長鏈非編碼RNA資料庫

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長鏈非編碼RNA資料庫,又稱長鏈間隔區非編碼RNA資料庫lncRNA資料庫,是收集了非編碼RNA及其相關表達模式的資料庫。長鏈非編碼RNA是當前生物學和醫學研究的前沿領域和熱點[1][2]

例子[編輯]

資料庫名 描述 類型 網站連結 參考文獻
ChIPBase 對長鏈非編碼RNA的表達圖譜和轉錄調控提供全面的注釋和鑑定 資料庫 [1][失效連結] [3]
LNCipedia 用於注釋人類的長鏈非編碼RNA的序列和結構 資料庫 [2] [4]
lncRNAdb 對功能的長鏈非編碼RNA提供全面的注釋 資料庫 [3] [5]
NONCODE 對長鏈非編碼RNA提供綜合的注釋 資料庫 [4] [6]
NRED 對長鏈非編碼RNA的表達注釋 資料庫 [5] [7]

參考資料[編輯]

  1. ^ Rinn, J. L.; Chang, H. Y. Genome Regulation by Long Noncoding RNAs. Annual Review of Biochemistry. 2012, 81: 145–166. PMID 22663078. doi:10.1146/annurev-biochem-051410-092902.  編輯
  2. ^ Martin, L.; Chang, H. Y. Uncovering the role of genomic "dark matter" in human disease. Journal of Clinical Investigation. 2012, 122 (5): 1589–1595. PMC 3336981. PMID 22546862. doi:10.1172/JCI60020.  編輯
  3. ^ Yang, J. -H.; Li, J. -H.; Jiang, S.; Zhou, H.; Qu, L. -H. ChIPBase: A database for decoding the transcriptional regulation of long non-coding RNA and microRNA genes from ChIP-Seq data. Nucleic Acids Research. 2012. PMID 23161675. doi:10.1093/nar/gks1060.  編輯
  4. ^ Volders, P. -J.; Helsens, K.; Wang, X.; Menten, B.; Martens, L.; Gevaert, K.; Vandesompele, J.; Mestdagh, P. LNCipedia: A database for annotated human lncRNA transcript sequences and structures. Nucleic Acids Research. 2012. PMID 23042674. doi:10.1093/nar/gks915.  編輯
  5. ^ Amaral, P. P.; Clark, M. B.; Gascoigne, D. K.; Dinger, M. E.; Mattick, J. S. LncRNAdb: A reference database for long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research. 2010, 39 (Database issue): D146–D151. PMC 3013714. PMID 21112873. doi:10.1093/nar/gkq1138.  編輯
  6. ^ Bu, D.; Yu, K.; Sun, S.; Xie, C.; Skogerbo, G.; Miao, R.; Xiao, H.; Liao, Q.; Luo, H. NONCODE v3.0: Integrative annotation of long noncoding RNAs. Nucleic Acids Research. 2011, 40 (Database issue): D210–D215. PMC 3245065. PMID 22135294. doi:10.1093/nar/gkr1175.  編輯
  7. ^ Dinger, M. E.; Pang, K. C.; Mercer, T. R.; Crowe, M. L.; Grimmond, S. M.; Mattick, J. S. NRED: A database of long noncoding RNA expression. Nucleic Acids Research. 2009, 37 (Database issue): D122–D126. PMC 2686506. PMID 18829717. doi:10.1093/nar/gkn617.  編輯