鞭毛是很多單細胞生物和一些多細胞生物細胞表面像鞭子一樣的細胞器，用於運動及其它一些功能。在三個域中，鞭毛的結構各不相同。細菌的鞭毛是螺旋狀的纖維，像螺釘一樣旋轉。古菌的鞭毛表面上和細菌的類似，但很多細節不同，和細菌的鞭毛可能也不是同源的。真核生物，比如動物、植物、原生生物細胞的鞭毛是細胞表面結構複雜的突出物，像鞭子一樣來回抽打。不同種類的細菌有不同的數目的鞭毛。圖為革蘭氏陰性菌的鞭毛。
