琿春副都統是清朝在今吉林省琿春市設立的正二品副都統官職。隸屬吉林將軍。
康熙五十三年（1714年），於琿春設協領一員，屬寧古塔副都統。咸豐九年（1859年），因邊務事繁，琿春協領加副都統銜。
因伊犁交涉導致邊務緊張，光緒七年（1881年）設立琿春副都統衙門，調呼蘭副都統依克唐阿為首任琿春副都統。
宣統元年裁撤副都統，改設同治廳與吉林省東南兵備道。[1]
