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嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒

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嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒Infobox info icon.svg
Coronaviruses 004 lores.jpg
病毒分類 e
–未分级– 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 網巢病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种: 嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 Severe acute respiratory
syndrome-related coronavirus
病毒株

嚴重急性呼吸道綜合症相关冠狀病毒(英語:Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus),簡稱SARS相关冠状病毒SARSr-CoV),是冠狀病毒科乙型冠状病毒属的一个[1]该种病毒现有2个可传染人的分型[2]

分型[编辑]

關係圖
 
 
 
 
 
 
嚴重急性呼吸道症候群相關冠狀病毒
SARSr-CoV
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
嚴重急性呼吸道症候群冠狀病毒
SARS-CoV
 
 
 
 
 
嚴重急性呼吸綜合症冠狀病毒2型
SARS-CoV-2

演化樹[编辑]

截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹

16BO133 與SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韓國全羅北道 (2016年採集、2019年發表)[7]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中國湖北宜昌 (2004年採集、2005年發表)[8]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中國廣東 (2004年採集、2005年發表、2010年又發表若干新病毒株)[9]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中國雲南保山 (2011年採集、2014年發表)[10]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中國廣西南寧 (2004年採集、2005年發表)[8]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[11]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中國雲南禄丰 (2013年採集、2015年發表)[11]

SHC014 95.4 % · 中華菊頭蝠 · 中國雲南昆明 (2011年採集、2013年發表)[12]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2012年採集、2013年發表)[12]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中國雲南昆明 (2013年採集、2016年發表)[13]

果子貍SARS冠狀病毒 99.8 % · 果子狸 · 中國廣東[9]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人類病毒


SARS-CoV-2與相關病毒株的系統發生樹[14][15] :

Rc-o319 與SARS-CoV-2相似度81 % · 角菊頭蝠 · 日本岩手县 (2013年採集、2020年發表)[16]

SL-ZXC21 88 % · 小菊頭蝠 · 中國浙江舟山(2015年採集、2018年發表)[17]

SL-ZC45 88 % · 小菊頭蝠 · 中國浙江舟山(2017年採集、2018年發表)[17]

SARSr-CoV-GX 89 % · 馬來穿山甲 · 东南亚 (2017年採集、2020年發表)[18]

SARSr-CoV-GD 91 % · 馬來穿山甲 · 东南亚[18]

RshSTT182 92.6 % · 扁顱菊頭蝠英语Rhinolophus shameli · 柬埔寨上丁省 (2010年採集、2021年發表)[15]

RshSTT200 92.6 % · 扁顱菊頭蝠 · 柬埔寨上丁省 (2010年採集、2021年發表)[15]

RacCS203 91.5 % · 大角菊头蝠英语Rhinolophus acuminatus · 泰国差春騷府 (2020年採集、2021年發表)[14]

RmYN02 93.3 % · 馬來亞菊頭蝠 · 中國雲南勐腊 (2019年採集、2020年發表)[19]

RaTG13 96.2 % · 中菊头蝠 · 中國雲南墨江哈尼族自治县 (2013年採集、2020年發表)[20]

SARS-CoV-2 100 %

SARS-CoV 79%

  蝙蝠病毒
  穿山甲病毒
  人類病毒

参考文献[编辑]

引用[编辑]

  1. ^ Thiel V (editor). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology 1st. Caister Academic Press. 2007. ISBN 978-1-904455-16-5. 
  2. ^ 2.0 2.1 2.2 Gorbalenya, Alexander E.; Baker, Susan C.; Baric, Ralph S.; de Groot, Raoul J.; Drosten, Christian; Gulyaeva, Anastasia A.; Haagmans, Bart L.; Lauber, Chris; Leontovich, Andrey M. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus : classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nature Microbiology. 2020-04, 5 (4): 536–544 [2020-03-03]. ISSN 2058-5276. doi:10.1038/s41564-020-0695-z. (原始内容存档于2020-03-05) (英语). 
  3. ^ Hu, Ben; Zeng, Lei-Ping; Yang, Xing-Lou; Ge, Xing-Yi; Zhang, Wei; Li, Bei; Xie, Jia-Zheng; Shen, Xu-Rui; Zhang, Yun-Zhi. Drosten, Christian , 编. Discovery of a rich gene pool of bat SARS-related coronaviruses provides new insights into the origin of SARS coronavirus. PLOS Pathogens. 2017-11-30, 13 (11): e1006698 [2021-04-07]. ISSN 1553-7374. PMC 5708621可免费查阅. PMID 29190287. doi:10.1371/journal.ppat.1006698. (原始内容存档于2020-07-31) (英语). 
  4. ^ Lam, Tommy Tsan-Yuk; Shum, Marcus Ho-Hin; Zhu, Hua-Chen; Tong, Yi-Gang; Ni, Xue-Bing; Liao, Yun-Shi; Wei, Wei; Cheung, William Yiu-Man; Li, Wen-Juan. Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China. bioRxiv. 2020-02-18: 2020.02.13.945485 [2020-02-20]. doi:10.1101/2020.02.13.945485. (原始内容存档于2021-01-16) (英语). 
  5. ^ Liu, Ping; Chen, Wu; Chen, Jin-Ping. Viral Metagenomics Revealed Sendai Virus and Coronavirus Infection of Malayan Pangolins (Manis javanica). Viruses. 2019/11, 11 (11): 979 [2020-02-20]. PMC 6893680可免费查阅. PMID 31652964. doi:10.3390/v11110979. (原始内容存档于2021-01-14) (英语). 
  6. ^ 新冠溯源:世卫要求复查意大利早期样本. 德国之声. 2021-06-02 [2021-06-11]. (原始内容存档于2021-06-11). 
  7. ^ Kim Y, Son K, Kim YS, Lee SY, Jheong W, Oem JK. Complete genome analysis of a SARS-like bat coronavirus identified in the Republic of Korea.. Virus Genes. 2019, 55 (4): 545–549. PMC 7089380可免费查阅. PMID 31076983. doi:10.1007/s11262-019-01668-w. 
  8. ^ 8.0 8.1 Li, W. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005, 310 (5748): 676–679. ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391. 
  9. ^ 9.0 9.1 Xing‐Yi Ge, Ben Hu, and Zheng‐Li Shi. BAT CORONAVIRUSES. Lin-Fa Wang and Christopher Cowled (编). Bats and Viruses: A New Frontier of Emerging Infectious Diseases, First Edition.. John Wiley & Sons. 2015. 
  10. ^ He B, Zhang Y, Xu L, Yang W, Yang F, Feng Y; 等. Identification of diverse alphacoronaviruses and genomic characterization of a novel severe acute respiratory syndrome-like coronavirus from bats in China.. J Virol. 2014, 88 (12): 7070–82. PMC 4054348可免费查阅. PMID 24719429. doi:10.1128/JVI.00631-14. 
  11. ^ 11.0 11.1 Lau, Susanna K. P.; Feng, Yun; Chen, Honglin; Luk, Hayes K. H.; Yang, Wei-Hong; Li, Kenneth S. M.; Zhang, Yu-Zhen; Huang, Yi; 等. Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) Coronavirus ORF8 Protein Is Acquired from SARS-Related Coronavirus from Greater Horseshoe Bats through Recombination. Journal of Virology. 2015, 89 (20): 10532–10547. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01048-15. 
  12. ^ 12.0 12.1 Xing-Yi Ge; Jia-Lu Li; Xing-Lou Yang; 等. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013, 503 (7477): 535–8. Bibcode:2013Natur.503..535G. PMC 5389864可免费查阅. PMID 24172901. doi:10.1038/nature12711. 
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  14. ^ 14.0 14.1 Wacharapluesadee S, Tan CW, Maneeorn P, Duengkae P, Zhu F, Joyjinda Y, 等. Evidence for SARS-CoV-2 related coronaviruses circulating in bats and pangolins in Southeast Asia. Nature Communications. February 2021, 12 (1): 972. PMC 7873279可免费查阅. PMID 33563978. doi:10.1038/s41467-021-21240-1可免费查阅. 
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  16. ^ Murakami, Shin; Kitamura, Tomoya; Suzuki, Jin; Sato, Ryouta; Aoi, Toshiki; Fujii, Marina; Matsugo, Hiromichi; Kamiki, Haruhiko; Ishida, Hiroho; Takenaka-Uema, Akiko; Shimojima, Masayuki; Horimoto, Taisuke. Detection and Characterization of Bat Sarbecovirus Phylogenetically Related to SARS-CoV-2, Japan. Emerging Infectious Diseases. 2020, 26 (12): 3025–3029. ISSN 1080-6040. doi:10.3201/eid2612.203386. 
  17. ^ 17.0 17.1 Hu, Dan; Zhu, Changqiang; Ai, Lele; He, Ting; Wang, Yi; Ye, Fuqiang; Yang, Lu; Ding, Chenxi; Zhu, Xuhui; Lv, Ruicheng; Zhu, Jin; Hassan, Bachar; Feng, Youjun; Tan, Weilong; Wang, Changjun. Genomic characterization and infectivity of a novel SARS-like coronavirus in Chinese bats. Emerging Microbes & Infections. 2018, 7 (1): 1–10. ISSN 2222-1751. doi:10.1038/s41426-018-0155-5. 
  18. ^ 18.0 18.1 Lam, Tommy Tsan-Yuk; 等. Identifying SARS-CoV-2-related coronaviruses in Malayan pangolins. Nature. 2020, 583 (7815): 282–285. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-020-2169-0. 
  19. ^ Zhou, Hong; Chen, Xing; Hu, Tao; Li, Juan; Song, Hao; Liu, Yanran; Wang, Peihan; Liu, Di; Yang, Jing; Holmes, Edward C.; Hughes, Alice C.; Bi, Yuhai; Shi, Weifeng. A Novel Bat Coronavirus Closely Related to SARS-CoV-2 Contains Natural Insertions at the S1/S2 Cleavage Site of the Spike Protein. Current Biology. 2020, 30 (11): 2196–2203.e3. ISSN 0960-9822. doi:10.1016/j.cub.2020.05.023. 
  20. ^ Zhou, Peng; Yang, Xing-Lou; Wang, Xian-Guang; Hu, Ben; Zhang, Lei; Zhang, Wei; Si, Hao-Rui; Zhu, Yan; 等. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin. Nature. 2020, 579 (7798): 270–273. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/s41586-020-2012-7. 

来源[编辑]

外部連結[编辑]

参见[编辑]