註腳==
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==參考文獻==
==參考文獻==

2021年1月18日 (一) 04:36的版本

SHC014病毒
病毒分類 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种:
毒株
SHC014病毒 SHC014-CoV
異名[1]
  • Bat SARS-like coronavirus RsSHC014

SHC014病毒(RsSHC014)是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV)的一個病毒株,在中國雲南的中華菊頭蝠中發現,於2013年發表。此病毒株與造成2003年SARS事件嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)關係接近,全基因組核酸序列的相似度為95%[2]

發現

2011年4月至2012年9月,研究人員於中國雲南昆明採集中華菊頭蝠的腸道與糞便樣本,分析後發現其中除Rs672、Rf1與HKU3數種已知的病毒株外,還有兩個新病毒株,即為SHC014病毒與Rs3367病毒[註 1],兩種病毒的基因組大小均為29787nt,兩者全基因組序列與嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒(SARS-CoV)的相似度均為95%,刺突蛋白中與宿主細胞血管紧张素转化酶2(ACE2)結合的受體結合結構域(receptor binding domain, RBD)胺基酸序列分別為85%與96%,皆高於當時已知的其他SARSr-CoV病毒株[2]

重組病毒爭議

SARS-CoV病毒的RBD中,與宿主受體ACE2直接接觸的胺基酸共有14個[註 2],其中有5個為辨識物種所需[註 3]。這14個位點中,WIV病毒共有3個與SARS-CoV病毒不同,但仍能以ACE2為受體感染人類細胞,假性病毒英语Pseudotyping實驗(pseudotyping)結果顯示這3個位點的差異並不影響病毒的感染;相較之下SHC014病毒在14個位點中有7個與SARS-CoV的不同,雖然假性病毒實驗結果顯示此差異足以影響病毒與ACE2的結合,使其難以感染細胞,但研究人員製作含有SHC014刺突蛋白、且已適應小鼠體內環境的SARS-CoV重組病毒(SHC014-MA15)後,卻發現此重組病毒可感染人類細胞與實驗小鼠,且用以治療SARS感染的單株抗體與疫苗均對此感染無效。研究人員進一步嘗試以SHC014感染人類細胞與小鼠,發現其雖有一定複製能力,但毒力比SARS-CoV低許多,這一系列重組病毒的實驗結果顯示自然界中的許多蝙蝠SARSr病毒刺突蛋白可能可與人類細胞的受體結合,因此具有跨物種感染人類的能力,雖然這些病毒可能仍需要其他基因的變異以適應人類宿主,但它們跨越物種障礙感染人類的機率,可能比原先認為的還高上許多[3]

註腳

  1. ^ 與後來成功分離的WIV病毒高度相似[2]
  2. ^ 402、426、436、441、442、472、473、475、479、484、486、487、488與491等14個位點[3]
  3. ^ 酪胺酸442、白胺酸472、天門冬醯胺479、蘇胺酸487與酪胺酸491[3]

參考文獻

  1. ^ Taxonomy browser (Bat SARS-like coronavirus RsSHC014). www.ncbi.nlm.nih.gov. [2021-01-05]. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Ge, Xing-Yi; Li, Jia-Lu; Yang, Xing-Lou; Chmura, Aleksei A.; Zhu, Guangjian; Epstein, Jonathan H.; Mazet, Jonna K.; Hu, Ben; Zhang, Wei; Peng, Cheng; Zhang, Yu-Ji; Luo, Chu-Ming; Tan, Bing; Wang, Ning; Zhu, Yan; Crameri, Gary; Zhang, Shu-Yi; Wang, Lin-Fa; Daszak, Peter; Shi, Zheng-Li. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–538. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/nature12711. 
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 Menachery, Vineet D; Yount, Boyd L; Debbink, Kari; Agnihothram, Sudhakar; Gralinski, Lisa E; Plante, Jessica A; Graham, Rachel L; Scobey, Trevor; Ge, Xing-Yi; Donaldson, Eric F; Randell, Scott H; Lanzavecchia, Antonio; Marasco, Wayne A; Shi, Zhengli-Li; Baric, Ralph S. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nature Medicine. 2015, 21 (12): 1508–1513. ISSN 1078-8956. doi:10.1038/nm.3985.