抑制消减杂交
外观
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消减杂交(英语:Subtractive hybridization)这项技术可使对照组(驱赶子)与试验转录物组cDNA片段中仅不相同的部分得到PCR扩增。转录物相对丰度的差异就被突出显示,例如不同物种间的遗传学差异。此项技术基于:对照品与试样间杂交而形成的双链DNA(dsDNA)被移除,因此消除了cDNA或gDNA中丰度相似的部分,仅剩下差异表达或序列、转录物或基因组序列有变异的部分。
抑制消减杂交(英语:suppression subtractive hybridization,简称为SSH)亦成功地被用于鉴定品系或物种间的DNA序列差异,包括弧菌属等多种细菌。
另见
[编辑]外部链接
[编辑]- Overview at evrogen.com (页面存档备份,存于互联网档案馆)
- Munir, Shirin; Singh, Sushmita; Kaur, Kuljeet; Kapur, Vivek. Suppression subtractive hybridization coupled with microarray analysis to examine differential expression of genes in virus infected cells. Biological Procedures Online. 2004-01, 6 (1): 94–104. ISSN 1480-9222. PMC 420231 . PMID 15181476. doi:10.1251/bpo77 (英语).
- Diatchenko, L.; Lau, Y. F.; Campbell, A. P.; Chenchik, A.; Moqadam, F.; Huang, B.; Lukyanov, S.; Lukyanov, K.; Gurskaya, N. Suppression subtractive hybridization: a method for generating differentially regulated or tissue-specific cDNA probes and libraries.. Proceedings of the National Academy of Sciences. 1996-06-11, 93 (12): 6025–6030. ISSN 0027-8424. PMC 39182 . PMID 8650213. doi:10.1073/pnas.93.12.6025 (英语).
- Galbraith, Elizabeth A.; Antonopoulos, Dionysios A.; White, Bryan A. Suppressive subtractive hybridization as a tool for identifying genetic diversity in an environmental metagenome: the rumen as a model. Environmental Microbiology. 2004-09, 6 (9): 928–937. ISSN 1462-2912. PMID 15305918. doi:10.1111/j.1462-2920.2004.00575.x (英语).
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