CG抑制
CG抑制（CG suppression）是指多数脊椎动物基因组中CpG位点的比例低于期望值的现象。人类基因组序列中胞嘧啶（C）与鸟嘌呤（G）各占了约21%，因此CpG位点的比例期望值应为约4%（0.21x0.21），但实际上仅有低于1%[1]。此现象是胞嘧啶脱氨的转换突变所致，被甲基化的胞嘧啶（5-甲基胞嘧啶）会自发脱氨转为转为胸腺嘧啶（T），若未及时在DNA复制前修复，该位点即发生C-T的转换突变，此为人类细胞中最常发生的突变种类[2]。
病毒
[编辑]许多感染脊椎动物的RNA病毒也有CG抑制的现象[3]。有研究分析甲型流感病毒的CG位点，发现其CG限制从鸟类跳跃至人类宿主后CG抑制变得更加明显（即CpG位点比例进一步降低），而人类基因组CG抑制的程度比鸟类还高，因此此现象可能反映这些病毒在宿主体内受到一定的选汰压力，使其CpG位点的比例改变[4]。人类免疫缺乏病毒也有CG抑制的现象，有研究发现人类细胞的锌指抗病毒蛋白（zinc-finger antiviral protein，ZAP）可与RNA中的CpG点结合，并可能以此为区分自我与外来RNA的机制，因人类基因组的CpG位点数量很低，ZAP与与RNA中CpG位点结合以抑制病毒，此机制或对RNA病毒形成选汰压力，使其基因组也发生CG抑制，降低CpG位点含量以逃避宿主免疫反应[5]。
参见
[编辑]参考文献
[编辑]
- ^ International Human Genome Sequencing Consortium; et al. Initial sequencing and analysis of the human genome (PDF). Nature. February 2001, 409 (6822): 860–921 [2021-04-23]. PMID 11237011. doi:10.1038/35057062. （原始内容 (PDF)存档于2020-07-29）.
- ^ Krokan HE, Drabløs F, Slupphaug G. Uracil in DNA--occurrence, consequences and repair.. Oncogene. 2002, 21 (58): 8935–48. PMID 12483510. doi:10.1038/sj.onc.1205996.
- ^ Cheng X, Virk N, Chen W, Ji S, Ji S, Sun Y; et al. CpG usage in RNA viruses: data and hypotheses.. PLoS One. 2013, 8 (9): e74109. PMC 3781069
. PMID 24086312. doi:10.1371/journal.pone.0074109.
- ^ Greenbaum BD, Levine AJ, Bhanot G, Rabadan R. Patterns of evolution and host gene mimicry in influenza and other RNA viruses.. PLoS Pathog. 2008, 4 (6): e1000079. PMC 2390760 . PMID 18535658. doi:10.1371/journal.ppat.1000079.
- ^ Takata MA, Gonçalves-Carneiro D, Zang TM, Soll SJ, York A, Blanco-Melo D; et al. CG dinucleotide suppression enables antiviral defence targeting non-self RNA.. Nature. 2017, 550 (7674): 124–127. PMC 6592701 . PMID 28953888. doi:10.1038/nature24039.
