琿春副都統是清朝在今吉林省琿春市設立的正二品副都統官職。隸屬吉林將軍。
康熙五十三年(1714年),於琿春設協領一員,屬寧古塔副都統。咸豐九年(1859年),因邊務事繁,琿春協領加副都統銜。
因伊犁交涉導致邊務緊張,光緒七年(1881年)設立琿春副都統衙門,調呼蘭副都統依克唐阿為首任琿春副都統。
宣統元年裁撤副都統,改設同治廳與吉林省東南兵備道。[1]