深海病毒科
深海病毒科
| |
|---|---|
病毒分类 
| |
| （未分级）： | 病毒 Virus |
| 域： | 核糖病毒域 Riboviria |
| 界： | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
| 门： | 小核糖病毒门 Pisuviricota |
| 纲： | 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes |
| 目： | 套式病毒目 Nidovirales |
| 科： | 深海病毒科 Abyssoviridae |
| 属： | 甲型深海病毒属 Alphaabyssovirus |
| 亚属与种 | |
| |
深海病毒科（学名：Abyssoviridae）是网巢病毒目的一个科，为具包膜的正单链RNA病毒，本科为一单型分类单元，仅包含甲型深海病毒属（Alphaabyssovirus）一个属，该属亦为单型，仅有海兔深海病毒一型（Aplysia abyssovirus 1，AAbV）一种[1]，为感染加州海兔的病毒，由美国国家生物技术资讯中心（NCBI）公开的转录组霰弹枪序列组装(transcriptome shotgun assembly) 与表现序列标签资料库中经BLAST比对发现，于2018年发表[2]。
命名
[编辑]深海病毒科的学名得名自英文的"abyss"（意指“深渊”），除了指本科病毒感染的宿主海兔生存于海洋外，还指传说中居于地下深处的苏美神祇阿勃祖，亦指此病毒为透过深度定序技术自序列资料库中发现[2]。
病毒学
[编辑]
海兔深海病毒一型的基因组长35,913nt，为已知RNA病毒中基因组大小次大者，仅次于同属网巢病毒目之涡虫分泌细胞网巢病毒（PSCNV）的41,103nt[2][3]。AAbV的基因组包含两个开放阅读框（ORF），一为典型网巢病毒的ORF1a与ORF1b融合而成，一为其3'端编码结构蛋白的开放阅读框ORF2，另外还有长74nt的5'UTR与长964nt的3'UTR[2]。
相较于其他网巢病毒的ORF1a与ORF1b间有一促进-1核糖体移码的序列，AAbV的ORF1中与ORF1a和ORF1b同源的区域间有一同框的终止密码子UGA与一促进转译连读的序列，使部分核糖体转译至此时发生连读而继续转译ORF1b的序列，以此调控ORF1b编码蛋白的表现[2]。
参考文献
[编辑]
- ^ Virus Taxonomy: 2018 Release. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). October 2018 [26 January 2019]. （原始内容存档于4 March 2018）.
- ^ 2.0 2.1 2.2 2.3 2.4 Bukhari, Khulud; Mulley, Geraldine; Gulyaeva, Anastasia A.; Zhao, Lanying; Shu, Guocheng; Jiang, Jianping; Neuman, Benjamin W. Description and initial characterization of metatranscriptomic nidovirus-like genomes from the proposed new family Abyssoviridae, and from a sister group to the Coronavirinae, the proposed genus Alphaletovirus.. Virology. 2018, 524: 160–171. ISSN 0042-6822. OCLC 7856217008. PMC 7112036
. PMID 30199753. doi:10.1016/j.virol.2018.08.010 （英语）.
- ^ Saberi, Amir; Gulyaeva, Anastasia A.; Brubacher, John L.; Newmark, Phillip A.; Gorbalenya, Alexander E. A planarian nidovirus expands the limits of RNA genome size. PLOS Pathogens. 2018-11-01, 14 (11): e1007314. PMC 6211748 . PMID 30383829. doi:10.1371/journal.ppat.1007314.
