黑腹果蠅是被人類研究得最徹底的生物之一。其名字有來於它喜好腐爛的水果以及發酵的果汁。黑腹果蠅第一次被用作試驗研究對象在1901年，動物學家和遺傳學家通過對果蠅的種系研究，設法了解多代近親繁殖的結果和取自其中某一代進行雜交所出現的現象。之後，很多遺傳學家就開始用果蠅作研究，並且取得了很多遺傳學方面的知識，包括這種蠅類基因組里的基因在染色體上的分佈。
