国际化合物标识

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InChI
開發者 InChI Trust
初始版本 2005年4月15日  (2005-04-15)[1][2]
穩定版本 1.04 / 2011年9月;3年前 (2011-09)
開發狀態 運作中
操作系统 Microsoft Windows类Unix系统
平台 IA-32 and x86-64
文件大小 4.3 MB
语言 英語
许可协议 IUPAC / InChI Trust Licence
網站 http://www.iupac.org/home/publications/e-resources/inchi.html IUPAC: InChI

国际化合物标识InChI英语International Chemical Identifier)是由国际纯粹与应用化学联合会国家标准技术研究所联合制定的,用以唯一标识化合物IUPAC名称的字符串。

例子[编辑]

1 CH3—CH2—OH

乙醇
InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3
2 L-Ascorbic acid.svg
维生素C
InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1

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国际化合物标识分为六个层,每个层之间以“/”分隔,并在开头以一个小写字母标明层的性质:

  1. 主层(main layer):以“1”表示
  2. 电荷层(charge layer):以“q”表示
  3. 立体化学层(Stereochemical layer):以“t”,“m”,“s”表示
  4. 异构体层(Isotopic layer):以“i”表示
  5. 固定氢原子(Fixed-H layer):以“f”表示
  6. 再连接层(Reconnected Layer):以“r”表示

其中主层是必不可少的,其他的层是可以省略的。

子层[编辑]

每个层都可以分成若干子层(sub-layer),比如主层可以分成一下三个子层:

  1. 分子式子层(没有前缀)
  2. 原子连接子层(以字母c开始)
  3. 氢原子层(以字母h开始)

举例[编辑]

以维生素C的InChI为例

1/C6H8O6 /c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5 /h2,5,7-10H,1H2 /t2-,5+/m0/s1
化学式层 原子连接层 氢原子层 立体化学层

註釋[编辑]

  1. ^ IUPAC International Chemical Identifier Project Page. IUPAC. [5 December 2012]. 
  2. ^ Heller, S.; McNaught, A.; Stein, S.; Tchekhovskoi, D.; Pletnev, I. InChI - the worldwide chemical structure identifier standard. Journal of Cheminformatics. 2013, 5 (1): 7. doi:10.1186/1758-2946-5-7. PMC 3599061. PMID 23343401.  编辑

参见[编辑]

外部鏈接[编辑]

文檔和演示文稿[编辑]

軟件和服務[编辑]

  • NCI/CADD Chemical Identifier Resolver Generates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
  • ChemSpider InChI resolver
  • Search Google for molecules (generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
  • ChemSketch, free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
  • PubChem online molecule editor that supports SMILES/SMARTS and InChI
  • ChemSpider Services that allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
  • MarvinSketch from ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
  • BKchem implements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
  • CompoundSearch implements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
  • JNI-InChI Java library that wraps the InChI library
  • the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
  • Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files