編碼區

基因的編碼區（英語：Coding region），亦稱為「編碼序列」（Coding sequence）或「CDS」（Coding DNA Sequence），是指DNA或RNA中由外顯子組成，編碼蛋白質的部分。該區域的邊界範圍從靠近5′末端的起始密碼子開始，到靠近3′末端的終止密碼子為止。mRNA的編碼區範圍位於5′非轉譯區和部分同樣為外顯子的3′非轉譯區之間。^[1]

某個生物體的編碼區是指該生物由基因編碼區組成的基因組的總和。^[2]

編碼序列注釋

雖然識別DNA序列內的開放閱讀框簡單明了，但識別編碼序列卻並非如此，因為細胞只會把所有開放閱讀框的一部分轉譯為蛋白質。^[3]目前CDS預測透過對細胞mRNA取樣定序完成，但要判斷給定mRNA究竟哪一部分實際轉譯為了蛋白質，目前仍是問題。CDS預測屬於基因預測的一部分，後者不僅包括對編碼蛋白質的DNA序列預測，也包括對其它功能元件，如RNA基因和調節序列的預測。

參見

參考文獻

^ Twyman, Richard. Gene Structure. The Wellcome Trust. 1 August 2003 [6 April 2003]. （原始內容存檔於2007年3月28日）.
^ Goto, Mami; et al. Analysis of CpG Dinucleotide Frequency in Bacterial Genomes with Respect to Genomic Regions and Codon (PDF). The Fourth Annual International Conference on Computational Molecular Biology, Tokyo, Japan. April 8, 2000 [6 April 2009]. （原始內容 (PDF)存檔於2003年6月22日）.
^ Furuno, Masaaki; Kasukawa, Takeya; Saito, Rintaro; Adachi, Jun; Suzuki, Harukazu; Baldarelli, Richard; Hayashizaki, Yoshihide; Okazaki, Yasushi. CDS Annotation in Full-Length cDNA Sequence (PDF). Genome Research (Cold Spring Harbor Laboratory Press). September 2011, 21 (9): 1478–1487 [18 September 2011]. doi:10.1101/gr.1060303. （原始內容 (PDF)存檔於2019-10-01）.

[1] Twyman, Richard. Gene Structure. The Wellcome Trust. 1 August 2003 [6 April 2003]. （原始內容存檔於2007年3月28日）.

[2] Goto, Mami; et al. Analysis of CpG Dinucleotide Frequency in Bacterial Genomes with Respect to Genomic Regions and Codon (PDF). The Fourth Annual International Conference on Computational Molecular Biology, Tokyo, Japan. April 8, 2000 [6 April 2009]. （原始內容 (PDF)存檔於2003年6月22日）.

[3] Furuno, Masaaki; Kasukawa, Takeya; Saito, Rintaro; Adachi, Jun; Suzuki, Harukazu; Baldarelli, Richard; Hayashizaki, Yoshihide; Okazaki, Yasushi. CDS Annotation in Full-Length cDNA Sequence (PDF). Genome Research (Cold Spring Harbor Laboratory Press). September 2011, 21 (9): 1478–1487 [18 September 2011]. doi:10.1101/gr.1060303. （原始內容 (PDF)存檔於2019-10-01）.

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