兔冠狀病毒HKU14

兔冠狀病毒HKU14
病毒分類
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
种：	兔冠狀病毒HKU14 Rabbit Coronavirus HKU14

兔冠狀病毒HKU14（Rabbit Coronavirus HKU14、RbCoV HKU14）是乙型冠狀病毒屬的一種病毒，在中國廣州市場中的家兔體內被發現，於2012年由香港大學的研究人員發表^[1]。

分類

兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1與中國鼠冠狀病毒HKU24皆是乙型冠狀病毒屬支序A（lineage A）的病毒，此演化支的病毒基因組中皆編碼血细胞凝集素酯酶（英语：Hemagglutinin esterase）（HE），其他冠狀病毒則無^[2]^[3]。支序A中兔冠狀病毒HKU14與乙型冠狀病毒1型的關係接近（較中國鼠冠狀病毒HKU24與乙型冠狀病毒1型的關係更為接近），因複製酶保守區域的胺基酸序列相似度小於90%而被認定是獨立物種^[1]，不過仍有研究者將其視為乙型冠狀病毒1型的一個分型^[4]。分子鐘分析顯示兔冠狀病毒HKU14是較近期才起源的病毒，可能於2002年左右才由共同祖先分支^[1]。

基因組

兔冠狀病毒HKU14的基因組約長31000nt，編碼冠狀病毒皆有的複製酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）與衣殼蛋白（N）等四種結構蛋白，另外還有血細胞凝集素酯酶（英语：Hemagglutinin esterase）（HE）以及NS2a和NS5a兩種輔助蛋白，其基因順序為1ab-NS2a-HE-S-NS5a-E-M-N。乙型冠狀病毒屬支序A的病毒除人類冠狀病毒HKU1外，在1ab與HE間都有編碼輔助蛋白NS2a，不過兔冠狀病毒HKU14的NS2a並非像支序A的其他病毒一樣是單一開放閱讀框，而是斷裂成3–4個較小的開放閱讀框^[1]。

其他兔冠狀病毒

1961年有北歐科學家發現用來培養梅毒螺旋體的兔子被未知病原感染，並偶爾造成死亡，1970年代此感染的死亡率一度高達七成，後來約翰霍普金斯大學研究證實此病原為冠狀病毒，但初步實驗結果顯示此病毒應屬甲型冠狀病毒屬，和兔冠狀病毒HKU14無關^[1]^[5]。

參考文獻

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 ^1.3 ^1.4 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Fan, R. Y. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. F.; Tsang, A. K. L.; Lai, K. K. Y.; Chan, K.-H.; Che, X.-Y.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y. Isolation and Characterization of a Novel Betacoronavirus Subgroup A Coronavirus, Rabbit Coronavirus HKU14, from Domestic Rabbits. Journal of Virology. 2012, 86 (10): 5481–5496. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06927-11.
^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).
^ Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14.
^ Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008.
^ Small, J. David; Woods, Robert D. Relatedness of Rabbit Coronavirus to Other Coronaviruses 218: 521–527. 1987. ISSN 0065-2598. doi:10.1007/978-1-4684-1280-2_68.

[LauWoo2012-1] 1.0 ^1.1 ^1.2 ^1.3 ^1.4 Lau, S. K. P.; Woo, P. C. Y.; Yip, C. C. Y.; Fan, R. Y. Y.; Huang, Y.; Wang, M.; Guo, R.; Lam, C. S. F.; Tsang, A. K. L.; Lai, K. K. Y.; Chan, K.-H.; Che, X.-Y.; Zheng, B.-J.; Yuen, K.-Y. Isolation and Characterization of a Novel Betacoronavirus Subgroup A Coronavirus, Rabbit Coronavirus HKU14, from Domestic Rabbits. Journal of Virology. 2012, 86 (10): 5481–5496. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.06927-11.

[:0-2] Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).

[LauWoo2015-3] Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian; Wang, Ming; Yuen, Kwok-Yung; Sandri-Goldin, R. M. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015, 89 (6): 3076–3092. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.02420-14.

[BakkersLang2017-4] Bakkers, Mark J.G.; Lang, Yifei; Feitsma, Louris J.; Hulswit, Ruben J.G.; de Poot, Stefanie A.H.; van Vliet, Arno L.W.; Margine, Irina; de Groot-Mijnes, Jolanda D.F.; van Kuppeveld, Frank J.M.; Langereis, Martijn A.; Huizinga, Eric G.; de Groot, Raoul J. Betacoronavirus Adaptation to Humans Involved Progressive Loss of Hemagglutinin-Esterase Lectin Activity. Cell Host & Microbe. 2017, 21 (3): 356–366. ISSN 1931-3128. doi:10.1016/j.chom.2017.02.008.

[SmallWoods1987-5] Small, J. David; Woods, Robert D. Relatedness of Rabbit Coronavirus to Other Coronaviruses 218: 521–527. 1987. ISSN 0065-2598. doi:10.1007/978-1-4684-1280-2_68.

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