細菌分類表
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生物分類表 |
本表以LPSN網站的分類爲基礎(當前版本2008年1月7日),本分類代表原核生物分類的權威雜誌IJSEM (页面存档备份,存于互联网档案馆)的分類系統,同时参考NCBI Taxonomy (页面存档备份,存于互联网档案馆),但目前其它中文維基分類表可能依照其它標準,請注意其區別。
中文名稱採用慣例(包括網上搜索途徑)以及拉丁名直接意譯,部分參考《細菌名稱》第二版,拉丁文意譯參考原核生物名稱(英文)網站。翻譯問題歡迎在原文中添加或者在討論頁中提出。
本表列到屬級。 後面帶*者爲尚未被IJSEM雜誌確認的分類。
參見:細菌。
酸桿菌門(Acidobacteria)[编辑]
酸桿菌綱(Acidobacteria)[编辑]
- 酸桿菌目(Acidobacteriales)
全噬菌綱(Holophagae)[编辑]
- 石鱉桿菌目(Acanthopleuribacterales)
- 石鱉桿菌科(Acanthopleuribacteraceae)
- 石鱉桿菌屬(Acanthopleuribacter)
- 石鱉桿菌科(Acanthopleuribacteraceae)
- 全噬菌目(Holophagales)
- 全噬菌科(Holophagaceae)
- 地髮菌屬(Geothrix)
- 全噬菌屬(Holophaga)
- 全噬菌科(Holophagaceae)
放線菌門(Actinobacteria)(高G+C革蘭氏陽性菌)[编辑]
放線菌綱(Actinobacteria)[编辑]
- 酸微菌亞綱(Acidimicrobidae)
- 放線菌亞綱(Actinobacteridae)
- 放線菌目(Actinomycetales)
- 放線菌亞目(Actinomycineae)
- (Actinopolysporineae)
- (Actinopolysporaceae)
- (Actinopolyspora)
- (Actinopolysporaceae)
- (Catenulisporineae)
- (Actinospicaceae)
- (Actinospica)
- (Catenulisporaceae)
- (Catenulispora)
- (Actinospicaceae)
- 棒桿菌亞目(Corynebacterineae)
- 弗蘭克氏菌亞目(Frankineae)
- 糖黴菌亞目(Glycomycineae)
- 微球菌亞目(Micrococcineae)
- 獲山氏菌科(Beutenbergiaceae)
- 博戈里亞湖菌科(Bogoriellaceae)
- 博戈里亞湖菌屬(Bogoriella)
- 短桿菌科(Brevibacteriaceae)
- 短桿菌屬(Brevibacterium)
- 纖維素單胞菌科(Cellulomonadaceae)
- (Dermabacteraceae)
- (Brachybacterium)
- (Dermabacter)
- (Dermacoccaceae)
- (Demetria)
- (Dermacoccus)
- (Kytococcus)
- (Dermatophilaceae)
- (Dermatophilus)
- (Kineosphaera)
- (Intrasporangiaceae)
- (Arsenicicoccus)
- (Humihabitans)
- (Intrasporangium)
- (Janibacter)
- (Knoellia)
- (Kribbia)
- (Lapillicoccus)
- (Ornithinicoccus)
- (Ornithinimicrobium)
- (Oryzihumus)
- (Serinicoccus)
- (Terrabacter)
- (Terracoccus)
- (Tetrasphaera)
- (Jonesiaceae)
- (Jonesia)
- (Microbacteriaceae)
- (Agreia)
- (Agrococcus)
- (Agromyces)
- (Aureobacterium)
- (Clavibacter)
- (Cryobacterium)
- (Curtobacterium)
- (Frigoribacterium)
- (Frondicola)
- (Gulosibacter)
- (Labedella)
- (Leifsonia)
- (Leucobacter)
- (Microbacterium)
- (Microcella)
- (Mycetocola)
- (Okibacterium)
- (Plantibacter)
- (Pseudoclavibacter)
- (Rathayibacter)
- (Rhodoglobus)
- (Salinibacterium)
- (Subtercola)
- (Yonghaparkia)
- (Zimmermannella)
- 微球菌科(Micrococcaceae)
- (Promicromonosporaceae)
- (Cellulosimicrobium)
- (Isoptericola)
- (Myceligenerans)
- (Promicromonospora)
- (Xylanibacterium)
- (Xylanimonas)
- (Rarobacteraceae)
- (Rarobacter)
- (Sanguibacteraceae)
- 血桿菌屬(Sanguibacter)
- (Yaniaceae)
- (Yania)
- 科未定
- (Actinotalea)
- (Demequina)
- (Phycicoccus)
- (Ruania)
- 微單孢菌亞目(Micromonosporineae)
- 微單孢菌科(Micromonosporaceae)
- (Actinocatenispora)
- (Actinoplanes)
- (Amorphosporangium)
- (Ampullariella)
- (Asanoa)
- (Catellatospora)
- (Catenuloplanes)
- (Couchiolanes)
- (Dactylosporangium)
- (Krasilnikovia)
- (Longispora)
- (Luedemannella)
- 微單孢菌屬(Micromonospora)
- (Pilimelia)
- (Planopolyspora)
- (Polymorphospora)
- (Salinispora)
- (Spirilliplanes)
- (Verrucosispora)
- (Virgisporangium)
- 微單孢菌科(Micromonosporaceae)
- 丙酸桿菌亞目(Propionibacterineae)
- (Nocardioidaceae)
- (Actinopolymorpha)
- (Aeromicrobium)
- (Friedmanniella)
- (Hongia)
- (Kribbella)
- (Marmoricola)
- (Micropruina)
- (Nocardioides)
- (Pimelobacter)
- (Propionicicella)
- (Propionicimonas)
- 丙酸桿菌科(Propionibacteriaceae)
- (Nocardioidaceae)
- (Pseudonocardineae)
- (Actinosynnemataceae)
- (Actinokineospora)
- (Actinosynnema)
- (Lechevalieria)
- (Lentzea)
- (Saccharothrix)
- (Umezawaea)
- (Pseudonocardiaceae)
- (Actinoalloteichus)
- (Actinobispora)
- (Amycolata)
- (Amycolatopsis)
- (Crossiella)
- (Faenia)
- (Goodfellowia)
- (Kibdelosporangium)
- (Kutzneria)
- (Prauserella)
- (Pseudoamycolata)
- (Pseudonocardia)
- (Saccharomonospora)
- (Saccharopolyspora)
- (Streptoalloteichus)
- (Thermobispora)
- (Thermocrispum)
- (Actinosynnemataceae)
- 鏈黴菌亞目(Streptomycineae)
- (Streptosporangineae)
- (Nocardiopsaceae)
- (Nocardiopsis)
- (Streptomonospora)
- (Thermobifida)
- (Streptosporangiaceae)
- (Acrocarpospora)
- (Herbidospora)
- (Microbispora)
- (Microtetraspora)
- (Nonomuraea)
- (Planobispora)
- (Planomonospora)
- (Planotetraspora)
- (Sphaerisporangium)
- (Streptosporangium)
- (Thermopolyspora)
- (Thermomonosporaceae)
- 珊瑚状放线菌屬(Actinocorallia)
- (Actinomadura)
- (Excellospora)
- (Spirillospora)
- (Thermomonospora)
- (Nocardiopsaceae)
- 雙歧桿菌目(Bifidobacteriales)
- 放線菌目(Actinomycetales)
- (Coriobacteridae)
- (Coriobacteriales)
- (Coriobacterineae)
- (Coriobacteriaceae)
- 奇異菌屬(Atopobium)
- (Collinsella)
- (Coriobacterium)
- (Cryptobacterium)
- (Denitrobacterium)
- (Eggerthella)
- (Olsenella)
- (Slackia)
- (Coriobacteriaceae)
- (Coriobacterineae)
- (Coriobacteriales)
- 紅色桿菌亞綱(Rubrobacteridae)
- 球形桿菌亞綱(Sphaerobacteridae)
產水菌門(Aquificae)[编辑]
產水菌綱(Aquificae)[编辑]
- 產水菌目(Aquificales)
擬桿菌門(Bacteroidetes)[编辑]
擬桿菌綱(Bacteroidetes)[编辑]
- 擬桿菌目(Bacteroidales)
- 擬桿菌科(Bacteroidaceae)
- (Acetomicrobium)
- (Anaerophaga)
- (Anaerorhabdus)
- 擬桿菌屬(Bacteroides)
- (Pontibacter)
- 紫單胞菌科(Porphyromonadaceae)
- (Barnesiella)
- (Capsularis)
- (Dysgonomonas)
- (Hallella)
- (Odoribacter)
- (Oribaculum)
- (Paludibacter)
- (Parabacteroides)
- 紫單胞菌屬(Porphyromonas) (多譯作“卟啉單胞菌”,但porphyro-應來源於希臘語“紫色”)
- (Proteiniphilum)
- (Tannerella)
- (Xylanibacter)
- 普雷沃氏菌科(Prevotellaceae)
- 普雷沃氏菌屬(Prevotella) (或譯作“普氏菌”)
- 理研菌科(Rikenellaceae)
- (Alistipes)
- (Alkaliflexus)
- (Marinilabilia)
- (Petrimonas)
- 理研菌屬(Rikenella) (註:Riken是日語“理化學研究所”簡稱)
- 科未定
- (Acetofilamentum)
- (Acetothermus)
- 擬桿菌科(Bacteroidaceae)
黃桿菌綱(Flavobacteria)[编辑]
- 黃桿菌目(Flavobacteriales)
- 蟑螂桿狀體科(Blattabacteriaceae)
- 蟑螂桿狀體屬(Blattabacterium)
- (Cryomorphaceae)
- (Algoriphagus)
- (Brumimicrobium)
- (Crocinitomix)
- (Cryomorpha)
- (Fluviicola)
- 李時珍菌屬(Lishizhenia)
- (Owenweeksia)
- 黃桿菌科(Flavobacteriaceae)
- (Actibacter)
- (Aequorivita)
- (Algibacter)
- (Aquimarina)
- (Arenibacter)
- 伯傑菌屬(Bergeyella)
- (Bizionia)
- 碳酸噬胞菌屬(Capnocytophaga) (註:多譯作“二氧化碳噬纖維菌屬”)
- 噬纖維素菌屬(Cellulophaga)
- 金黃桿菌屬(Chryseobacterium)
- (Cloacibacterium)
- (Coenonia)
- (Costertonia)
- (Croceibacter)
- 獨島菌屬(Dokdonia)
- 東海菌屬(Donghaeana)
- (Elizabethkingia)
- (Empedobacter)
- (Epilithonimonas)
- (Flaviramulus)
- 黃桿菌屬(Flavobacterium)
- (Formosa)
- 泥灘桿菌屬(Gaetbulibacter)
- 泥灘微菌屬(Gaetbulimicrobium)
- (Galbibacter)
- (Gelidibacter)
- (Gillisia)
- (Gilvibacter)
- 革蘭菌屬(Gramella)
- (Kaistella)
- (Kordia)
- (Krokinobacter)
- (Lacinutrix)
- 列文虎克菌屬(Leeuwenhoekiella)
- (Lutibacter)
- (Maribacter)
- (Mariniflexile)
- (Marixanthomonas)
- (Mesonia)
- (Muricauda)
- (Myroides)
- (Nonlabens)
- (Olleya)
- (Ornithobacterium)
- (Persicivirga)
- (Pibocella)
- 極地桿菌屬(Polaribacter)
- 冷彎菌屬(Psychroflexus)
- (Psychroserpens)
- (Riemerella)
- (Robiginitalea)
- (Salegentibacter)
- (Sandarakinotalea)
- (Sediminibacter)
- (Sediminicola)
- 世宗菌屬(Sejongia)
- (Stanierella)
- (Stenothermobacter)
- (Subsaxibacter)
- (Subsaximicrobium)
- (Tamlana)
- (Tenacibaculum)
- (Ulvibacter)
- (Vitellibacter)
- (Wautersiella)
- (Weeksella)
- (Winogradskyella)
- 麗水菌屬(Yeosuana)
- (Zeaxanthinibacter)
- 周氏菌屬(Zhouia)
- (Zobellia)
- 王祖農菌屬(Zunongwangia)
- 蟑螂桿狀體科(Blattabacteriaceae)
鞘脂桿菌綱(Sphingobacteria)[编辑]
- 鞘脂桿菌目(Sphingobacteriales)
- 泉髮菌科(Crenotrichaceae)
- (Balneola)
- (Chitinophaga)
- 泉髮菌屬(Crenothrix)
- (Rhodothermus)
- (Salinibacter)
- (Terrimonas)
- (Toxothrix)
- (Flammeovirgaceae)
- (Flammeovirga)
- (Flexithrix)
- (Perexilibacter)
- (Persicobacter)
- (Rapidithrix)
- (Sediminitomix)
- (Thermonema)
- 屈撓桿菌科(Flexibacteraceae)
- (Adhaeribacter)
- (Aquiflexum)
- (Arcicella)
- (Belliella)
- (Chimaereicella)
- (Cyclobacterium)
- 噬胞菌屬(Cytophaga) (註:目前多稱此屬爲“噬纖維菌屬”,此處依拉丁文)
- (Dyadobacter)
- (Echinicola)
- (Effluviibacter)
- (Emticicia)
- (Fabibacter)
- (Flectobacillus)
- 屈撓桿菌屬(Flexibacter)
- (Hongiella)
- (Hymenobacter)
- (Larkinella)
- (Leadbetterella)
- (Marinicola)
- (Meniscus)
- (Microscilla)
- (Niastella)
- (Persicitalea)
- (Reichenbachiella)
- (Rhodonellum)
- (Roseivirga)
- (Runella)
- (Spirosoma)
- 生孢噬胞菌屬(Sporocytophaga)
- 腐螺旋菌科(Saprospiraceae)
- (Aureispira)
- (Haliscomenobacter)
- (Lewinella)
- 腐螺旋菌屬(Saprospira)
- 鞘脂桿菌科(Sphingobacteriaceae)
- (Mucilaginibacter)
- (Olivibacter)
- (Parapedobacter)
- (Pedobacter)
- (Pseudosphingobacterium)
- 鞘脂桿菌屬(Sphingobacterium)
- 科未定
- (Niabella)
- 泉髮菌科(Crenotrichaceae)
綱未定[编辑]
- (Flavisolibacter)
- (Fulvivirga)
- (Prolixibacter)
- (Segetibacter)
衣原體門(Chlamydiae)[编辑]
衣原體綱(Chlamydiae)[编辑]
- 衣原體目(Chlamydiales)
綠菌門(Chlorobi)[编辑]
綠菌綱(Chlorobia)[编辑]
- 綠菌目(Chlorobiales)
綠彎菌門(Chloroflexi)[编辑]
厭氧繩菌綱(Anaerolineae)[编辑]
- 厭氧繩菌目(Anaerolineales)
暖繩菌綱(Caldilineae)[编辑]
綠彎菌綱(Chloroflexi)[编辑]
產金菌門(Chrysiogenetes)[编辑]
產金菌綱(Chrysiogenetes)[编辑]
藍藻門(Cyanobacteria)[编辑]
藍藻綱(Cyanobacteria)[编辑]
註:目前有三套藍藻分類系統,分別爲NCBI、Bergey's手冊及Cavalier-Smith(2002年,僅分至目)。
本文採用的Bergey's手冊中藍藻内的分類,不論目科屬,均爲形態分類,其中目在手冊中爲“Subsection”而非“Order”,目、科均未列名稱,此處目名稱爲習慣用法,科不列名稱;屬除Halospirulina和Trichodesmium之外均標爲“形態屬”(Form Genus)而非“屬”(Genus)。表中在形態分類後面加註"@"。預料不久的將來整個藍藻分類系統將會大調,與其它細菌統一爲系統發育分類系統。
此外,因漢語“藻”字可指多種水生光合產氧生物,包括多枝互不相關的原生生物甚至高等水生植物,此處仍用按照“藻”翻譯藍藻門(Cyanobacteria)細菌。但也可依據個人理念將名稱定爲“某菌”或“某藍菌”,但應注意避免與其餘細菌重名。
- 第一目(色球藻目(Chroococcales))@
- 第二目(寬球藻目(Pleurocapsales))@
- 第三目(顫藻目(Oscillatoriales))@
- 第一科@
- 節螺藻屬(Arthrospira)@ (包含商業化螺旋藻)
- (Borzia)@
- (Crinalium)@
- (Geitlerinema)@
- 鹽螺旋藻屬(Halospirulina)
- (Leptolyngbya)@
- (Limnothrix)@
- 鞘絲藻屬(Lyngbya)@
- 微鞘藻屬(Microcoleus)@
- 顫藻屬(Oscillatoria)@
- (Planktothrix)@
- 原綠髮藻屬(Prochlorothrix)@
- (Pseudanabaena)@
- 螺旋藻屬(Spirulina)@
- (Starria)@
- 束藻屬(Symploca)@
- 束毛藻屬(Trichodesmium)
- (Tychonema)@
- 第一科@
- 第四目(唸珠藻目(Nostocales))@:亦作念珠藻目
- 第五目(真枝藻目(Stigonematales))@
脫鐵桿菌門(Deferribacteres)[编辑]
脫鐵桿菌綱(Deferribacteres)[编辑]
- 脫鐵桿菌目(Deferribacterales)
異常球菌-棲熱菌門(Deinococcus-Thermus)[编辑]
異常球菌綱(Deinococci)[编辑]
網團菌門(Dictyoglomi)[编辑]
網團菌綱(Dictyoglomi)[编辑]
纖維桿菌門(Fibrobacteres)[编辑]
纖維桿菌綱(Fibrobacteres)[编辑]
厚壁菌門(Firmicutes)(低G+C革蘭氏陽性菌)[编辑]
芽孢桿菌綱(Bacilli)[编辑]
- 芽孢桿菌目(Bacillales)
- (Alicyclobacillaceae)
- (Alicyclobacillus)
- (Pasteuria)
- (Sulfobacillus)
- 芽孢桿菌科(Bacillaceae)
- (Alkalibacillus)
- (Amphibacillus)
- (Anoxybacillus)
- 芽孢桿菌屬(Bacillus)
- (Caldalkalibacillus)
- (Cerasibacillus)
- (Exiguobacterium)
- (Filobacillus)
- (Geobacillus)
- (Gracilibacillus)
- (Halalkalibacillus)
- (Halobacillus)
- (Haloactibacillus)
- (Jeotgalibacillus)
- (Lentibacillus)
- (Lysinibacillus)
- (Marinibacillus)
- (Oceanobacillus)
- (Ornithinibacillus)
- (Paraliobacillus)
- (Paucisalibacillus)
- (Pelagibacillus)
- (Piscibacillus)
- (Pontibacillus)
- 糖球菌屬(Saccharococcus)
- (Salibacillus)
- (Salimicrobium)
- (Salinibacillus)
- (Salirhabdus)
- (Sasuginibacillus)
- (Tenuibacillus)
- (Terribacillus)
- (Thalassobacillus)
- (Ureibacillus)
- (Virgibacillus)
- (Vulcanibacillus)
- (Caryophanaceae)
- (Caryophanon)
- 李斯特氏菌科(Listeriaceae)
- (Paenibacillaceae)
- (Ammoniphilus)
- (Aneurinibacillus)
- (Brevibacillus)
- (Cohnella)
- (Oxalophagus)
- (Paenibacillus)
- (Thermicanus)
- (Thermobacillus)
- (Planococcaceae)
- (Filibacter)
- (Kurthia)
- (Planococcus)
- (Planomicrobium)
- (Sporosarcina)
- 芽孢乳桿菌科(Sporolactobacillaceae)
- (Marinococcus)
- (Sinococcus)
- 芽孢乳桿菌屬(Sporolactobacillus)
- (Tuberibacillus)
- 葡萄球菌科(Staphylococcaceae)
- (Thermoactinomycetaceae)
- (Laceyella)
- (Mechercharimyces)
- (Planifilum)
- (Seinonella)
- (Shimazuella)
- (Thermoactinomyces)
- (Thermoflavimicrobium)
- (Turicibacteraceae)
- (Turicibacter)
- 科未定
- (Pullulanibacillus)
- (Alicyclobacillaceae)
- 乳桿菌目(Lactobacillales)
- 氣球菌科(Aerococcaceae)
- (Abiotrophia)
- 氣球菌屬(Aerococcus)
- (Dolosicoccus)
- (Eremococcus)
- (Facklamia)
- (Globicatella)
- (Ignavigranum)
- 肉桿菌科(Carnobacteriaceae)
- 腸球菌科(Enterococcaceae)
- 乳桿菌科(Lactobacillaceae)
- 明串珠菌科(Leuconostocaceae)
- 明串珠菌屬(Leuconostoc)
- (Oenococcus)
- (Weissella)
- 顫螺旋菌科(Oscillospiraceae)
- 鏈球菌科(Streptococcaceae)
- 科未定
- (Acetoanaerobium)
- 互營球菌屬(Syntrophococcus)
- 氣球菌科(Aerococcaceae)
梭菌綱(Clostridia)[编辑]
- 梭菌目(Clostridiales)
- 梭菌科(Clostridiaceae)
- (Acetanaerobacterium)
- (Acetivibrio)
- (Acidaminobacter)
- (Alkaliphilus)
- (Anaerobacter)
- (Anaerotruncus)
- (Anoxynatronum)
- (Bryantella)
- (Caloramator)
- (Caloranaerobacter)
- (Caminicella)
- (Clostridiisalibacter)
- 梭菌屬(Clostridium)
- (Coprobacillus)
- (Dorea)
- (Ethanoligenens)
- (Faecalibacterium)
- (Fastidiosipila)
- (Garciella)
- (Gracilibacter)
- (Guggenheimella)
- (Hespellia)
- (Natronincola)
- (Oxobacter)
- (Parasporobacterium)
- 八疊球菌屬(Sarcina)
- (Soehngenia)
- (Sporacetigenium)
- (Sporobacter)
- (Subdoligranulum)
- (Tepidibacter)
- (Tepidimicrobium)
- (Thermobrachium)
- (Thermohalobacter)
- (Tindallia)
- 優桿菌科(Eubacteriaceae)
- 太陽桿菌科(Heliobacteriaceae)
- 毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)
- 消化球菌科(Peptococcaceae)
- (Carboxydothermus)
- (Cryptanaerobacter)
- (Dehalobacter)
- (Desulfitobacterium)
- (Desulfonispora)
- (Desulfosporosinus)
- (Desulfotomaculum)
- (Pelotomaculum)
- 消化球菌屬(Peptococcus)
- (Syntrophobotulus)
- (Thermincola)
- (Thermoterrabacterium)
- 消化鏈球菌科(Peptostreptococcaceae)
- 互營單胞菌科(Syntrophomonadaceae)
- (Aminiphilus)
- (Aminobacterium)
- (Aminomonas)
- (Anaerobaculum)
- (Anaerobranca)
- (Caldicellulosiruptor)
- (Carboxydocella)
- (Dethiosulfovibrio)
- (Pelospora)
- 互營單胞菌屬(Syntrophomonas)
- (Syntrophospora)
- 互營熱菌屬(Syntrophothermus)
- (Thermaerobacter)
- (Thermanaerovibrio)
- (Thermohydrogenium)
- (Thermosyntropha)
- (Thermovirga)
- 韋榮氏菌科(Veillonellaceae)
- (Acetonema)
- 氨基酸球菌屬(Acidaminococcus)
- (Allisonella)
- (Anaeroarcus)
- (Anaeroglobus)
- (Anaeromusa)
- (Anaerosinus)
- (Anaerovibrio)
- (Centipeda)
- (Dendrosporobacter)
- (Dialister)
- (Megamonas)
- (Megasphaera)
- 光岡菌屬(Mitsuokella)
- (Papillibacter)
- (Pectinatus)
- (Pelosinus)
- (Phascolarctobacterium)
- (Propionispira)
- (Propionispora)
- (Quinella)
- (Schwartzia)
- 新月形單胞菌屬(Selenomonas)
- 鼠孢菌属(Sporomusa)
- (Sporotalea)
- (Succiniclasticum)
- (Succinispira)
- (Thermosinus)
- 韋榮氏菌屬(Veillonella)
- (Zymophilus)
- 科未定
- (Anaerovirgula)
- (Dethiosulfatibacter)
- (Geosporobacter)
- (Howardella)
- (Proteiniborus)
- 梭菌科(Clostridiaceae)
- 鹽厭氧菌目(Halanaerobiales)
- 鹽鹼厭氧菌目(Natranaerobiales)
- 熱厭氧桿菌目(Thermoanaerobacteriales)
- 熱厭氧桿菌科(Thermoanaerobacteriaceae)
- (Acetogenium)
- (Ammonifex)
- (Caldanaerobacter)
- (Carboxydibrachium)
- (Coprothermobacter)
- (Desulfovirgula)
- (Gelria)
- (Mahella)
- (Moorella)
- (Sporotomaculum)
- (Tepidanaerobacter)
- (Thermacetogenium)
- 熱厭氧單胞菌屬(Thermanaeromonas)
- (Thermoanaerobacter)
- (Thermoanaerobium)
- (Thermoanaerobacterium)
- 熱厭氧菌屬(Thermoanaerobium)
- (Thermobacteroides)
- (Thermosediminibacter)
- (Thermovenabulum)
- 熱脫硫菌科(Thermodesulfobiaceae)
- 熱脫硫菌屬(Thermodesulfobium)
- 熱厭氧桿菌科(Thermoanaerobacteriaceae)
- 目未定
- (Desulfitibacter)
- (Symbiobacterium)
熱石桿菌綱(Thermolithobacteria)[编辑]
梭桿菌門(Fusobacteria)[编辑]
梭桿菌綱(Fusobacteria)[编辑]
- 梭桿菌目(Fusobacteriales)
芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)[编辑]
芽單胞菌綱(Gemmatimonadetes)[编辑]
黏膠球形菌門(Lentisphaerae)[编辑]
黏膠球形菌綱(Lentisphaerae)[编辑]
硝化螺旋菌門(Nitrospirae)[编辑]
硝化螺旋菌綱(Nitrospira)[编辑]
- 硝化螺旋菌目(Nitrospirales)
浮黴菌門(Planctomycetes)[编辑]
浮黴菌綱(Planctomycetacia)[编辑]
- 浮黴菌目(Planctomycetales)
海綿桿菌門(Poribacteria)*[编辑]
變形菌門(Proteobacteria)[编辑]
α-變形菌綱(Alphaproteobacteria)[编辑]
- 柄桿菌目(Caulobacterales)
- 柄桿菌科(Caulobacteraceae)
- (Asticcacaulis)
- 短波單胞菌屬(Brevundimonas)
- 柄桿菌屬(Caulobacter)
- 苯基桿菌屬(Phenylobacterium)
- 柄桿菌科(Caulobacteraceae)
- (Kordiimonadales)
- (Kordiimonadaceae)
- (Kordiimonas)
- (Kordiimonadaceae)
- 短小盒菌目(Parvularculales)
- 短小盒菌科(Parvularculaceae)
- 短小盒菌屬(Parvularcula)
- 短小盒菌科(Parvularculaceae)
- 根瘤菌目(Rhizobiales)
- 橙單胞菌科(Aurantimonadaceae)
- 橙單胞菌屬(Aurantimonas)
- (Fulvimarina)
- (Martelella)
- 巴通體科(Bartonellaceae)
- 巴通體屬(Bartonella)
- (Grahamella)
- (Rochalimaea)
- 拜葉林克氏菌科(Beijerinckiaceae)
- 拜葉林克氏菌屬(Beijerinckia)
- (Chelatococcus)
- (Methylocapsa)
- (Methylocella)
- 慢生根瘤菌科(Bradyrhizobiaceae)
- 阿菲波菌屬(Afipia)
- 農單胞菌屬(Agromonas)
- (Balneimonas)
- 芽生桿菌屬(Blastobacter)
- (Bosea)
- 慢生根瘤菌屬(Bradyrhizobium)
- 硝化桿菌屬(Nitrobacter)
- (Oligotropha)
- (Rhodoblastus)
- 紅假單胞菌屬(Rhodopseudomonas)
- 布魯氏菌科(Brucellaceae)
- 布魯氏菌屬(Brucella)
- (Crabtreella)
- (Daeguia)
- 枝動菌屬(Mycoplana)
- 蒼白桿菌屬(Ochrobactrum)
- (Pseudochrobactrum)
- 黏著桿菌科(Cohaesibacteraceae)
- 黏著桿菌屬(Cohaesibacter)
- 生絲微菌科(Hyphomicrobiaceae)
- (Ancalomicrobium)
- (Angulomicrobium)
- 水桿菌屬(Aquabacter)
- 芽綠菌屬(Blastochloris)
- (Devosia)
- (Dichotomicrobium)
- (Filomicrobium)
- (Gemmiger)
- 生絲微菌屬(Hyphomicrobium)
- (Methylorhabdus)
- 土微菌屬(Pedomicrobium)
- 突柄微菌屬(Prosthecomicrobium)
- 紅微菌屬(Rhodomicrobium)
- (Rhodoplanes)
- (Seliberia)
- 甲基桿菌科(Methylobacteriaceae)
- (Meganema)
- 甲基桿菌屬(Methylobacterium)
- (Microvirga)
- (Protomonas)
- 甲基孢囊菌科(Methylocystaceae)
- (Albibacter)
- 甲基孢囊菌屬(Methylocystis)
- (Methylopila)
- (Methylosinus)
- (Pleomorphomonas)
- (Terasakiella)
- 葉桿菌科(Phyllobacteriaceae)
- (Aminobacter)
- (Aquamicrobium)
- (Defluvibacter)
- (Hoeflea)
- 中慢生根瘤菌屬(Mesorhizobium)
- (Nitratireductor)
- 葉桿菌屬(Phyllobacterium)
- (Pseudaminobacter)
- 根瘤菌科(Rhizobiaceae)
- 土壤桿菌屬(Agrobacterium)
- 異根瘤菌屬(Allorhizobium)
- 嗜碳菌屬(Carbophilus)
- 螯合桿菌屬(Chelatobacter)
- 劍菌屬(Ensifer)
- (Kaistia)
- 韌皮桿菌屬(Liberibacter)*
- 根瘤菌屬(Rhizobium)
- 中華根瘤菌屬(Sinorhizobium)
- 紅菌科(Rhodobiaceae)
- (Anderseniella)
- (Parvibaculum)
- 紅菌屬(Rhodobium)
- 玫瑰螺菌屬(Roseospirillum)
- 黃色桿菌科(Xanthobacteraceae)
- (Ancylobacter)
- (Azorhizobium)
- (Labrys)
- (Pseudolabrys)
- (Starkeya)
- 黃色桿菌屬(Xanthobacter)
- 科未定
- (Sneathiella)
- 橙單胞菌科(Aurantimonadaceae)
- 紅桿菌目(Rhodobacterales)
- 生絲單胞菌科(Hyphomonadaceae)
- (Hirschia)
- 生絲單胞菌屬(Hyphomonas)
- (Maricaulis)
- (Oceanicaulis)
- (Robiginitomaculum)
- 紅桿菌科(Rhodobacteraceae)
- (Ahrensia)
- (Albidovulum)
- (Amaricoccus)
- (Antarctobacter)
- (Catellibacterium)
- (Citreicella)
- (Citreimonas)
- (Dinoroseobacter)
- (Donghicola)
- (Gemmobacter)
- (Haematobacter)
- (Jannaschia)
- (Ketogulonicigenium)
- (Labrenzia)
- (Leisingera)
- (Loktanella)
- (Maribius)
- (Marinovum)
- (Maritimibacter)
- (Methylarcula)
- (Nereida)
- (Nesiotobacter)
- (Oceanibulbus)
- 海洋生菌屬(Oceanicola)
- (Octadecabacter)
- (Palleronia)
- (Pannonibacter)
- 副球菌屬(Paracoccus)
- (Pelagibaca)
- (Phaeobacter)
- 假紅桿菌屬(Pseudorhodobacter)
- (Pseudovibrio)
- (Rhodobaca)
- 紅桿菌屬(Rhodobacter)
- (Rhodothalassium)
- 小紅卵菌屬(Rhodovulum)
- (Roseibacterium)
- (Roseibium)
- (Roseicyclus)
- (Roseinatronobacter)
- (Roseisalinus)
- (Roseivivax)
- 玫瑰桿菌屬(Roseobacter)
- (Roseovarius)
- (Rubellimicrobium)
- (Rubrimonas)
- (Ruegeria)
- (Sagittula)
- (Salipiger)
- (Shimia)
- (Silicibacter)
- (Staleya)
- (Stappia)
- (Sulfitobacter)
- (Tateyamaria)
- (Thalassobacter)
- (Thalassobius)
- (Thalassococcus)
- (Thioclava)
- 硫球形菌屬(Thiosphaera)
- (Wenxinia)
- 木洞菌屬(Woodsholea)
- 楊氏菌屬(Yangia)
- 生絲單胞菌科(Hyphomonadaceae)
- 紅螺菌目(Rhodospirillales)
- 醋桿菌科(Acetobacteraceae)
- 醋桿菌屬(Acetobacter)
- (Acidicaldus)
- 嗜酸菌屬(Acidiphilium)
- 酸球形菌屬(Acidisphaera)
- 酸胞菌屬(Acidocella)
- 酸單胞菌屬(Acidomonas)
- (Asaia)
- (Belnapia)
- 脆弱球菌屬(Craurococcus)
- 葡糖醋桿菌屬(Gluconacetobacter)
- 葡糖桿菌屬(Gluconobacter)
- (Granulibacter)
- 駒形桿菌屬(Komagataeibacter)
- (Kozakia)
- 鼠球菌屬(Muricoccus)
- (Neoasaia)
- (Paracraurococcus)
- 紅球狀菌屬(Rhodopila)
- (Rhodovarius)
- 玫瑰球菌屬(Roseococcus)
- 玫瑰單胞菌屬(Roseomonas)
- (Rubritepida)
- (Saccharibacter)
- (Stella)
- (Swaminathania)
- (Teichococcus)
- (Zavarzinia)
- 紅螺菌科(Rhodospirillaceae)
- 固氮螺菌屬(Azospirillum)
- (Conglomeromonas)
- (Defluviicoccus)
- (Inquilinus)
- 磁螺菌屬(Magnetospirillum)
- (Phaeospirillum)
- (Rhodocista)
- 紅螺旋菌屬(Rhodospira)
- 紅螺菌屬(Rhodospirillum)
- 紅弧菌屬(Rhodovibrio)
- 玫瑰螺旋菌屬(Roseospira)
- (Skermanella)
- (Telmatospirillum)
- (Thalassospira)
- (Tistrella)
- 醋桿菌科(Acetobacteraceae)
- 立克次體目(Rickettsiales)
- 無形體科(Anaplasmataceae)
- (Aegyptianella)
- 無形體屬(Anaplasma)
- (Cowdria)
- 埃里希體屬(Ehrlichia)
- 新立克次體屬(Neorickettsia)
- 沃巴赫體屬(Wolbachia)
- (Xenohaliotis)*
- 全孢菌科(Holosporaceae)
- 全孢菌屬(Holospora)
- 立克次體科(Rickettsiaceae)
- (Orientia)
- 立克次體屬(Rickettsia)
- SAR 11群*
- 遠洋桿菌屬(Pelagibacter)*
- 科未定
- (Lyticum)
- (Odyssella)*
- (Pseudocaedibacter)
- (Symbiotes)
- (Tectibacter)
- 無形體科(Anaplasmataceae)
- 鞘脂單胞菌目(Sphingomonadales)
- 赤桿菌科(Erythrobacteraceae)
- (Altererythrobacter)
- 赤桿菌屬(Erythrobacter)
- 赤微菌屬(Erythromicrobium)
- 紫桿菌屬(Porphyrobacter)
- 鞘脂單胞菌科(Sphingomonadaceae)
- 芽單胞菌屬(Blastomonas)
- 檸檬酸微菌屬(Citromicrobium)*
- 赤單胞菌屬(Erythromonas)
- 新鞘脂菌屬(Novosphingobium)
- (Sandaracinobacter)
- (Sandaracinorhabdus)
- 鞘脂菌屬(Sphingobium)
- 鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)
- (Sphingopyxis)
- (Sphingosinicella)
- 發酵單胞菌屬(Zymomonas)
- 赤桿菌科(Erythrobacteraceae)
- 目未定
- (Albimonas)
- (Caenispirillum)
- (Insolitispirillum)
- (Novispirillum)
β-變形菌綱(Betaproteobacteria)[编辑]
- 伯克氏菌目(Burkholderiales)
- 產鹼菌科(Alcaligenaceae)
- 無色桿菌屬(Achromobacter)
- (Advenella)
- 產鹼菌屬(Alcaligenes)
- (Azohydromonas)
- 博德氏菌屬(Bordetella)
- (Brackiella)
- (Castellaniela)
- 德克斯氏菌屬(Derxia)
- (Kerstersia)
- (Oligella)
- (Pelistega)
- (Pigmentiphaga)
- (Pusillimonas)
- (Sutterella)
- (Taylorella)
- (Tetrathiobacter)
- 伯克氏菌科(Burkholderiaceae)
- 伯克氏菌屬(Burkholderia)
- (Chitinimonas)
- (Cupriavidus)
- (Lautropia)
- (Limnobacter)
- (Pandoraea)
- (Paucimonas)
- (Polynucleobacter)
- 青枯菌屬(Ralstonia)
- (Thermothrix)
- 沃特氏菌屬(Wautersia)
- 叢毛單胞菌科(Comamonadaceae)
- 食酸菌屬(Acidovorax)
- (Alcycliphilus)
- (Brachymonas)
- (Caenibacterium)
- (Caldimonas)
- 叢毛單胞菌屬(Comamonas)
- (Curvibacter)
- 代爾夫特菌屬(Delftia)
- (Diaphorobacter)
- (Giesbergeria)
- 噬氫菌屬(Hydrogenophaga)
- (Hylemonella)
- (Lampropedia)
- (Macromonas)
- (Malikia)
- (Ottowia)
- (Pelomonas)
- (Polaromonas)
- (Ramlibacter)
- 紅育菌屬(Rhodoferax)
- (Schlegelella)
- (Simplicispira)
- 貪食菌屬(Variovorax)
- (Xenophilus)
- 草酸桿菌科(Oxalobacteraceae)
- (Collimonas)
- (Duganella)
- (Herbaspirillum)
- (Herminiimonas)
- (Janthinobacterium)
- (Massilia)
- (Naxibacter)
- (Oxalicibacterium)
- 草酸桿菌屬(Oxalobacter)
- (Telluria)
- (Undibacterium)
- 科未定
- (Aquabacterium)
- (Aquincola)
- (Ideonella)
- 纖髮菌屬(Leptothrix)
- (Methylibium)
- (Mitsuaria)
- (Paucibacter)
- (Roseateles)
- 紅長命菌屬(Rubrivivax)
- (Sphaerotilus)
- (Tepidicella)
- (Tepidimonas)
- (Thiobacter)
- 硫單胞菌屬(Thiomonas)
- (Xylophilus)
- 產鹼菌科(Alcaligenaceae)
- 嗜氫菌目(Hydrogenophilales)
- 嗜氫菌科(Hydrogenophilaceae)
- 嗜氫菌屬(Hydrogenophilus)
- (Petrobacter)
- (Tepidiphilus)
- 硫桿狀菌屬(Thiobacillus)
- 嗜氫菌科(Hydrogenophilaceae)
- 嗜甲基菌目(Methylophilales)
- 嗜甲基菌科(Methylophilaceae)
- (Methylobacillus)
- 嗜甲基菌屬(Methylophilus)
- (Methylotenera)
- (Methylovorus)
- 嗜甲基菌科(Methylophilaceae)
- 奈瑟菌目(Neisseriales)
- 奈瑟菌科(Neisseriaceae)
- (Alysiella)
- (Andreprevotia)
- 水螺菌屬(Aquaspirillum)
- (Aquitalea)
- (Bergeriella)
- (Chitinibacter)
- (Chitinilyticum)
- 色桿菌屬(Chromobacterium)
- (Conchiformibius)
- (Deefgea)
- 艾肯氏菌屬(Eikenella)
- (Formivibrio)
- (Gulbenkiania)
- (Iodobacter)
- 金氏菌屬(Kingella)
- 鷗桿菌屬(Laribacter)
- (Leeia)
- (Microvirgula)
- (Morococcus)
- 奈瑟菌屬(Neisseria)
- (Paludibacterium)
- (Prolinoborus)
- (Silvimonas)
- (Simonsiella)
- (Uruburuella)
- (Vitreoscilla)
- (Vogesella)
- 奈瑟菌科(Neisseriaceae)
- 亞硝化單胞菌目(Nitrosomonadales)
- 嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)
- 嘉利翁氏菌屬(Gallionella)
- 亞硝化單胞菌科(Nitrosomonadaceae)
- 亞硝化葉菌屬(Nitrosolobus)
- 亞硝化單胞菌屬(Nitrosomonas)
- 亞硝化螺旋菌屬(Nitrosospira)
- 螺菌科(Spirillaceae)
- 螺菌屬(Spirillum)
- 嘉利翁氏菌科(Gallionellaceae)
- 普羅卡桿菌目(Procabacteriales)*
- 普羅卡桿菌科(Procabacteriaceae)*
- 普羅卡桿菌屬(Procabacter)*
- 普羅卡桿菌科(Procabacteriaceae)*
- 紅環菌目(Rhodocyclales)
- 紅環菌科(Rhodocyclaceae)
- 固氮弓菌屬(Azoarcus)
- (Azonexus)
- (Azospira)
- (Azovibrio)
- (Dechloromonas)
- (Dechlorosoma)
- (Denitratisoma)
- (Ferribacterium)
- (Methyloversatilis)
- 丙酸桿菌屬(Propionibacter)
- (Propionivibrio)
- (Quatrionicoccus)
- 紅環菌屬(Rhodocyclus)
- (Shinella)
- (Sterolibacterium)
- 陶厄氏菌屬(Thauera)
- (Uliginosibacterium)
- 動膠菌屬(Zoogloea)
- 紅環菌科(Rhodocyclaceae)
δ-變形菌綱(Deltaproteobacteria)[编辑]
- 蛭弧菌目(Bdellovibrionales)
- (Bacteriovoracaceae)
- (Bacteriovorax)
- (Peredibacter)
- 蛭弧菌科(Bdellovibrionaceae)
- 蛭弧菌屬(Bdellovibrio)
- (Micavibrio)
- (Vampirovibrio)
- (Bacteriovoracaceae)
- 脫硫盒菌目(Desulfarculales)
- 脫硫盒菌科(Desulfarculaceae)
- 脫硫盒菌屬(Desulfarculus)
- 脫硫盒菌科(Desulfarculaceae)
- 脫硫桿菌目(Desulfobacterales)
- 脫硫桿菌科(Desulfobacteraceae)
- (Desulfatibacillum)
- (Desulfatiferula)
- (Desulfatirhabdium)
- 脫硫桿菌屬(Desulfobacter)
- (Desulfobacterium)
- (Desulfobacula)
- (Desulfobotulus)*
- (Desulfocella)
- (Desulfococcus)
- (Desulfofaba)
- (Desulfofrigus)
- (Desulfomusa)
- (Desulfonema)
- (Desulforegula)
- (Desulfosarcina)
- (Desulfospira)
- (Desulfotignum)
- (Desulfobulbaceae)
- (Desulfobulbus)
- (Desulfocapsa)
- (Desulfofustis)
- (Desulfopila)
- (Desulforhopalus)
- (Desulfotalea)
- (Nitrospinaceae)
- (Nitrospina)
- 脫硫桿菌科(Desulfobacteraceae)
- 脫硫弧菌目(Desulfovibrionales)
- (Desulfohalobiaceae)
- (Desulfohalobium)
- (Desulfonatronovibrio)
- (Desulfonauticus)
- (Desulfothermus)
- (Desulfovermiculus)
- (Desulfomicrobiaceae)
- (Desulfomicrobium)
- (Desulfonatronaceae)
- (Desulfonatronum)
- 脫硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)
- (Bilophila)
- (Desulfomonas)
- 脫硫弧菌屬(Desulfovibrio)
- (Lawsonia)
- (Desulfohalobiaceae)
- 硫還原菌目(Desulfurellales)
- 硫還原菌科(Desulfurellaceae)
- 硫還原菌屬(Desulfurella)
- (Hippea)
- 硫還原菌科(Desulfurellaceae)
- 除硫單胞菌目(Desulfuromonadales)
- 除硫單胞菌科(Desulfuromonadaceae)
- 除硫單胞菌屬(Desulfuromonas)
- (Desulfuromusa)
- (Malonomonas)
- (Pelobacter)
- 地桿菌科(Geobacteraceae)
- (Geoalkalibacter)
- 地桿菌屬(Geobacter)
- (Geopsychrobacter)
- (Geothermobacter)
- (Trichlorobacter)
- 除硫單胞菌科(Desulfuromonadaceae)
- 黏球菌目(Myxococcales)
- 孢囊桿菌亞目(Cystobacterineae)
- 孢囊桿菌科(Cystobacteraceae)
- (Anaeromyxobacter)
- (Archangium)
- 孢囊桿菌屬(Cystobacter)
- (Hyalangium)
- (Melittangium)
- (Stigmatella)
- 黏球菌科(Myxococcaceae)
- (Angiococcus)
- (Corallococcus)
- 黏球菌屬(Myxococcus)
- (Pyxidicoccus)
- 孢囊桿菌科(Cystobacteraceae)
- 侏囊菌亞目(Nannocystineae)
- (Haliangiaceae)
- (Haliangium)
- (Kofleriaceae)
- (Kofleria)
- 侏囊菌科(Nannocystaceae)
- (Enhygromyxa)
- 侏囊菌屬(Nannocystis)
- (Plesiocystis)
- (Haliangiaceae)
- 堆囊菌亞目(Sorangineae)
- 多囊菌科(Polyangiaceae)
- (Byssovorax)
- (Chondromyces)
- (Haploangium)*
- (Jahnella)
- 多囊菌屬(Polyangium)
- 堆囊菌屬(Sorangium)
- 多囊菌科(Polyangiaceae)
- 孢囊桿菌亞目(Cystobacterineae)
- 互營桿菌目(Syntrophobacterales)
- 互營菌科(Syntrophaceae)
- (Desulfobacca)
- (Desulfomonile)
- (Smithella)
- 互營菌屬(Syntrophus)
- 互營桿菌科(Syntrophobacteraceae)
- (Desulfacinum)
- (Desulfoglaeba)
- (Desulforhabdus)
- (Desulfovirga)
- 互營桿菌屬(Syntrophobacter)
- (Thermodesulforhabdus)
- 互營菌科(Syntrophaceae)
ε-變形菌綱(Epsilonproteobacteria)[编辑]
- 彎曲菌目(Campylobacterales)
- (Nautiliales)
- (Nautiliaceae)
- (Caminibacter)
- (Lebetimonas)
- (Nautilia)
- (Nitratifractor)
- (Nitratiruptor)
- (Thioreductor)
- (Nautiliaceae)
γ-變形菌綱(Gammaproteobacteria)[编辑]
- 酸硫桿狀菌目(Acidithiobacillales)
- 酸硫桿狀菌科(Acidithiobacillaceae)
- 酸硫桿狀菌屬(Acidithiobacillus)
- 熱硫桿狀菌科(Thermithiobacillaceae)
- 熱硫桿狀菌屬(Thermithiobacillus)
- 酸硫桿狀菌科(Acidithiobacillaceae)
- 氣單胞菌目(Aeromonadales)
- 氣單胞菌科(Aeromonadaceae)
- 氣單胞菌屬(Aeromonas)
- (Oceanimonas)
- (Oceanisphaera)
- (Tolumonas)
- (Zobellella)
- 琥珀酸弧菌科(Succinivibrionaceae)
- 厭氧螺菌屬(Anaerobiospirillum)
- 反芻桿菌屬(Ruminobacter)
- 琥珀酸單胞菌屬(Succinimonas)
- 琥珀酸弧菌屬(Succinivibrio)
- 氣單胞菌科(Aeromonadaceae)
- 交替單胞菌目(Alteromonadales)
- 交替單胞菌科(Alteromonadaceae)
- (Aestuariibacter)
- (Agarivorans)
- (Alishewanella)
- 交替單胞菌屬(Alteromonas)
- (Glaciecola)
- (Marinimicrobium)
- 海桿菌屬(Marinobacter)
- 海細菌屬(Marinobacterium)
- 產微球莖菌屬(Microbulbifer)
- (Saccharophagus)
- (Salinimonas)
- (Colwelliaceae)
- (Colwellia)
- (Thalassomonas)
- (Ferrimonadaceae)
- (Ferrimonas)
- (Paraferrimonas)
- (Idiomarinaceae)
- (Idiomarina)
- (Pseudidiomarina)
- (Moritellaceae)
- (Moritella)
- 假交替單胞菌科(Pseudoalteromonadaceae)
- (Algicola)
- 假交替單胞菌屬(Pseudoalteromonas)
- 冷單胞菌科(Psychromonadaceae)
- 冷單胞菌屬(Psychromonas)
- 希萬氏菌科(Shewanellaceae)
- 希萬氏菌屬(Shewanella)
- 科未定
- (Teredinibacter)
- (Endobugula)*
- 交替單胞菌科(Alteromonadaceae)
- 心桿菌目(Cardiobacteriales)
- 心桿菌科(Cardiobacteriaceae)
- 心桿菌屬(Cardiobacterium)
- (Dichelobacter)
- (Suttonella)
- 心桿菌科(Cardiobacteriaceae)
- 着色菌目(Chromatiales)
- 着色菌科(Chromatiaceae)
- (Allochromatium)
- (Amoebobacter)
- 着色菌屬(Chromatium)
- 鹽着色菌屬(Halochromatium)
- (Isochromatium)
- (Lamprobacter)
- (Lamprocystis)
- (Marichromatium)
- 亞硝化球菌屬(Nitrosococcus)
- 芬尼氏菌屬(Pfennigia)
- 棍着色菌屬(Rhabdochromatium)
- (Rheinheimera)
- 熱着色菌屬(Thermochromatium)
- 硫鹼球菌屬(Thioalkalicoccus)
- 硫橄欖菌屬(Thiobaca)
- 硫匣菌屬(Thiocapsa)
- 硫球菌屬(Thiococcus)
- 硫囊菌屬(Thiocystis)
- 硫網菌屬(Thiodictyon)
- 硫黃球菌屬(Thioflavicoccus)
- 硫鹽匣菌屬(Thiohalocapsa)
- (Thiolamprovum)
- (Thiopedia)
- 硫紅球菌屬(Thiorhodococcus)
- 硫紅弧菌屬(Thiorhodovibrio)
- 硫螺菌屬(Thiospirillum)
- 外硫紅螺旋菌科(Ectothiorhodospiraceae)
- 鹼湖生菌屬(Alkalilimnicola)
- 鹼螺菌屬(Alkalispirillum)
- (Aquisalimonas)
- (Arhodomonas)
- (Ectothiorhodosinus)
- 外硫紅螺旋菌屬(Ectothiorhodospira)
- 鹽紅螺旋菌屬(Halorhodospira)
- (Natronocella)
- 硝化球菌屬(Nitrococcus)
- 硫鹼螺旋菌屬(Thioalkalispira)
- 硫鹼弧菌屬(Thialkalivibrio)
- 硫紅螺旋菌屬(Thiorhodospira)
- 顆粒狀球菌科(Granulosicoccaceae)
- 顆粒狀球菌屬(Granulosicoccus)
- 鹽硫桿狀菌科(Halothiobacillaceae)
- 鹽硫桿狀菌屬(Halothiobacillus)
- (Thiovirga)
- 着色菌科(Chromatiaceae)
- 腸桿菌目(Enterobacteriales)
- 腸桿菌科(Enterobacteriaceae)
- (Arsenophonus)
- (Brenneria)
- 布赫納氏菌屬(Buchnera)
- (Budvicia)
- 布丘氏菌屬(Buttiauxella)
- (Calymmatobacterium)
- 西地西菌屬(Cedecea)
- 檸檬酸桿菌屬(Citrobacter)
- (Dickeya)
- 愛德華氏菌屬(Edwardsiella)
- 腸桿菌屬(Enterobacter)
- 歐文氏菌屬(Erwinia)
- 埃希氏菌屬(Escherichia) (包含大腸桿菌)
- (Ewingella)
- 哈夫尼菌屬(Hafnia)
- 克雷伯氏菌屬(Klebsiella)
- 克呂沃氏菌屬(Kluyvera)
- (Leclercia)
- (Leminorella)
- (Levinea)
- (Moellerella)
- (Morganella)
- (Obesumbacterium)
- 泛菌屬(Pantoea)
- (Pectobacterium)
- (Phlomobacter)*
- (Photorhabdus)
- 鄰單胞菌屬(Plesiomonas)
- (Pragia)
- 變形桿菌屬(Proteus) (註:或譯作“變形菌屬”,此處把“變形菌”一詞留給Proteobacteria)
- 普羅維登斯菌屬(Providencia)
- (Rahnella)
- (Raoultella)
- 糖桿菌屬(Saccharobacter)
- 沙門氏菌屬(Salmonella)
- (Samsonia)
- 沙雷氏菌屬(Serratia)
- 志賀氏菌屬(Shigella)
- (Sodalis)
- (Tatumella)
- (Thorsellia)
- (Trabulsiella)
- (Wigglesworthia)
- 致病桿菌屬(Xenorhabdus)
- 耶爾辛氏菌屬(Yersinia) (包含鼠疫桿菌)
- (Yokenella)
- 腸桿菌科(Enterobacteriaceae)
- 軍團菌目(Legionellales)
- 甲基球菌目(Methylococcales)
- 甲基球菌科(Methylococcaceae)
- 甲基桿菌屬(Methylobacter)
- 甲基暖菌屬(Methylocaldum)
- 甲基球菌屬(Methylococcus)
- 甲基鹽菌屬(Methylohalobius)
- 甲基微菌屬(Methylomicrobium)
- 甲基單胞菌屬(Methylomonas)
- 甲基八疊球菌屬(Methylosarcina)
- (Methylosoma)
- 甲基球形菌屬(Methylosphaera)
- 甲基熱菌屬(Methylothermus)
- 甲基球菌科(Methylococcaceae)
- 海洋螺菌目(Oceanospirillales)
- 食鹼菌科(Alcanivoraceae)
- 食鹼菌屬(Alcanivorax)
- (Fundibacter)
- (Kangiella)
- 河氏菌科(Hahellaceae)
- (Endozoicomonas)
- 河氏菌屬(Hahella)
- (Halospina)
- (Zooshikella)
- 鹽單胞菌科(Halomonadaceae)
- (Carnimonas)
- 色鹽桿菌屬(Chromohalobacter)
- (Cobetia)
- (Deleya)
- 鹽單胞菌屬(Halomonas)
- (Halotalea)
- (Halovibrio)
- (Modicisalibacter)
- (Salicola)
- (Volcaniella)
- 發酵桿菌屬(Zymobacter)
- 岸生菌科(Litoricolaceae)
- 岸生菌屬(Litoricola)
- 海洋螺菌科(Oceanospirillaceae)
- (Amphritea)
- 巴氏髮菌屬(Balneatrix)
- 海單胞菌屬(Marinomonas)
- 海螺菌屬(Marinospirillum)
- (Neptuniibacter)
- (Neptunomonas)
- (Nitrincola)
- 海洋桿菌屬(Oceanobacter)
- 海洋螺菌屬(Oceanospirillum)
- 油螺旋菌屬(Oleispira)
- 假螺菌屬(Pseudospirillum)
- (Reinekea)
- (Thalassolituus)
- 嗜油菌科(Oleiphilaceae)
- 嗜油菌屬(Oleiphilus)
- 糖螺菌科(Saccharospirillaceae)
- 糖螺菌屬(Saccharospirillum)
- 食鹼菌科(Alcanivoraceae)
- 巴斯德氏菌目(Pasteurellales)
- 假單胞菌目(Pseudomonadales)
- 莫拉菌科(Moraxellaceae)
- 假單胞菌科(Pseudomonadaceae)
- 鹹水球形菌目(Salinisphaerales)
- 鹹水球形菌科(Salinisphaeraceae)
- 鹹水球形菌屬(Salinisphaera)
- 鹹水球形菌科(Salinisphaeraceae)
- 硫髮菌目(Thiotrichales)
- (Francisellaceae)
- (Francisella)
- 魚立克次體科(Piscirickettsiaceae)
- (Cycloclasticus)
- (Hydrogenovibrio)
- (Methylophaga)
- 魚立克次體屬(Piscirickettsia)
- (Sulfurivirga)
- (Thioalkalimicrobium)
- (Thiomicrospira)
- 硫髮菌科(Thiotrichaceae)
- 科未定
- (Caedibacter)
- (Fangia)
- (Francisellaceae)
- 弧菌目(Vibrionales)
- 黃色單胞菌目(Xanthomonadales)
- 華桿菌科(Sinobacteraceae)
- (Hydrocarboniphaga)
- (Nevskia)
- 華桿菌屬(Sinobacter)
- 黃色單胞菌科(Xanthomonadaceae)
- 水單胞菌屬(Aquimonas)
- (Arenimonas)
- (Aspromonas)
- (Dokdonella)
- (Dyella)
- (Frateuria)
- (Fulvimonas)
- (Ignatzschineria)
- (Luteibacter)
- (Luteimonas)
- (Lysobacter)
- 假黃色單胞菌屬(Pseudoxanthomonas)
- (Rhodanobacter)
- (Silanimonas)
- (Stenotrophomonas)
- 熱單胞菌屬(Thermomonas)
- 黃色單胞菌屬(Xanthomonas)
- (Xylella)
- 華桿菌科(Sinobacteraceae)
- 目未定
- 鹼單胞菌屬(Alkalimonas)
- (Bowmanella)
- 聚集桿菌屬(Congregibacter)*
- (Methylohalomonas)
- (Methylonatrum)
- (Sedimenticola)
- (Solimonas)
- (Thiohalomonas)
- (Thiohalophilus)
螺旋體門(Spirochaetes)[编辑]
螺旋體綱(Spirochaetes)[编辑]
- 螺旋體目(Spirochaetales)
柔膜菌門(Tenericutes)[编辑]
注:此處Tenericutes不同於原先基於形態分類的“軟壁菌門”,而僅包括枝原體及其基於分子演化分類的親屬
柔膜菌綱(Mollicutes)[编辑]
- 無膽甾原體目(Acholeplasmatales)
- 無膽甾原體科(Acholeplasmataceae)
- 無膽甾原體屬(Acholeplasma)
- 植原體屬(Phytoplasma)*
- 無膽甾原體科(Acholeplasmataceae)
- 厭氧原體目(Anaeroplasmatales)
- 厭氧原體科(Anaeroplasmataceae)
- 厭氧原體屬(Anaeroplasma)
- 無甾醇原體屬(Asteroleplasma)
- 厭氧原體科(Anaeroplasmataceae)
- 蟲原體目(Entomoplasmatales)
- 蟲原體科(Entomoplasmataceae)
- 蟲原體屬(Entomoplasma)
- 中間原體屬(Mesoplasma)
- 螺原體科(Spiroplasmataceae)
- 螺原體屬(Spiroplasma)
- 蟲原體科(Entomoplasmataceae)
- 枝原體目(Mycoplasmatales)
- 目未定
- 丹毒絲菌科(Erysipelothrichaceae)
- (Bulleidia)
- 丹毒絲菌屬(Erysipelothrix)
- (Holdemania)
- (Solobacterium)
- 丹毒絲菌科(Erysipelothrichaceae)
熱脫硫桿菌門(Thermodesulfobacteria)[编辑]
熱脫硫桿菌綱(Thermodesulfobacteria)[编辑]
- 熱脫硫桿菌目(Thermodesulfobacteriales)
- 熱脫硫桿菌科(Thermodesulfobacteriaceae)
- (Thermodesulfatator)
- 熱脫硫桿菌屬(Thermodesulfobacterium)
- 熱脫硫桿菌科(Thermodesulfobacteriaceae)
熱微菌門(Thermomicrobia)[编辑]
熱微菌綱(Thermomicrobia)[编辑]
- 熱微菌目(Thermomicrobiales)
- 熱微菌科(Thermomicrobiaceae)
- 熱微菌屬(Thermomicrobium)
- 熱微菌科(Thermomicrobiaceae)
熱袍菌門(Thermotogae)[编辑]
熱袍菌綱(Thermotogae)[编辑]
- 熱袍菌目(Thermotogales)
- 熱袍菌科(Thermotogaceae)
- (Fervidobacterium)
- (Geotoga)
- (Marinitoga)
- (Petrotoga)
- (Thermosipho)
- 熱袍菌屬(Thermotoga)
- 熱袍菌科(Thermotogaceae)
疣微菌門(Verrucomicrobia)[编辑]
豐祐菌綱(Opitutae)[编辑]
(註:正確形式似應爲Opituti)
- 豐祐菌目(Opitutales)
- 豐祐菌科(Opitutaceae)
- 交替球菌屬(Alterococcus)
- 豐祐菌屬(Opitutus)
- 豐祐菌科(Opitutaceae)
- 紫紅球菌目(Puniceicoccales)
- 紫紅球菌科(Puniceicoccaceae)
- (Cerasicoccus)
- (Coraliomargarita)
- (Pelagicoccus)
- 紫紅球菌屬(Puniceicoccus)
- 紫紅球菌科(Puniceicoccaceae)
疣微菌綱(Verrucomicrobiae)[编辑]
- 疣微菌目(Verrucomicrobiales)
門未定[编辑]
- (Jonquetella)
纖線桿菌綱(Ktedonobacteria)[编辑]
- 纖線桿菌目(Ktedonobacterales)
- 纖線桿菌科(Ktedonobacteraceae)
- 纖線桿菌屬(Ktedonobacter)
- 纖線桿菌科(Ktedonobacteraceae)
註釋[编辑]
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