王萬祥(?—?),字瑞宇,為中國清朝武官官員,本籍陝西會寧(今甘肅會寧)。
王萬祥曾從郭姓。順治年間,王進寶為游擊時,應募入伍,官至副將。平定三藩之亂時,跟隨王進寶克臨洮,通渭,入漢中,有戰功,升至定海總兵。1697年(康熙36年)奉旨調任前往台灣,接任王國興擔任台灣鎮總兵。是台灣清治時期此期間,受台灣道制約的台灣地區最高軍事首長。官至福建陸路提督。卒後贈太子少保,諡壯敏。