祁秉忠(1573年—1622年),明朝官員,青海西寧人,祁世勛的兒子。
萬曆十九年(1591年),襲任指揮同知。萬曆四十四年(1616年)為永昌參將。蒙古的銀定歹青率領二千餘騎入塞,祁秉忠提兵三百抵禦,轉戰兩晝夜。援軍到達,蒙古軍退走。祁秉忠追還掠奪的人畜,邊人稱頌他。擢升為涼州副總兵,授平羌將軍印。萬曆四十六年(1618年)應詔率士兵赴東北,以功晉升為提督薊遼左都督。經略袁應泰以其智勇推薦他,令他率家丁守蒲河。後來遼陽已被後金所破,天啟二年(1622年),朝廷命他為援剿總兵官,駐防閭陽,援西平,戰死。