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细菌分类
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原核生物
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细菌
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古菌域
细菌域
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植物界
定鞭隐藻生物
（
英语
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Template:Hacrobia
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不等鞭毛类
（
英语
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Template:Heterokont
）
囊泡虫类
有孔虫类
古虫类
变形虫门
後鞭毛生物
（
动物界
真菌界
）〕
陸細菌
（
英语
：
Terrabacteria
）
BV1, BV3, BV5
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
滑行菌
（
英语
：
Glidobacteria
）
BV1
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
初细菌
（
英语
：
Eobacteria
）
異常球菌-棲熱菌門
异常球菌目
栖热菌目
綠彎菌門
厌氧绳菌目
暖绳菌目
绿弯菌目
爬管菌目
纤线杆菌目
热丝孢菌目
（
英语
：
Thermogemmatisporales
）
热微菌目
球形杆菌目
其他
藍菌門
革兰氏阳性菌
无
细菌外膜
厚壁菌门
BV3
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
GC較低
梭菌
厚壁菌綱
胺基酸球菌目
月形單孢菌目
韋榮球菌目
梭菌纲
（
英语
：
Clostridia
）
梭菌目
（
英语
：
Clostridia
）
盐厌氧菌目
热厌氧杆菌目
（
英语
：
Thermoanaerobacteriales
）
盐碱厌氧菌目
（
英语
：
Natranaerobiales
）
桿菌
芽孢桿菌纲
芽孢桿菌目
乳桿菌目
丹毒絲菌綱
丹毒絲菌目
热石菌纲
（
英语
：
Thermolithobacteria
）
热石菌目
軟壁菌門
柔膜菌綱
支原体目
虫原体目
厌氧原体目
无胆甾原体目
盐漿体目
（
英语
：
Haloplasma
）
放线菌门
BV5
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
GC較高
放线菌纲
（
英语
：
Actinomycetia
）
放线菌目
双歧杆菌目
酸微菌纲
酸微菌目
红蝽菌纲
红蝽菌目
腈裂菌纲
（
英语
：
Nitriliruptoria
）
厄泽比氏菌目
（
英语
：
Euzebya
）
腈裂菌目
（
英语
：
Nitriliruptor alkaliphilus
）
红色杆菌纲
（
英语
：
Rubrobacteria
）
蓋亞菌目
（
英语
：
Gaiella occulta
）
红色杆菌目
嗜熱油菌目
土壤红杆菌目
CPR組細菌
（
英语
：
Candidate Phyla Radiation
）
薄細菌
（
英语
：
Gracilibacteria
）
伍氏菌
（
英语
：
Wirthbacteria
）
熱袍菌
熱袍菌門
薄熱袍菌門
（
英语
：
Caldisericum
）
糞熱菌門
（
英语
：
Coprothermobacterota
）
網團菌門
互養菌門
水細菌
（
英语
：
Hydrobacteria
）
BV2, BV4
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
梭桿菌
梭桿菌門
梭桿菌屬
變形菌門
ε-变形菌纲
弯曲菌目
鹦鹉螺菌目
（
英语
：
Nautiliales
）
螺旋體
螺旋體門
迷微菌
暗菌門
（
英语
：
Atribacterota
）
迷微菌門
（
英语
：
Elusimicrobiota
）
PVC總門
（
英语
：
PVC superphylum
）
（浮黴菌）
浮黴菌門
浮黴菌
疣微菌門
豐祐菌綱
豐祐菌目
（
英语
：
Opitutales
）
紫紅球菌目
疣微菌綱
疣微菌目
衣原體門
衣原體綱
衣原體目
其他
黏胶球菌门
（
英语
：
Lentisphaerae
）
海綿桿菌
（
英语
：
Poribacteria
）
FCB總門
（
英语
：
FCB group
）
（鞘脂桿菌）
纖維桿菌門
纖維桿菌屬
綠菌門
綠菌綱
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擬桿菌目
噬纖維菌目
黃桿菌目
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其他
紅嗜熱鹽菌門
芽單胞菌門
變形菌
变形菌门
BV2
（
英语
：
Bergey's Manual of Systematic Bacteriology
）
α-变形菌纲
柄杆菌目
·
基尔菌目
·
韩海研所菌目
·
短小盒菌目
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根瘤菌目
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·
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β-变形菌纲
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·
嗜氢菌目
（
英语
：
Hydrogenophilaceae
）
·
嗜甲基菌目
（
英语
：
Methylophilaceae
）
·
奈瑟菌目
·
亚硝化单胞菌目
·
普罗卡杆菌目
·
红环菌目
γ-变形菌纲
酸硫杆状菌目
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交替单胞菌目
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海洋螺菌目
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硫髮菌目
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δ-变形菌纲
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脱硫弧菌目
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