1. 外交部 部长:陈毅(兼) 2. 国防部 部长:林彪(兼) 3. 国家计划委员会 主任:李富春(兼) 4. 国家经济委员会 主任:薄一波(兼) 5. 国家科学技术委员会 主任:聂荣臻(兼) 6. 公安部 部长:谢富治(兼) 7. 内务部 部长:曾山 8. 民族事务委员会 主任:乌兰夫(兼) 9. 农业部 部长:廖鲁言(至1966年5月由江一真代理) 10. 农垦部 部长:王震 11. 林业部 部长:刘文辉 12. 水产部 部长:許德珩 13. 冶金工业部 部长:吕东 14. 化学工业部 部长:高扬 15. 第一机械工业部 部长:段君毅 16. 第二机械工业部 部长:刘杰 17. 第三机械工业部 部长:孙志远 18. 第四机械工业部 部长:王诤 19. 第五机械工业部 部长:邱创成 20. 第六机械工业部 部长:方强 21. 第七机械工业部 部长:王秉璋 22. 第八机械工业部 部长:陳正人 23. 煤炭工业部 部长:张霖之 24. 石油化学工业部 部长:余秋里 25. 水利电力部 部长:傅作义 26. 地质部 部长:李四光
27. 建筑工程部 部长:李人俊 后拆分为: 建筑工程部 部长:刘裕民 建筑材料工业部 部长:赖际发 28. 纺织工业部 部长:蒋光鼐 29. 轻工业部 部长:李烛尘 30. 铁道部 部长:吕正操 31. 交通部 部长:孙大光 32. 邮电部 部长:朱學範 33. 物资管理部 部长:袁宝华 34. 劳动部 部长:马文瑞 35. 财政部 部长:李先念 36. 粮食部 部长:沙千里 37. 商业部 部长:姚依林 38. 对外贸易部 部长:叶季壮 39. 文化部 部长:陆定一 40. 教育部 部长:何伟 41. 高等教育部 部长:蒋南翔 42. 卫生部 部长:钱信忠 43. 体育运动委员会 主任:贺龙(兼) 44. 对外文化联络委员会 主任:张奚若 45. 对外经济联络委员会 主任:方毅(兼) 46. 华侨事务委员会 主任:廖承志 47. 第二轻工业部 部长:徐运北 48. 国家基本建设委员会 主任:谷牧