武库清吏司,兵部官署名称。
明朝洪武二十九年(1396年)改库部为武库清吏司。管理戎器、符勘、尺籍、武学、柴薪、皂隶。设郎中一人正五品,员外郎一人从五品,主事二人正六品,南京兵部亦设。清朝顺治元年(1644年),沿置武库清吏司,设郎中三人:满洲二人,汉族一人;员外郎二人:满洲一人,蒙古一人;主事二人:满洲一人,汉族一人。掌管全国兵籍、军器,武科举、编发、戍军。下设督学科、编军科、俸粮科。